More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3414 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  407  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  62.18 
 
 		 198 aa  249  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2791  ThiJ/PfpI  55.67 
 
 		 194 aa  232  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  51.76 
 
 		 201 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  53.27 
 
 		 201 aa  224  6e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  52.33 
 
 		 205 aa  205  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1462  ThiJ/PfpI domain protein  52.28 
 
 		 208 aa  201  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3383  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.67 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 198 aa  168  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1967  ThiJ/PfpI domain-containing protein  49.75 
 
 		 226 aa  167  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.428082  normal  0.019614 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.88 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0079  ThiJ/PfpI domain protein  46.46 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245604  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.88 
 
 		 199 aa  163  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.61 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2883  hypothetical protein  43.68 
 
 		 198 aa  153  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00738999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2901  transcriptional regulator, AraC family; protease  43.92 
 
 		 197 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2656  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.07 
 
 		 198 aa  150  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5782  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.5 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639034  hitchhiker  0.00267139 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1680  ThiJ/PfpI domain protein  41.41 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.883371  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2427  transcriptional regulator, AraC family  42.33 
 
 		 198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6177  ThiJ/PfpI domain protein  42.42 
 
 		 207 aa  144  9e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.62 
 
 		 210 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2867  transcriptional regulator, AraC family  40.74 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.97 
 
 		 228 aa  141  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1334  ThiJ/PfpI  43.88 
 
 		 199 aa  141  5e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2951  ThiJ/PfpI domain protein  38.3 
 
 		 254 aa  139  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.0783376 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  39.47 
 
 		 329 aa  138  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  37.44 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 319 aa  131  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  34.72 
 
 		 198 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 319 aa  124  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 319 aa  121  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.7 
 
 		 193 aa  121  8e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  36.98 
 
 		 331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 322 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 341 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  34.52 
 
 		 349 aa  119  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  32.8 
 
 		 321 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  34.2 
 
 		 336 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.04 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 344 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  38.64 
 
 		 327 aa  116  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  35.94 
 
 		 334 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  34.22 
 
 		 341 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 321 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 324 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 341 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3225  transcriptional regulator, AraC family  36.41 
 
 		 322 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  36.21 
 
 		 356 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 324 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 324 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 331 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  32.98 
 
 		 361 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 316 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.89 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 321 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 321 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5148  AraC family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 328 aa  111  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0642429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.69 
 
 		 233 aa  111  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 348 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  33.86 
 
 		 229 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 336 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  33.69 
 
 		 241 aa  110  9e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 321 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  35.45 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 322 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 357 aa  108  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  32.45 
 
 		 317 aa  108  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  33.86 
 
 		 224 aa  108  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  32.47 
 
 		 362 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.03 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 319 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  31.77 
 
 		 327 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  32.99 
 
 		 334 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  33.86 
 
 		 242 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  33.86 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1194  hypothetical protein  32.62 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.8 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  33.86 
 
 		 242 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  35.23 
 
 		 341 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  32.98 
 
 		 232 aa  106  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  33.86 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  33.86 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  33.86 
 
 		 242 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.86 
 
 		 225 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  33.51 
 
 		 331 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  31.89 
 
 		 312 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  32.49 
 
 		 334 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 325 aa  105  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  33.86 
 
 		 691 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 329 aa  105  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 330 aa  105  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1507  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.37 
 
 		 191 aa  105  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 348 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08527  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14240)  30.15 
 
 		 284 aa  102  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0997255 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  31.05 
 
 		 319 aa  102  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  32.8 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>