More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3669 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3669  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 241 aa  493  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0140  ThiJ/PfpI domain-containing protein  64.17 
 
 		 226 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0102  ThiJ/PfpI domain-containing protein  64.17 
 
 		 227 aa  315  5e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4082  ThiJ/PfpI domain-containing protein  54.96 
 
 		 237 aa  268  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2759  ThiJ/PfpI domain protein  47.47 
 
 		 211 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2139  DJ-1/PfpI family protein  42.35 
 
 		 198 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  43.81 
 
 		 199 aa  154  1e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2579  ThiJ/PfpI  43.59 
 
 		 202 aa  151  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08527  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14240)  37.66 
 
 		 284 aa  138  7.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0997255 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0723  ThiJ/PfpI domain protein  36.87 
 
 		 199 aa  132  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.59 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.8 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.23 
 
 		 193 aa  115  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.78 
 
 		 207 aa  113  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.02 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  36.02 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.41 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0965747 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.74 
 
 		 199 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  34.03 
 
 		 202 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  35.36 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.62 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  35.08 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  37.85 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.8 
 
 		 249 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.68 
 
 		 199 aa  99  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  36.84 
 
 		 245 aa  99  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.84 
 
 		 245 aa  99  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0469  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.97 
 
 		 226 aa  98.2  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.32 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  35.03 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  34.87 
 
 		 212 aa  96.3  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  28.28 
 
 		 329 aa  96.3  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.51 
 
 		 210 aa  95.9  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6177  ThiJ/PfpI domain protein  34.52 
 
 		 207 aa  95.5  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  33.02 
 
 		 218 aa  95.5  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.16 
 
 		 224 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  36.16 
 
 		 224 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  34.07 
 
 		 238 aa  95.1  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  34.07 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.11 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  34.07 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  34.07 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  34.07 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  34.07 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  34.07 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  34.07 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4265  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.99 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  34.07 
 
 		 691 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2969  ThiJ/PfpI domain protein  34.87 
 
 		 205 aa  92.8  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  31.07 
 
 		 228 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  31.07 
 
 		 228 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  32.8 
 
 		 233 aa  90.9  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.61 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0079  ThiJ/PfpI domain protein  32 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245604  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 322 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2951  ThiJ/PfpI domain protein  30.56 
 
 		 254 aa  90.1  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.0783376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  32.47 
 
 		 225 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06760  conserved hypothetical protein  29.38 
 
 		 234 aa  89.4  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130038  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 198 aa  89  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.43 
 
 		 225 aa  89  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1653  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.6 
 
 		 240 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 328 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 331 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2019  ThiJ/PfpI domain protein  37.57 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  38.29 
 
 		 320 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.42 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  37.06 
 
 		 198 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 322 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  32.42 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.42 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  32.42 
 
 		 228 aa  87  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 324 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 324 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  28.64 
 
 		 198 aa  86.3  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3686  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.77 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.77 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  29.74 
 
 		 349 aa  85.9  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  32.97 
 
 		 196 aa  85.9  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.77 
 
 		 234 aa  85.5  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 348 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  33.7 
 
 		 232 aa  85.1  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 324 aa  85.1  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.32 
 
 		 198 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  29 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 361 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.07 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  32.98 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  29.79 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2244  ThiJ/PfpI domain protein  32.81 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121957  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  32.77 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  35.33 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.26 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.88 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.45 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  31.22 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  35.26 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  30.89 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>