More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3042 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3042  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  100 
 
 
341 aa  687    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2633  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  90.21 
 
 
338 aa  619  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3224  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  52.82 
 
 
319 aa  309  4e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00529527  normal  0.234301 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0006  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  37.5 
 
 
332 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.194545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0003  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  37.5 
 
 
332 aa  226  6e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00458868  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4446  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.31 
 
 
311 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1107  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.46 
 
 
315 aa  219  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0028  Ribosylpyrimidine nucleosidase  37.65 
 
 
323 aa  217  2.9999999999999998e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0564  Ribosylpyrimidine nucleosidase  36.49 
 
 
311 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0934  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.92 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0837501  normal  0.0202173 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1558  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.64 
 
 
313 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274753  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1804  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.48 
 
 
311 aa  211  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.327684 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4001  purine nucleosidase  40.48 
 
 
315 aa  210  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.454014  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2914  nucleoside hydrolase  36.34 
 
 
313 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1971  IUNH family nucleoside hydrolase  36.36 
 
 
326 aa  208  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.260258  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0448  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  37.13 
 
 
314 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2260  IUNH family nucleoside hydrolase  36.89 
 
 
326 aa  205  9e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0778  ribonucleoside hydrolase 1  36.39 
 
 
311 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0704  ribonucleoside hydrolase 1  36.09 
 
 
311 aa  202  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1178  ribonucleoside hydrolase 1  35.91 
 
 
313 aa  202  8e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0201  ribosylpyrimidine nucleosidase  35.71 
 
 
309 aa  202  8e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0765  ribonucleoside hydrolase 1  35.8 
 
 
311 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0814  ribonucleoside hydrolase 1  36.09 
 
 
311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0081  purine nucleosidase  35.22 
 
 
356 aa  200  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0050  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.63 
 
 
314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000041602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0220  nonspecific ribonucleoside hydrolase  34.73 
 
 
350 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0743  ribonucleoside hydrolase 1  35.21 
 
 
311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01760  nonspecific ribonucleoside hydrolase  34.43 
 
 
329 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000285671  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0679  ribonucleoside hydrolase 1  34.42 
 
 
311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1652  purine nucleosidase  39.16 
 
 
316 aa  196  5.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.197736 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0598  ribonucleoside hydrolase 1  35.21 
 
 
311 aa  196  5.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0696  ribonucleoside hydrolase 1  34.12 
 
 
311 aa  196  6e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3626  Ribosylpyrimidine nucleosidase  31.83 
 
 
308 aa  196  7e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00617  ribonucleoside hydrolase 1  34.91 
 
 
311 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2975  Purine nucleosidase  34.91 
 
 
311 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2994  ribonucleoside hydrolase 1  34.12 
 
 
311 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00606  hypothetical protein  34.91 
 
 
311 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0185  Purine nucleosidase  38.05 
 
 
355 aa  195  9e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1158  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.02 
 
 
318 aa  195  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0672  ribonucleoside hydrolase 1  34.91 
 
 
311 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4396  purine nucleosidase  35.22 
 
 
314 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0528  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  31.45 
 
 
327 aa  193  4e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1210  ribonucleoside hydrolase 1  31.91 
 
 
310 aa  192  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.178079  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0718  ribonucleoside hydrolase 1  34.91 
 
 
311 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.647996  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1049  ribonucleoside hydrolase 1  35.03 
 
 
312 aa  192  9e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0319  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  38.54 
 
 
312 aa  191  2e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182819 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3900  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.57 
 
 
308 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.637254  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0877  ribonucleoside hydrolase 1  31.56 
 
 
314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.197182  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0009  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.85 
 
 
321 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.377078  normal  0.0385761 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0017  Ribosylpyrimidine nucleosidase  35.23 
 
 
317 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3178  ribonucleoside hydrolase 1  34.82 
 
 
318 aa  187  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2117  Ribosylpyrimidine nucleosidase  33.67 
 
 
310 aa  187  3e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04420  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  34.72 
 
 
313 aa  186  6e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0009  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.44 
 
 
314 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140534 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0647  ribonucleoside hydrolase 1  35.33 
 
 
318 aa  186  7e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3734  Ribosylpyrimidine nucleosidase  35.77 
 
 
310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0832  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.32 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0017  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.56 
 
 
317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03052  hypothetical protein  37.64 
 
 
322 aa  183  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2618  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.7 
 
 
316 aa  183  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.568847  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3770  ribonucleoside hydrolase 1  36.15 
 
 
318 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3476  ribonucleoside hydrolase 1  35.33 
 
 
318 aa  183  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0759  inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  35.23 
 
 
328 aa  182  6e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.486217  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2460  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.34 
 
 
322 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237882  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3230  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.69 
 
 
333 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.618451 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3306  ribonucleoside hydrolase 1  35.03 
 
 
318 aa  182  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0811  ribonucleoside hydrolase 1  34.43 
 
 
318 aa  182  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1962  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.23 
 
 
335 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00495918  normal  0.0351342 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1120  ribonucleoside hydrolase 1  34.63 
 
 
312 aa  181  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0660  ribonucleoside hydrolase 1  35.81 
 
 
318 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3647  ribonucleoside hydrolase 1  35.81 
 
 
318 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410931  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2587  ribosylpyrimidine nucleosidase  35.42 
 
 
313 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361439  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1840  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.26 
 
 
314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.94695  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3579  ribonucleoside hydrolase 1  35.81 
 
 
318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1122  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.23 
 
 
324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1925  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.23 
 
 
342 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103421  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3408  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.45 
 
 
324 aa  179  9e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0697  ribonucleoside hydrolase 1  32.52 
 
 
335 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1010  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.06 
 
 
324 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0940  ribonucleoside hydrolase 1  33.63 
 
 
311 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.019412  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0768  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.4 
 
 
305 aa  177  3e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.933184  normal  0.0267075 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1863  ribonucleoside hydrolase 1  33.93 
 
 
322 aa  176  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.742774  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2617  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.67 
 
 
322 aa  176  6e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.82375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0018  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.73 
 
 
335 aa  176  7e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1526  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.23 
 
 
349 aa  175  9e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.458985  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2373  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.04 
 
 
341 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.138595  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0577  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  33.04 
 
 
318 aa  175  9.999999999999999e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.113372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4897  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.01 
 
 
346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562799  normal  0.0360004 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0018  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.61 
 
 
322 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2680  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.15 
 
 
322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4253  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.43 
 
 
322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4382  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.17 
 
 
321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4026  ribonucleoside hydrolase 1  32.13 
 
 
310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.494882  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2157  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.04 
 
 
341 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000654385  normal  0.648077 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2548  putative inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase transmembrane protein  36.58 
 
 
351 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3486  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.13 
 
 
333 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1443  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.67 
 
 
317 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.52753  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3659  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.89 
 
 
313 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.121445  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1442  Ribosylpyrimidine nucleosidase  36.07 
 
 
316 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3859  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.91 
 
 
322 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000304796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>