More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3383 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3383  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1462  ThiJ/PfpI domain protein  54.29 
 
 		 208 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  51.22 
 
 		 201 aa  198  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  51.22 
 
 		 201 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  50.47 
 
 		 205 aa  193  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  45.67 
 
 		 196 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1967  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.38 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.428082  normal  0.019614 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0079  ThiJ/PfpI domain protein  47.93 
 
 		 239 aa  175  6e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245604  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2791  ThiJ/PfpI  40.98 
 
 		 194 aa  161  9e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  41.46 
 
 		 198 aa  161  9e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.67 
 
 		 199 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5782  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.94 
 
 		 206 aa  145  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639034  hitchhiker  0.00267139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.81 
 
 		 207 aa  144  9e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 198 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.23 
 
 		 199 aa  138  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1680  ThiJ/PfpI domain protein  39.63 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.883371  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1334  ThiJ/PfpI  39.05 
 
 		 199 aa  128  8.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2901  transcriptional regulator, AraC family; protease  34.63 
 
 		 197 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2883  hypothetical protein  35.61 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00738999  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2427  transcriptional regulator, AraC family  34.43 
 
 		 198 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1507  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.94 
 
 		 191 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2951  ThiJ/PfpI domain protein  35.44 
 
 		 254 aa  122  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.0783376 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6177  ThiJ/PfpI domain protein  38.32 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2867  transcriptional regulator, AraC family  34.43 
 
 		 198 aa  122  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  33.66 
 
 		 202 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2656  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.17 
 
 		 198 aa  118  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  34.95 
 
 		 329 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.46 
 
 		 193 aa  115  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.27 
 
 		 210 aa  114  8.999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.28 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.58 
 
 		 338 aa  111  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 348 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  36.49 
 
 		 334 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  36.49 
 
 		 334 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 328 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  37.09 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  35.81 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  37.75 
 
 		 327 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 387 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 322 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  38.54 
 
 		 311 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 319 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  38.54 
 
 		 311 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  35.15 
 
 		 312 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 324 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  35.78 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 322 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 327 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  33.99 
 
 		 317 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  34.31 
 
 		 334 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 336 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  33 
 
 		 319 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  34.98 
 
 		 319 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  33.64 
 
 		 341 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 321 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 321 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  31.68 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.92 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  35.98 
 
 		 331 aa  99  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 324 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 324 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 324 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  34.31 
 
 		 220 aa  98.2  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 315 aa  98.2  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 322 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 338 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 341 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 329 aa  97.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1219  transcriptional regulator  36.97 
 
 		 329 aa  97.8  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  37.62 
 
 		 327 aa  97.8  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  37.75 
 
 		 338 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 358 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0227  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 324 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  39.04 
 
 		 198 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  35.75 
 
 		 319 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  29.46 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  29.46 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  34.8 
 
 		 225 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 323 aa  95.5  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  34.31 
 
 		 238 aa  95.1  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  28.99 
 
 		 241 aa  94.7  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  32.71 
 
 		 336 aa  95.1  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 331 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 321 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  33.82 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1194  hypothetical protein  28.99 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.18 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  35.12 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  31.37 
 
 		 316 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  33.82 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  33.82 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 322 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  29.86 
 
 		 334 aa  93.6  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  33.82 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  33.82 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  33.82 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  31.9 
 
 		 361 aa  93.2  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  33.82 
 
 		 691 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2579  ThiJ/PfpI  31.16 
 
 		 202 aa  93.2  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 348 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>