More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2587 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2587  ribosylpyrimidine nucleosidase  100 
 
 		 313 aa  622  1e-177  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0185  Purine nucleosidase  49.84 
 
 		 355 aa  299  4e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4396  purine nucleosidase  50.16 
 
 		 314 aa  297  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0081  purine nucleosidase  48.86 
 
 		 356 aa  291  7e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00617  ribonucleoside hydrolase 1  50.5 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2975  Purine nucleosidase  50.5 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0598  ribonucleoside hydrolase 1  50.5 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0743  ribonucleoside hydrolase 1  50.5 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00606  hypothetical protein  50.5 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2994  ribonucleoside hydrolase 1  50.17 
 
 		 311 aa  288  9e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0679  ribonucleoside hydrolase 1  50.17 
 
 		 311 aa  288  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0696  ribonucleoside hydrolase 1  49.83 
 
 		 311 aa  287  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0672  ribonucleoside hydrolase 1  49.83 
 
 		 311 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04420  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  48.73 
 
 		 313 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0778  ribonucleoside hydrolase 1  48.39 
 
 		 311 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0704  ribonucleoside hydrolase 1  48.39 
 
 		 311 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0319  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  48.09 
 
 		 312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182819 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0765  ribonucleoside hydrolase 1  48.06 
 
 		 311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0564  Ribosylpyrimidine nucleosidase  48.03 
 
 		 311 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1178  ribonucleoside hydrolase 1  48.55 
 
 		 313 aa  282  5.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0814  ribonucleoside hydrolase 1  48.06 
 
 		 311 aa  282  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0718  ribonucleoside hydrolase 1  48.71 
 
 		 311 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.647996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3626  Ribosylpyrimidine nucleosidase  45.87 
 
 		 308 aa  275  8e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1107  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  48.88 
 
 		 315 aa  269  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4026  ribonucleoside hydrolase 1  46.3 
 
 		 310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.494882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6548  Ribosylpyrimidine nucleosidase  47.1 
 
 		 312 aa  266  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1558  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  48.53 
 
 		 313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1049  ribonucleoside hydrolase 1  47.1 
 
 		 312 aa  264  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2117  Ribosylpyrimidine nucleosidase  43.14 
 
 		 310 aa  263  3e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2914  nucleoside hydrolase  47.88 
 
 		 313 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1981  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  46.1 
 
 		 313 aa  262  6.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.842213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1863  ribonucleoside hydrolase 1  45.42 
 
 		 322 aa  261  8e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.742774  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1120  ribonucleoside hydrolase 1  45.45 
 
 		 312 aa  259  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0697  ribonucleoside hydrolase 1  44.55 
 
 		 335 aa  257  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3178  ribonucleoside hydrolase 1  45.45 
 
 		 318 aa  256  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0647  ribonucleoside hydrolase 1  43.97 
 
 		 318 aa  255  5e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3476  ribonucleoside hydrolase 1  43.97 
 
 		 318 aa  256  5e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3306  ribonucleoside hydrolase 1  43.97 
 
 		 318 aa  255  8e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0940  ribonucleoside hydrolase 1  45.48 
 
 		 311 aa  252  7e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.019412  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0877  ribonucleoside hydrolase 1  41.72 
 
 		 314 aa  251  8.000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.197182  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0811  ribonucleoside hydrolase 1  44.63 
 
 		 318 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1804  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  46.62 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.327684 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0201  ribosylpyrimidine nucleosidase  44.16 
 
 		 309 aa  249  5e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1210  ribonucleoside hydrolase 1  43.04 
 
 		 310 aa  249  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.178079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3647  ribonucleoside hydrolase 1  44.3 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410931  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0660  ribonucleoside hydrolase 1  44.3 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3770  ribonucleoside hydrolase 1  44.3 
 
 		 318 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3579  ribonucleoside hydrolase 1  43.97 
 
 		 318 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4446  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  43.73 
 
 		 311 aa  239  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1496  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  43.29 
 
 		 313 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0365306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2459  ribonucleoside hydrolase 2  43.29 
 
 		 313 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2298  ribonucleoside hydrolase 2  42.95 
 
 		 313 aa  237  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3298  ribonucleoside hydrolase 2  42.95 
 
 		 313 aa  238  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0466718  normal  0.0924764 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1486  ribonucleoside hydrolase 2  42.95 
 
 		 313 aa  237  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0358178  hitchhiker  0.000862517 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4001  purine nucleosidase  44.87 
 
 		 315 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.454014  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2309  ribonucleoside hydrolase 2  42.95 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.19142  hitchhiker  0.000812735 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1158  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  45.45 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0006  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  43.09 
 
 		 332 aa  236  4e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.194545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0003  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  43.09 
 
 		 332 aa  236  4e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00458868  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02091  ribonucleoside hydrolase 2  42.62 
 
 		 313 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02050  hypothetical protein  42.62 
 
 		 313 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3734  Ribosylpyrimidine nucleosidase  39.67 
 
 		 310 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0028  Ribosylpyrimidine nucleosidase  41.98 
 
 		 323 aa  232  7.000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3104  twin-arginine translocation pathway signal  44.66 
 
 		 350 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5263  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  44.66 
 
 		 350 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1652  purine nucleosidase  46.25 
 
 		 316 aa  229  6e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.197736 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5010  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  44.34 
 
 		 350 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4624  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  44.34 
 
 		 350 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0386  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  44.34 
 
 		 357 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0934  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  45.02 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0837501  normal  0.0202173 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0228  purine nucleosidase  39.8 
 
 		 311 aa  226  4e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0234  purine nucleosidase  39.8 
 
 		 311 aa  226  4e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5150  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  44.01 
 
 		 350 aa  225  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2548  putative inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase transmembrane protein  44.01 
 
 		 351 aa  223  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3659  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  41.91 
 
 		 313 aa  222  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.121445  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0009  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  45.02 
 
 		 321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.377078  normal  0.0385761 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0050  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  44.05 
 
 		 314 aa  218  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000041602 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0009  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  44.37 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140534 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0448  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  43.51 
 
 		 314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1819  ribonucleoside hydrolase RihC  40.85 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0753  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.92 
 
 		 310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00064946  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0642  ribonucleoside hydrolase RihC  39.16 
 
 		 302 aa  209  7e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0188198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0220  nonspecific ribonucleoside hydrolase  39.94 
 
 		 350 aa  205  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0832  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.1 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01760  nonspecific ribonucleoside hydrolase  39.29 
 
 		 329 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000285671  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0055  ribonucleoside hydrolase RihC  42.71 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.845766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0056  ribonucleoside hydrolase RihC  42.71 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.594312  normal  0.222927 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0056  ribonucleoside hydrolase RihC  42.71 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.696065 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0017  Ribosylpyrimidine nucleosidase  37.34 
 
 		 317 aa  199  6e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0058  ribonucleoside hydrolase RihC  42.71 
 
 		 306 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0017  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.02 
 
 		 317 aa  199  7e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1443  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.19 
 
 		 317 aa  198  7.999999999999999e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.52753  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0672  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.1 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0552  ribonucleoside hydrolase RihC  41.69 
 
 		 305 aa  192  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1442  Ribosylpyrimidine nucleosidase  36.93 
 
 		 316 aa  189  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0057  ribonucleoside hydrolase RihC  41.16 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.342327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1526  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.86 
 
 		 349 aa  186  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.458985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2617  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.46 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.82375  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0651  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  41.99 
 
 		 321 aa  183  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1192  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.39 
 
 		 328 aa  183  3e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.414955  normal  0.114378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>