More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1462 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1462  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 		 208 aa  414  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  63.54 
 
 		 205 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3383  ThiJ/PfpI domain-containing protein  54.25 
 
 		 225 aa  210  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  51.74 
 
 		 196 aa  204  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  51.74 
 
 		 201 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1967  ThiJ/PfpI domain-containing protein  59.41 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.428082  normal  0.019614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  50.25 
 
 		 201 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0079  ThiJ/PfpI domain protein  55.05 
 
 		 239 aa  190  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245604  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2791  ThiJ/PfpI  44.78 
 
 		 194 aa  175  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  43.88 
 
 		 198 aa  171  6.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.5 
 
 		 199 aa  144  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.98 
 
 		 199 aa  141  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5782  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40 
 
 		 206 aa  141  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639034  hitchhiker  0.00267139 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  37.31 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2901  transcriptional regulator, AraC family; protease  38.66 
 
 		 197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2883  hypothetical protein  38.66 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00738999  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2656  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.41 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1680  ThiJ/PfpI domain protein  40 
 
 		 207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.883371  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.12 
 
 		 207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2867  transcriptional regulator, AraC family  37.63 
 
 		 198 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.95 
 
 		 228 aa  128  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2427  transcriptional regulator, AraC family  37.63 
 
 		 198 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  38.46 
 
 		 329 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6177  ThiJ/PfpI domain protein  41.58 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1334  ThiJ/PfpI  40.2 
 
 		 199 aa  122  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.1 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2951  ThiJ/PfpI domain protein  36.22 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.0783376 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  37.11 
 
 		 327 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3881  transcriptional regulator  36.27 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 336 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  33.51 
 
 		 349 aa  110  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.53 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1507  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.29 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 324 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 324 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 324 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  37.63 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  39.06 
 
 		 338 aa  105  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  38.14 
 
 		 327 aa  104  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.58 
 
 		 338 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 344 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  36.08 
 
 		 341 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  35.5 
 
 		 336 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 362 aa  102  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  35.38 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  33.51 
 
 		 319 aa  101  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  34.2 
 
 		 356 aa  101  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 322 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  34.39 
 
 		 334 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 322 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 387 aa  99.4  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2579  ThiJ/PfpI  33.17 
 
 		 202 aa  99.8  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  37.7 
 
 		 320 aa  99.4  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 323 aa  99  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  38.12 
 
 		 333 aa  99  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 331 aa  98.6  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  34.55 
 
 		 329 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  33.16 
 
 		 361 aa  98.2  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2150  transcriptional activator FtrA  32.65 
 
 		 330 aa  98.2  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.077741  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 328 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 321 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 341 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  32.99 
 
 		 327 aa  97.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 321 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 322 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 321 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  33.71 
 
 		 316 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  34.22 
 
 		 321 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 348 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.85 
 
 		 225 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  36.41 
 
 		 349 aa  96.3  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 320 aa  95.9  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 316 aa  95.9  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  38.76 
 
 		 319 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 338 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  36.17 
 
 		 318 aa  95.5  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 		 341 aa  95.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.22 
 
 		 225 aa  95.1  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1615  transcriptional regulator  33.83 
 
 		 333 aa  94.7  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3954  putative transcriptional regulator  32.84 
 
 		 219 aa  94  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 338 aa  94.4  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  36.79 
 
 		 319 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  36.5 
 
 		 334 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  33.33 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  33.51 
 
 		 331 aa  93.6  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2695  transcriptional regulator, AraC family  31.79 
 
 		 344 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  35.5 
 
 		 334 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1760  transcriptional activator FtrA  36.17 
 
 		 318 aa  93.6  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  28.35 
 
 		 358 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 346 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  41.13 
 
 		 318 aa  92.8  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 343 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 320 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  38.34 
 
 		 369 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 321 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 346 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 346 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  39.87 
 
 		 321 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>