More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0102 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0102  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 227 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0140  ThiJ/PfpI domain-containing protein  80.89 
 
 		 226 aa  384  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3669  ThiJ/PfpI domain-containing protein  64.17 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4082  ThiJ/PfpI domain-containing protein  59.49 
 
 		 237 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2759  ThiJ/PfpI domain protein  43.59 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2139  DJ-1/PfpI family protein  44.33 
 
 		 198 aa  161  6e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  41.75 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2579  ThiJ/PfpI  41.45 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0723  ThiJ/PfpI domain protein  38.66 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286561  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08527  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14240)  35.98 
 
 		 284 aa  126  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0997255 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.61 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.22 
 
 		 207 aa  118  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.83 
 
 		 199 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.32 
 
 		 228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  35.64 
 
 		 199 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2951  ThiJ/PfpI domain protein  34.41 
 
 		 254 aa  109  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.0783376 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  33 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.33 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  33.33 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  32 
 
 		 201 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.59 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.16 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  101  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  33.16 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  33.33 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.79 
 
 		 242 aa  99.8  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0079  ThiJ/PfpI domain protein  31.55 
 
 		 239 aa  98.6  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245604  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  32.2 
 
 		 228 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  32.2 
 
 		 228 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  32.77 
 
 		 220 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.98 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0965747 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  35.39 
 
 		 320 aa  95.5  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  31.79 
 
 		 198 aa  95.5  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.06 
 
 		 210 aa  94.7  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.97 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  32.97 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.97 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  33.69 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.8 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  34.43 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.33 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  31.44 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  32.97 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  31.05 
 
 		 242 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  31.05 
 
 		 242 aa  92.4  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2867  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 198 aa  92  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  30.96 
 
 		 198 aa  92.4  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  31.05 
 
 		 242 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6177  ThiJ/PfpI domain protein  33.84 
 
 		 207 aa  92  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  31.87 
 
 		 232 aa  91.7  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  31.87 
 
 		 232 aa  91.7  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  31.87 
 
 		 232 aa  91.7  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2883  hypothetical protein  35.48 
 
 		 198 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00738999  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2427  transcriptional regulator, AraC family  35.16 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  32.98 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  31.05 
 
 		 691 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.69 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  32.79 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0469  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.22 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  28.49 
 
 		 329 aa  90.1  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.97 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  31.87 
 
 		 228 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2656  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.52 
 
 		 198 aa  89.4  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2791  ThiJ/PfpI  27 
 
 		 194 aa  89.7  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2019  ThiJ/PfpI domain protein  36.13 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  29.57 
 
 		 319 aa  89.4  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  30.51 
 
 		 238 aa  88.6  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  30.11 
 
 		 317 aa  88.2  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 321 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 321 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 321 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4844  ThiJ/PfpI domain protein  33.87 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4368  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.51 
 
 		 276 aa  87  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  31 
 
 		 334 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 357 aa  86.7  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2969  ThiJ/PfpI domain protein  31.28 
 
 		 205 aa  86.3  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  31 
 
 		 334 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4265  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.95 
 
 		 251 aa  85.5  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0161  ThiJ/PfpI domain protein  31.32 
 
 		 214 aa  85.5  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0374821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  32.97 
 
 		 245 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.97 
 
 		 245 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1507  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.51 
 
 		 191 aa  85.1  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  32.42 
 
 		 229 aa  84.7  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  30.65 
 
 		 205 aa  85.1  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2901  transcriptional regulator, AraC family; protease  34.62 
 
 		 197 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1680  ThiJ/PfpI domain protein  32.82 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.883371  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1462  ThiJ/PfpI domain protein  28.5 
 
 		 208 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.97 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.81 
 
 		 188 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3383  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.37 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  30.98 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  31.69 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3391  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.67 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694944  normal  0.106605 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  31.69 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  30.89 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10051  hypothetical protein  35.07 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>