More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2579 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2579  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 
227 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2705  ThiJ/PfpI domain-containing protein  98.68 
 
 
227 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  89.43 
 
 
227 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  89.43 
 
 
227 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  89.43 
 
 
227 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  86.34 
 
 
227 aa  364  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5986  ThiJ/PfpI family protein  89.87 
 
 
227 aa  363  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0549226 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  70.48 
 
 
691 aa  334  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  70.48 
 
 
232 aa  334  7e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  70.48 
 
 
232 aa  334  7e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  70.48 
 
 
242 aa  333  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  70.04 
 
 
232 aa  332  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  70.48 
 
 
242 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  70.04 
 
 
242 aa  332  3e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  72.22 
 
 
238 aa  324  6e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  64.25 
 
 
228 aa  298  6e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  64.22 
 
 
226 aa  276  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  63.55 
 
 
224 aa  271  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  62.27 
 
 
224 aa  270  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  58.74 
 
 
225 aa  260  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  60.36 
 
 
225 aa  258  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  56.16 
 
 
233 aa  249  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2005  isonitrile hydratase, putative  60.39 
 
 
228 aa  245  3e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1672  ThiJ/PfpI domain protein  60.39 
 
 
228 aa  245  3e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.875327 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  56.64 
 
 
229 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  55.5 
 
 
220 aa  241  7e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  56.44 
 
 
234 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4230  hypothetical protein  54.22 
 
 
232 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2887  ThiJ/PfpI  55.07 
 
 
233 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00139108  normal  0.0511878 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  48.5 
 
 
228 aa  221  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  48.5 
 
 
228 aa  221  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4315  ThiJ/PfpI domain protein  54.84 
 
 
232 aa  221  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.63 
 
 
234 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  51.63 
 
 
234 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.84 
 
 
242 aa  211  7.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50 
 
 
225 aa  209  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  48.56 
 
 
231 aa  208  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  52.23 
 
 
231 aa  203  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2555  twin-arginine translocation pathway signal  51.52 
 
 
285 aa  201  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1474  ThiJ/PfpI domain-containing protein  53.4 
 
 
232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  51.72 
 
 
232 aa  197  7.999999999999999e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  54.59 
 
 
229 aa  197  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  52.36 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  51.01 
 
 
228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  51.01 
 
 
228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4332  ThiJ/PfpI  51.38 
 
 
239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2643  ThiJ family protein  50.75 
 
 
241 aa  196  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  52.83 
 
 
232 aa  194  9e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4844  ThiJ/PfpI domain protein  49.5 
 
 
242 aa  191  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2847  ThiJ/PfpI family protein  48.58 
 
 
276 aa  191  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00201065  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4368  ThiJ/PfpI domain-containing protein  49.5 
 
 
276 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6949  ThiJ/PfpI family protein  49.49 
 
 
238 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0470534  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3686  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.98 
 
 
239 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.5 
 
 
231 aa  176  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5977  ThiJ/PfpI  47.11 
 
 
228 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40 
 
 
234 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40 
 
 
234 aa  174  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  45.32 
 
 
243 aa  172  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3391  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.5 
 
 
262 aa  171  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694944  normal  0.106605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  44.97 
 
 
245 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.97 
 
 
245 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.97 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.25 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0965747 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  44.66 
 
 
212 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0050  ThiJ/PfpI domain protein  41.13 
 
 
279 aa  159  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2391  ThiJ/PfpI domain protein  48.91 
 
 
201 aa  159  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4536  DJ-1/PfpI family protein  50.24 
 
 
261 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.45 
 
 
246 aa  156  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2879  ThiJ/PfpI  52.6 
 
 
201 aa  155  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1653  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50 
 
 
240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4131  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.39 
 
 
277 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.19 
 
 
249 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.32 
 
 
231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6260  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.81 
 
 
284 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5955  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.29 
 
 
284 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  39.89 
 
 
209 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.18 
 
 
233 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4265  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130601  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7236  ThiJ/PfpI family protein  39.51 
 
 
326 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0671264 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.54 
 
 
207 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.39 
 
 
210 aa  135  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.35 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.492617 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4724  twin-arginine translocation pathway signal  38.35 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.35 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043204  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  40.61 
 
 
198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0161  ThiJ/PfpI domain protein  41.71 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0374821  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2244  ThiJ/PfpI domain protein  43.41 
 
 
222 aa  132  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121957  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0777  putative isonitrile hydratase  44.83 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  38.42 
 
 
233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1771  DJ-1/PfpI family protein  44.33 
 
 
232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0688  putative isonitrile hydratase  44.33 
 
 
246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2029  putative isonitrile hydratase  45.83 
 
 
255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0761  DJ-1/PfpI family protein  45.83 
 
 
255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1054  DJ-1/PfpI family protein  45.83 
 
 
255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2062  DJ-1/PfpI family protein  45.83 
 
 
636 aa  128  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.595101  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0469  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.84 
 
 
226 aa  128  8.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  40.62 
 
 
218 aa  128  9.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  35.14 
 
 
241 aa  126  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1194  hypothetical protein  35.68 
 
 
241 aa  124  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  42.71 
 
 
199 aa  121  9e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>