207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1679 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1679  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain-like protein  100 
 
 		 194 aa  381  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000121782  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1594  ThiJ/PfpI domain protein  40.98 
 
 		 203 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157689 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2917  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.96 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00401507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2064  thiJ/pfpI family protein  35.78 
 
 		 199 aa  101  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3203  thiJ/pfpI family protein  34.8 
 
 		 199 aa  98.6  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0422011  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2967  thiJ/pfpI family protein  35.47 
 
 		 199 aa  97.8  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.166092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3192  thiJ/pfpI family protein  35.47 
 
 		 199 aa  97.8  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.322775  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3606  ThiJ/PfpI domain protein  36.27 
 
 		 197 aa  96.3  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1677  ThiJ/PfpI domain protein  36.82 
 
 		 198 aa  95.1  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2969  ThiJ/PfpI domain protein  39.41 
 
 		 205 aa  90.5  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3384  ThiJ/PfpI  33.33 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3446  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.33 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.458276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3395  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.33 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0093  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.02 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0090  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.49 
 
 		 235 aa  74.7  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447064 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1729  ThiJ/PfpI domain protein  33.78 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0297105  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  32.14 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5406  ThiJ/PfpI domain protein  34.31 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.491106  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  39.81 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5782  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.5 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639034  hitchhiker  0.00267139 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.15 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 337 aa  54.7  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 285 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  42.53 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3131  transcription regulator  31.37 
 
 		 303 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  30.9 
 
 		 333 aa  52.4  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  34.13 
 
 		 329 aa  52  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2471  transcriptional regulator, AraC family  40.82 
 
 		 327 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1270  transcriptional regulator  25.42 
 
 		 334 aa  51.2  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 316 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2168  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 320 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1506  AraC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 345 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570084  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6323  AraC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 345 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  44.16 
 
 		 327 aa  50.1  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7695  transcriptional regulator  27.98 
 
 		 324 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 387 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.4 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.04 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 311 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 311 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  29.47 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6981  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 345 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0671274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  33.91 
 
 		 330 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 320 aa  49.7  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  31.72 
 
 		 321 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  34.74 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 332 aa  49.3  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 332 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 336 aa  48.9  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 315 aa  49.3  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0354  ThiJ/PfpI  27.27 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0471248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  42.53 
 
 		 344 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  32.02 
 
 		 333 aa  48.5  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 326 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 326 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  41.11 
 
 		 225 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 326 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.16 
 
 		 225 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 326 aa  48.1  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 325 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  27.32 
 
 		 336 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  38.28 
 
 		 328 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4813  transcriptional regulator, AraC family  32.97 
 
 		 325 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0342905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  41.57 
 
 		 348 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2879  ThiJ/PfpI  36.8 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4371  transcriptional regulator, AraC family  33.77 
 
 		 307 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107025  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 338 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 343 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4511  transcriptional regulator, AraC family  38.16 
 
 		 339 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.64274 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 329 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 326 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2399  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 324 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 327 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1937  transcriptional regulator, AraC family  43.42 
 
 		 331 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  26.83 
 
 		 334 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.6 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  33.6 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.6 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0170  AraC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 327 aa  46.2  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1655  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.58 
 
 		 332 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  30.89 
 
 		 310 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5075  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 326 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3166  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 312 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5202  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 312 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0605893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5828  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 312 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  36.36 
 
 		 229 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1857  AraC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 338 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  36.59 
 
 		 321 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.47 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  30.85 
 
 		 326 aa  45.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  38.64 
 
 		 332 aa  45.4  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5233  AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 349 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3514  transcriptional regulator  35.83 
 
 		 334 aa  45.1  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505982  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2950  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 305 aa  45.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410029  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  38.95 
 
 		 326 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0049  transcriptional regulator, AraC family  33.1 
 
 		 322 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.41 
 
 		 231 aa  45.1  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  35.56 
 
 		 261 aa  45.1  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  41.18 
 
 		 226 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>