More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5406 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5406  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 		 205 aa  384  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.491106  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3384  ThiJ/PfpI  54.17 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3395  ThiJ/PfpI domain-containing protein  54.17 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3446  ThiJ/PfpI domain-containing protein  54.17 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.458276 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0093  ThiJ/PfpI domain-containing protein  49.53 
 
 		 239 aa  154  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0090  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.82 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447064 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1594  ThiJ/PfpI domain protein  39.44 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157689 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3203  thiJ/pfpI family protein  37.68 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0422011  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2917  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.2 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00401507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2967  thiJ/pfpI family protein  36.89 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.166092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3192  thiJ/pfpI family protein  36.89 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.322775  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1677  ThiJ/PfpI domain protein  41.06 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3606  ThiJ/PfpI domain protein  39.8 
 
 		 197 aa  104  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2064  thiJ/pfpI family protein  36.41 
 
 		 199 aa  104  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1729  ThiJ/PfpI domain protein  36.49 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0297105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5150  hypothetical protein  59.21 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  33.69 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2969  ThiJ/PfpI domain protein  35.92 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0050  ThiJ/PfpI domain protein  34.85 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4131  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.53 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  36.61 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  34 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  33.69 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  31.07 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  34.54 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.22 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1679  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain-like protein  34.31 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000121782  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  49.41 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2019  ThiJ/PfpI domain protein  36.36 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  36.46 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  42.05 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.57 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  35.57 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  50 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  48.75 
 
 		 691 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  37.75 
 
 		 347 aa  69.3  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0159  transcriptional regulator  29.02 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2168  transcriptional regulator, AraC family  37.76 
 
 		 320 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  26.73 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  48.75 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  48.75 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  48.75 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  48.75 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  48.75 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  48.75 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  35.18 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  33.68 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  33.68 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.01 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5782  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.33 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639034  hitchhiker  0.00267139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  39.13 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  34.05 
 
 		 329 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6949  ThiJ/PfpI family protein  32.31 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0470534  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2579  ThiJ/PfpI  34.59 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.73 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  32.99 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  28.5 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0469  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.68 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  29.7 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  27.6 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0161  ThiJ/PfpI domain protein  29.76 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0374821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4315  ThiJ/PfpI domain protein  34.27 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.99 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4371  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 307 aa  65.1  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107025  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3131  transcription regulator  34.74 
 
 		 303 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  34.01 
 
 		 243 aa  64.7  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0102  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.2 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0079  ThiJ/PfpI domain protein  35.12 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245604  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.65 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.18 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1194  hypothetical protein  27.08 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  28.33 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  34.39 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  29.35 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.35 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.63 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  34.22 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 333 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2555  twin-arginine translocation pathway signal  33.16 
 
 		 285 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10051  hypothetical protein  38.71 
 
 		 187 aa  62  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.33 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1474  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.6 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  32.12 
 
 		 325 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  41.77 
 
 		 327 aa  61.2  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0140  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.19 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.99 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.96 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3391  ThiJ/PfpI domain-containing protein  53.42 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694944  normal  0.106605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>