More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2928 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 
233 aa  483  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  58.17 
 
 
209 aa  275  4e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1194  hypothetical protein  41.59 
 
 
241 aa  206  4e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  41.12 
 
 
241 aa  204  8e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.16 
 
 
207 aa  158  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.01 
 
 
210 aa  150  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  41.62 
 
 
198 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  41.75 
 
 
225 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  40.74 
 
 
218 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.2 
 
 
227 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  40.2 
 
 
227 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  40.11 
 
 
226 aa  143  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.2 
 
 
227 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  38.83 
 
 
228 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.68 
 
 
199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.11 
 
 
224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  39.57 
 
 
224 aa  138  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.66 
 
 
225 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.68 
 
 
199 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  40.31 
 
 
199 aa  135  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  36.46 
 
 
228 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  36.46 
 
 
228 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  38.35 
 
 
238 aa  135  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2883  hypothetical protein  42.25 
 
 
198 aa  134  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00738999  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  37.8 
 
 
242 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  37.8 
 
 
242 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  37.56 
 
 
242 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  37.86 
 
 
232 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  37.86 
 
 
232 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.77 
 
 
198 aa  132  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  39.04 
 
 
220 aa  132  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  37.8 
 
 
691 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  36.06 
 
 
233 aa  131  6.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.6 
 
 
242 aa  131  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  37.63 
 
 
232 aa  131  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2901  transcriptional regulator, AraC family; protease  41.62 
 
 
197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2705  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.25 
 
 
227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2427  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 
198 aa  126  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.81 
 
 
228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  36.84 
 
 
234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.84 
 
 
234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.18 
 
 
227 aa  125  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2579  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.18 
 
 
227 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.32 
 
 
188 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.71 
 
 
225 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  38.69 
 
 
229 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2867  transcriptional regulator, AraC family  39.46 
 
 
198 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  38.3 
 
 
198 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  37.17 
 
 
202 aa  122  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  38.5 
 
 
232 aa  122  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  38.02 
 
 
198 aa  122  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4844  ThiJ/PfpI domain protein  37.23 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.97 
 
 
193 aa  119  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.84 
 
 
234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.84 
 
 
234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  33.33 
 
 
329 aa  118  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  35.05 
 
 
201 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4368  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.23 
 
 
276 aa  118  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  34.98 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3686  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.62 
 
 
239 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2656  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.04 
 
 
198 aa  116  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  36.56 
 
 
243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  34.54 
 
 
201 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08527  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14240)  35.53 
 
 
284 aa  115  7.999999999999999e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0997255 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.3 
 
 
246 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5986  ThiJ/PfpI family protein  41.18 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0549226 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2791  ThiJ/PfpI  32.8 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3391  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.63 
 
 
262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694944  normal  0.106605 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  33.67 
 
 
229 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  33.51 
 
 
231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  37.43 
 
 
212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1680  ThiJ/PfpI domain protein  36.73 
 
 
207 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.883371  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6177  ThiJ/PfpI domain protein  39.8 
 
 
207 aa  111  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  34.69 
 
 
196 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  36.16 
 
 
324 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.48 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  35.48 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2759  ThiJ/PfpI domain protein  36.84 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.64 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.95 
 
 
245 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  30.92 
 
 
349 aa  108  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 
357 aa  108  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  34.74 
 
 
331 aa  108  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2005  isonitrile hydratase, putative  39.04 
 
 
228 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1672  ThiJ/PfpI domain protein  39.04 
 
 
228 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.875327 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1334  ThiJ/PfpI  43.9 
 
 
199 aa  108  9.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0161  ThiJ/PfpI domain protein  34.2 
 
 
214 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0374821  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2643  ThiJ family protein  36.17 
 
 
241 aa  108  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  34.74 
 
 
261 aa  106  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  32.18 
 
 
297 aa  106  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3225  transcriptional regulator, AraC family  38.2 
 
 
322 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.448526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.02 
 
 
231 aa  105  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2887  ThiJ/PfpI  33.69 
 
 
233 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00139108  normal  0.0511878 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2555  twin-arginine translocation pathway signal  34.57 
 
 
285 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  33.51 
 
 
358 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.36 
 
 
338 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  36.46 
 
 
228 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  36.46 
 
 
228 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  33.81 
 
 
205 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2969  ThiJ/PfpI domain protein  34.87 
 
 
205 aa  102  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>