More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3384 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3395  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 218 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3384  ThiJ/PfpI  100 
 
 		 218 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3446  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 218 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.458276 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0090  ThiJ/PfpI domain-containing protein  60.19 
 
 		 235 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0093  ThiJ/PfpI domain-containing protein  60.77 
 
 		 239 aa  238  6.999999999999999e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5406  ThiJ/PfpI domain protein  54.17 
 
 		 205 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.491106  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1594  ThiJ/PfpI domain protein  43.78 
 
 		 203 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157689 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3203  thiJ/pfpI family protein  42.65 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0422011  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2917  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.18 
 
 		 199 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00401507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2967  thiJ/pfpI family protein  41.23 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.166092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3192  thiJ/pfpI family protein  41.23 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.322775  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3606  ThiJ/PfpI domain protein  43.28 
 
 		 197 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2064  thiJ/pfpI family protein  40.28 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1677  ThiJ/PfpI domain protein  39.32 
 
 		 198 aa  112  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2969  ThiJ/PfpI domain protein  38.25 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1729  ThiJ/PfpI domain protein  37.28 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0297105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  37.81 
 
 		 243 aa  88.2  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  36.63 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5150  hypothetical protein  61.04 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.68 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  36.87 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.87 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.87 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1679  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain-like protein  33.33 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000121782  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  36 
 
 		 245 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36 
 
 		 245 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  35.18 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36 
 
 		 245 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  36.87 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.67 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.34 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  33.17 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  31.16 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.9 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  42.59 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.22 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.17 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2244  ThiJ/PfpI domain protein  33.81 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121957  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  35.47 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  25.94 
 
 		 202 aa  72  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  35.53 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.53 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2019  ThiJ/PfpI domain protein  37.32 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  35.35 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  32.51 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  35.5 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  35.5 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  36.36 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1577  ThiJ/PfpI  36.59 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.14 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  36.36 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.42 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  36.36 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  36.36 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  36.36 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0159  transcriptional regulator  30.81 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  36.36 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0161  ThiJ/PfpI domain protein  34.34 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0374821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  32 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4265  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.99 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  31.75 
 
 		 313 aa  68.2  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0170  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 327 aa  68.2  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  30.73 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  35.86 
 
 		 691 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2391  ThiJ/PfpI domain protein  43.4 
 
 		 201 aa  68.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5056  transcriptional regulator, AraC family  33.17 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0278301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.44 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0079  ThiJ/PfpI domain protein  34.43 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245604  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.31 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3131  transcription regulator  37.23 
 
 		 303 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  34.33 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.79 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  29.95 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  38.14 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4371  transcriptional regulator, AraC family  42.55 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107025  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2168  transcriptional regulator, AraC family  46.24 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 346 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6949  ThiJ/PfpI family protein  44.71 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0470534  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1194  hypothetical protein  23.74 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.74 
 
 		 188 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  30.05 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.16 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  35.71 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  23.23 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  28.91 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1615  transcriptional regulator  29.7 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  29.33 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  30.7 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.96 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  33.5 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  40.82 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  34.13 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  39.81 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.81 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5828  AraC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>