More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0093 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0093  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 239 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0090  ThiJ/PfpI domain-containing protein  94.04 
 
 		 235 aa  427  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3395  ThiJ/PfpI domain-containing protein  60.77 
 
 		 218 aa  238  8e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3384  ThiJ/PfpI  60.77 
 
 		 218 aa  238  8e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3446  ThiJ/PfpI domain-containing protein  60.77 
 
 		 218 aa  238  8e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.458276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5406  ThiJ/PfpI domain protein  49.53 
 
 		 205 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.491106  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1594  ThiJ/PfpI domain protein  40.47 
 
 		 203 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157689 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3606  ThiJ/PfpI domain protein  38.79 
 
 		 197 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1677  ThiJ/PfpI domain protein  37.44 
 
 		 198 aa  105  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2969  ThiJ/PfpI domain protein  34.72 
 
 		 205 aa  103  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2064  thiJ/pfpI family protein  33.33 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2967  thiJ/pfpI family protein  33.33 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.166092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3192  thiJ/pfpI family protein  33.33 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.322775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2917  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.54 
 
 		 199 aa  98.6  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00401507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3203  thiJ/pfpI family protein  32.86 
 
 		 199 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0422011  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1729  ThiJ/PfpI domain protein  35.93 
 
 		 227 aa  93.2  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0297105  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08527  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14240)  29.61 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0997255 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  34.95 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0170  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  37.25 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  35.96 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.96 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.96 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  32.84 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  36.95 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  34.67 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1679  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain-like protein  33.02 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000121782  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  36.95 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  36.95 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  36.95 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  36.95 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  36.95 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2244  ThiJ/PfpI domain protein  33.94 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121957  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  36.95 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  36.95 
 
 		 691 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.63 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3131  transcription regulator  37.95 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  28.71 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2168  transcriptional regulator, AraC family  36.62 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4131  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.64 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  33.33 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  29.26 
 
 		 349 aa  72.4  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5828  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 312 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  33.82 
 
 		 226 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1856  transcriptional regulator, AraC family  31.75 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922042  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  38.1 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  31.47 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  29.67 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  31.47 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.52 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  33 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  31.22 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  30.92 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.22 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  31.86 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.55 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  37.82 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.82 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1194  hypothetical protein  25.48 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  40.21 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.02 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5782  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.96 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639034  hitchhiker  0.00267139 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  27.45 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  32.31 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0050  ThiJ/PfpI domain protein  31.34 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.35 
 
 		 224 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  25.38 
 
 		 241 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.85 
 
 		 225 aa  67  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0500  ThiJ/PfpI domain protein  29.61 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.95 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5150  hypothetical protein  48.05 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4371  transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107025  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  32.16 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  30.69 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  37.88 
 
 		 339 aa  65.5  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4265  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.42 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3225  transcriptional regulator, AraC family  38.21 
 
 		 322 aa  65.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.46 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1844  transcriptional regulator, AraC family  40.59 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  33.12 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  26.75 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  30.2 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.61 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  32.09 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  34.52 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7238  transcriptional regulator  29.76 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402407  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  27.78 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4365  AraC family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  40.62 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2759  ThiJ/PfpI domain protein  29.13 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>