More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1802 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1802  putative transcription regulator protein  100 
 
 		 224 aa  454  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0437387 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0320  putative transcription regulator protein  47.93 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.330928  normal  0.565016 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2960  ThiJ/PfpI  43.24 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  40.69 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  40.69 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  39.05 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4230  hypothetical protein  38.73 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4368  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40 
 
 		 276 aa  135  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4844  ThiJ/PfpI domain protein  40 
 
 		 242 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.25 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.25 
 
 		 234 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.52 
 
 		 242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3686  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.25 
 
 		 239 aa  128  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2887  ThiJ/PfpI  38.05 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00139108  normal  0.0511878 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  39.71 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  38.5 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  39.9 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.57 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0965747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  40.2 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  38.38 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  38.92 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  38.92 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  38.24 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.71 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.76 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  38.92 
 
 		 232 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  38.24 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  38.92 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  36.76 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  38.92 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  38.92 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.76 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.57 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  39.61 
 
 		 691 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  38.42 
 
 		 238 aa  122  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4332  ThiJ/PfpI  40.95 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2555  twin-arginine translocation pathway signal  37.75 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  38.42 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.44 
 
 		 225 aa  118  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  36.14 
 
 		 229 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  37.62 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2847  ThiJ/PfpI family protein  35.47 
 
 		 276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00201065  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  37.32 
 
 		 234 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.32 
 
 		 234 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.38 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.6 
 
 		 284 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492617 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3391  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.32 
 
 		 262 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694944  normal  0.106605 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2643  ThiJ family protein  35.61 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4724  twin-arginine translocation pathway signal  34.45 
 
 		 284 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.45 
 
 		 284 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043204  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  36.5 
 
 		 241 aa  112  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1194  hypothetical protein  35.68 
 
 		 241 aa  111  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  34.63 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  34.63 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  37.56 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1474  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.12 
 
 		 232 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.32 
 
 		 227 aa  108  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5955  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.12 
 
 		 284 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6260  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.12 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.84 
 
 		 199 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4315  ThiJ/PfpI domain protein  36.45 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2705  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.28 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7236  ThiJ/PfpI family protein  32.7 
 
 		 326 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0671264 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.65 
 
 		 233 aa  105  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  37.25 
 
 		 212 aa  105  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2579  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.8 
 
 		 227 aa  104  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.83 
 
 		 232 aa  104  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  36.82 
 
 		 198 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  34.98 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6949  ThiJ/PfpI family protein  34.63 
 
 		 238 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0470534  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 357 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0050  ThiJ/PfpI domain protein  33.5 
 
 		 279 aa  102  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.3 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.67 
 
 		 199 aa  99.4  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.5 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.5 
 
 		 228 aa  99  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  32.37 
 
 		 336 aa  97.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4536  DJ-1/PfpI family protein  37.14 
 
 		 261 aa  97.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2005  isonitrile hydratase, putative  36.95 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  34.67 
 
 		 329 aa  97.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1672  ThiJ/PfpI domain protein  36.95 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.875327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  32.7 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4131  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.59 
 
 		 277 aa  97.4  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 209 aa  97.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  31.86 
 
 		 243 aa  96.7  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.31 
 
 		 245 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  36.41 
 
 		 316 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  34.31 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.31 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.1 
 
 		 249 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2391  ThiJ/PfpI domain protein  41.32 
 
 		 201 aa  95.9  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  30.39 
 
 		 202 aa  95.5  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 198 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  32.55 
 
 		 362 aa  93.6  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.58 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.84 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  32 
 
 		 199 aa  92.8  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 351 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  36.06 
 
 		 323 aa  92  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>