More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5782 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5782  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 206 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639034  hitchhiker  0.00267139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  43.23 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  43.52 
 
 		 205 aa  168  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  41.67 
 
 		 201 aa  165  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0079  ThiJ/PfpI domain protein  45.54 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245604  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  37.5 
 
 		 196 aa  145  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3383  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.94 
 
 		 225 aa  145  6e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2791  ThiJ/PfpI  35.94 
 
 		 194 aa  142  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.1 
 
 		 199 aa  142  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.41 
 
 		 199 aa  142  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1462  ThiJ/PfpI domain protein  40 
 
 		 208 aa  141  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  36.73 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2883  hypothetical protein  35.86 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00738999  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  39.11 
 
 		 349 aa  129  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2901  transcriptional regulator, AraC family; protease  36.87 
 
 		 197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2867  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2427  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 198 aa  126  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2951  ThiJ/PfpI domain protein  33.16 
 
 		 254 aa  125  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.0783376 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  33.84 
 
 		 198 aa  125  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.31 
 
 		 193 aa  125  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2656  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.14 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  39.18 
 
 		 321 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 336 aa  122  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.48 
 
 		 207 aa  121  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.73 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 387 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 322 aa  118  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  40.21 
 
 		 334 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  37.17 
 
 		 327 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 324 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 324 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.58 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.54 
 
 		 338 aa  115  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1615  transcriptional regulator  36.55 
 
 		 333 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  35.75 
 
 		 344 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 329 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3749  transcriptional regulator, AraC family  41.18 
 
 		 320 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0790195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  39.38 
 
 		 319 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4826  transcriptional regulator, AraC family  41.18 
 
 		 320 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  38.92 
 
 		 314 aa  112  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 328 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 322 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 348 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1680  ThiJ/PfpI domain protein  37.63 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.883371  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1967  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.29 
 
 		 226 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.428082  normal  0.019614 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  35.42 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7238  transcriptional regulator  36.92 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402407  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3225  transcriptional regulator, AraC family  39.15 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448526 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 317 aa  109  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 361 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3969  transcriptional regulator, AraC family  36.45 
 
 		 313 aa  108  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  34.03 
 
 		 319 aa  108  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 319 aa  108  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  38.66 
 
 		 338 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  38.95 
 
 		 369 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  38.58 
 
 		 311 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.95 
 
 		 369 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 346 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  38.95 
 
 		 374 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 346 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 346 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  35.75 
 
 		 326 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 326 aa  105  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  37.95 
 
 		 320 aa  105  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  38.02 
 
 		 338 aa  104  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  33.7 
 
 		 334 aa  104  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 334 aa  104  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  36.98 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  35.47 
 
 		 341 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  37.17 
 
 		 349 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  35.94 
 
 		 319 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 331 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  37.76 
 
 		 328 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  36.76 
 
 		 334 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  36.27 
 
 		 334 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  35.27 
 
 		 326 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  39.59 
 
 		 321 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  35.27 
 
 		 326 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 327 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 325 aa  102  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 338 aa  101  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 		 358 aa  101  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  32.99 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1334  ThiJ/PfpI  34.67 
 
 		 199 aa  101  8e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  35.32 
 
 		 312 aa  101  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 285 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3892  transcriptional regulator, AraC family  39.49 
 
 		 332 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 322 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2560  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 		 333 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  30.93 
 
 		 329 aa  99.4  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  36.14 
 
 		 323 aa  99.4  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 321 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 348 aa  99.4  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 321 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 321 aa  98.6  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>