More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1729 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1729  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 		 227 aa  439  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0297105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1594  ThiJ/PfpI domain protein  46.05 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157689 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3606  ThiJ/PfpI domain protein  49.29 
 
 		 197 aa  167  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1677  ThiJ/PfpI domain protein  49.77 
 
 		 198 aa  166  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2969  ThiJ/PfpI domain protein  48.6 
 
 		 205 aa  165  5e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2967  thiJ/pfpI family protein  37.21 
 
 		 199 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.166092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3192  thiJ/pfpI family protein  37.21 
 
 		 199 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.322775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2917  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.14 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00401507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2064  thiJ/pfpI family protein  38.14 
 
 		 199 aa  132  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3203  thiJ/pfpI family protein  37.67 
 
 		 199 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0422011  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3395  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.28 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3384  ThiJ/PfpI  37.28 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3446  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.28 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.458276 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  29.55 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2244  ThiJ/PfpI domain protein  36.65 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121957  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.17 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0090  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.36 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447064 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  36.73 
 
 		 245 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.73 
 
 		 245 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  30.41 
 
 		 228 aa  95.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  30.41 
 
 		 228 aa  95.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  33.33 
 
 		 201 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  34.96 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.46 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0093  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.93 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.77 
 
 		 246 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  34.96 
 
 		 212 aa  92.8  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.64 
 
 		 228 aa  92.4  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  33.62 
 
 		 243 aa  90.9  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 198 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.26 
 
 		 338 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1462  ThiJ/PfpI domain protein  34.88 
 
 		 208 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.19 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.33 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  31.02 
 
 		 201 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  33.18 
 
 		 316 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  30.26 
 
 		 233 aa  89.4  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  33.8 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.88 
 
 		 207 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  32.73 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  33.19 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  32.29 
 
 		 199 aa  87  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2168  transcriptional regulator, AraC family  36.07 
 
 		 320 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  32.89 
 
 		 232 aa  85.9  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  32.89 
 
 		 232 aa  85.9  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  32.89 
 
 		 232 aa  85.9  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  32.89 
 
 		 242 aa  85.9  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0049  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 322 aa  85.5  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1680  ThiJ/PfpI domain protein  37.33 
 
 		 207 aa  85.5  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.883371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  32.89 
 
 		 242 aa  85.5  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  32.89 
 
 		 242 aa  85.5  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0170  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 327 aa  85.5  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.33 
 
 		 199 aa  85.1  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  32.72 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  33.49 
 
 		 691 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  36.79 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.18 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2759  ThiJ/PfpI domain protein  30.77 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.14 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  34.76 
 
 		 362 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  32.72 
 
 		 312 aa  81.6  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  35.75 
 
 		 338 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.77 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  32.11 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.05 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2791  ThiJ/PfpI  29.68 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  31.11 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  36.96 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4522  AraC family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0983647  decreased coverage  0.00465183 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3952  transcriptional regulator  51.65 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.292576  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4724  twin-arginine translocation pathway signal  32.16 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.16 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0161  ThiJ/PfpI domain protein  32.11 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0374821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 		 334 aa  79  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 321 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  33.33 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  34.06 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  34.72 
 
 		 323 aa  79  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 387 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  44.86 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.36 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  36.53 
 
 		 320 aa  79  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  35.62 
 
 		 334 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 336 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.72 
 
 		 284 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  32.44 
 
 		 361 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  32.74 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7236  ThiJ/PfpI family protein  32.16 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0671264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  31.08 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  30.37 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  30.56 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>