More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1507 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1507  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 191 aa  377  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.13 
 
 		 193 aa  173  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.3 
 
 		 199 aa  160  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.16 
 
 		 199 aa  151  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 198 aa  145  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6177  ThiJ/PfpI domain protein  48.63 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.79 
 
 		 228 aa  141  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3383  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.42 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  40.84 
 
 		 198 aa  138  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.27 
 
 		 207 aa  138  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  40.56 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2883  hypothetical protein  41.49 
 
 		 198 aa  135  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00738999  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2427  transcriptional regulator, AraC family  40.43 
 
 		 198 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2901  transcriptional regulator, AraC family; protease  40.43 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2867  transcriptional regulator, AraC family  39.89 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2951  ThiJ/PfpI domain protein  38.46 
 
 		 254 aa  127  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.0783376 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  35.9 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  41.08 
 
 		 218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  37.57 
 
 		 329 aa  124  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  34.36 
 
 		 201 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  38.86 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2656  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.43 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  37.37 
 
 		 196 aa  122  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1334  ThiJ/PfpI  41.8 
 
 		 199 aa  122  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1680  ThiJ/PfpI domain protein  43.59 
 
 		 207 aa  121  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.883371  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1462  ThiJ/PfpI domain protein  39.18 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.38 
 
 		 233 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  39.57 
 
 		 199 aa  115  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.33 
 
 		 210 aa  114  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  42.16 
 
 		 225 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.43 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0079  ThiJ/PfpI domain protein  38.89 
 
 		 239 aa  112  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245604  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 334 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0354  ThiJ/PfpI  37.43 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0471248 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 387 aa  108  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 324 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 322 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2791  ThiJ/PfpI  31.58 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 324 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 324 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  37.82 
 
 		 327 aa  105  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5782  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.78 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639034  hitchhiker  0.00267139 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.92 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  33.71 
 
 		 241 aa  104  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1194  hypothetical protein  33.71 
 
 		 241 aa  104  8e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  35.79 
 
 		 228 aa  104  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 322 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1967  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.8 
 
 		 226 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.428082  normal  0.019614 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0140  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.98 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 322 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  35.83 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  33.71 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  33.71 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2019  ThiJ/PfpI domain protein  44.77 
 
 		 204 aa  101  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  38.3 
 
 		 238 aa  101  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2579  ThiJ/PfpI  33.51 
 
 		 202 aa  101  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  43.68 
 
 		 320 aa  101  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0102  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.51 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  35.68 
 
 		 220 aa  99.4  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  37.29 
 
 		 199 aa  98.6  5e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 321 aa  98.2  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 321 aa  98.2  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  33.51 
 
 		 320 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  37.23 
 
 		 232 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  37.23 
 
 		 242 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  34.76 
 
 		 229 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 321 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  37.23 
 
 		 232 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  37.23 
 
 		 232 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  37.23 
 
 		 242 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  37.23 
 
 		 242 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  37.79 
 
 		 198 aa  95.9  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  37.23 
 
 		 691 aa  94.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  31.22 
 
 		 349 aa  94.7  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  34.22 
 
 		 226 aa  94.4  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3881  transcriptional regulator  34.92 
 
 		 293 aa  94.4  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08527  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14240)  33.33 
 
 		 284 aa  94  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0997255 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  38.1 
 
 		 224 aa  94  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.57 
 
 		 338 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  40.31 
 
 		 323 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1902  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.99 
 
 		 747 aa  93.6  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.310197  hitchhiker  0.00633735 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.42 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  35.43 
 
 		 243 aa  92.8  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 358 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.68 
 
 		 227 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  33.68 
 
 		 227 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.5 
 
 		 224 aa  92  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 320 aa  92  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.68 
 
 		 227 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1856  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 320 aa  92  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922042  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2005  isonitrile hydratase, putative  38.42 
 
 		 228 aa  91.7  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1672  ThiJ/PfpI domain protein  38.42 
 
 		 228 aa  91.7  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.875327 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 346 aa  90.9  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  38.62 
 
 		 369 aa  91.3  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 346 aa  90.9  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.62 
 
 		 369 aa  91.3  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 346 aa  90.9  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 343 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 336 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>