More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0552 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0552  ribonucleoside hydrolase RihC  100 
 
 		 305 aa  625  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0058  ribonucleoside hydrolase RihC  79.14 
 
 		 306 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0057  ribonucleoside hydrolase RihC  79.14 
 
 		 306 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.342327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0055  ribonucleoside hydrolase RihC  77.48 
 
 		 306 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.845766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0056  ribonucleoside hydrolase RihC  77.48 
 
 		 306 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.696065 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0056  ribonucleoside hydrolase RihC  77.48 
 
 		 306 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.594312  normal  0.222927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0028  ribonucleoside hydrolase RihC  76.49 
 
 		 304 aa  449  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00034  ribonucleoside hydrolase 3  75.58 
 
 		 304 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00939814  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3569  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  76.16 
 
 		 304 aa  442  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0032  ribonucleoside hydrolase RihC  75.58 
 
 		 304 aa  441  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0032  ribonucleoside hydrolase RihC  76.16 
 
 		 304 aa  442  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0034  ribonucleoside hydrolase RihC  76.16 
 
 		 304 aa  441  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00033  hypothetical protein  75.75 
 
 		 303 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00634591  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0030  ribonucleoside hydrolase RihC  75.83 
 
 		 304 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.719928  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0672  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  53.87 
 
 		 306 aa  322  5e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1819  ribonucleoside hydrolase RihC  53.33 
 
 		 306 aa  309  2.9999999999999997e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0642  ribonucleoside hydrolase RihC  47.45 
 
 		 302 aa  268  7e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0188198  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0344  ribonucleoside hydrolase RihC  46.94 
 
 		 315 aa  268  1e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1192  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  47.8 
 
 		 328 aa  265  5e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.414955  normal  0.114378 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0102  ribonucleoside hydrolase RihC  47.95 
 
 		 302 aa  262  4.999999999999999e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000159714  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0797  ribonucleoside hydrolase RihC  44.82 
 
 		 310 aa  246  4.9999999999999997e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0129973  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0154  ribonucleoside hydrolase RihC  42.66 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4026  ribonucleoside hydrolase 1  43 
 
 		 310 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.494882  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0697  ribonucleoside hydrolase 1  44.26 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1210  ribonucleoside hydrolase 1  45.25 
 
 		 310 aa  235  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.178079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0558  inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  40.33 
 
 		 317 aa  231  1e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000277639  hitchhiker  0.000000766068 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0718  ribonucleoside hydrolase 1  44.26 
 
 		 311 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.647996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0598  ribonucleoside hydrolase 1  45.12 
 
 		 311 aa  230  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0679  ribonucleoside hydrolase 1  44.78 
 
 		 311 aa  229  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0743  ribonucleoside hydrolase 1  44.78 
 
 		 311 aa  230  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00617  ribonucleoside hydrolase 1  44.78 
 
 		 311 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2975  Purine nucleosidase  44.78 
 
 		 311 aa  229  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00606  hypothetical protein  44.78 
 
 		 311 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1863  ribonucleoside hydrolase 1  43.75 
 
 		 322 aa  229  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.742774  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2994  ribonucleoside hydrolase 1  44.78 
 
 		 311 aa  229  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0647  ribonucleoside hydrolase 1  43.55 
 
 		 318 aa  229  5e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0696  ribonucleoside hydrolase 1  44.44 
 
 		 311 aa  229  6e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1981  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  44.85 
 
 		 313 aa  228  7e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.842213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3476  ribonucleoside hydrolase 1  44.19 
 
 		 318 aa  228  8e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0940  ribonucleoside hydrolase 1  44.22 
 
 		 311 aa  228  9e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.019412  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0672  ribonucleoside hydrolase 1  44.78 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3306  ribonucleoside hydrolase 1  43.55 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0811  ribonucleoside hydrolase 1  43.61 
 
 		 318 aa  226  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6548  Ribosylpyrimidine nucleosidase  41.72 
 
 		 312 aa  225  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1178  ribonucleoside hydrolase 1  44.12 
 
 		 313 aa  225  8e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1461  inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  39.2 
 
 		 303 aa  225  9e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0704  ribonucleoside hydrolase 1  43.28 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1049  ribonucleoside hydrolase 1  43.92 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3178  ribonucleoside hydrolase 1  44.26 
 
 		 318 aa  223  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0765  ribonucleoside hydrolase 1  42.95 
 
 		 311 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1120  ribonucleoside hydrolase 1  44.34 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0814  ribonucleoside hydrolase 1  42.67 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0778  ribonucleoside hydrolase 1  42.95 
 
 		 311 aa  221  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0660  ribonucleoside hydrolase 1  44.07 
 
 		 318 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3770  ribonucleoside hydrolase 1  44.41 
 
 		 318 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3647  ribonucleoside hydrolase 1  44.07 
 
 		 318 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410931  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3579  ribonucleoside hydrolase 1  43.73 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3734  Ribosylpyrimidine nucleosidase  40.13 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0753  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.03 
 
 		 310 aa  211  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00064946  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0201  ribosylpyrimidine nucleosidase  42.66 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0028  Ribosylpyrimidine nucleosidase  41.04 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2587  ribosylpyrimidine nucleosidase  41.69 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0877  ribonucleoside hydrolase 1  39.14 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.197182  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2307  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.67 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1496  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.16 
 
 		 313 aa  199  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0365306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2459  ribonucleoside hydrolase 2  39.16 
 
 		 313 aa  199  6e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2298  ribonucleoside hydrolase 2  38.83 
 
 		 313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1486  ribonucleoside hydrolase 2  38.83 
 
 		 313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0358178  hitchhiker  0.000862517 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2309  ribonucleoside hydrolase 2  38.83 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.19142  hitchhiker  0.000812735 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4446  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  41.31 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3626  Ribosylpyrimidine nucleosidase  39.27 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3298  ribonucleoside hydrolase 2  38.83 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0466718  normal  0.0924764 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02091  ribonucleoside hydrolase 2  38.51 
 
 		 313 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02050  hypothetical protein  38.51 
 
 		 313 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0006  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  41.31 
 
 		 332 aa  195  8.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.194545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0003  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  41.31 
 
 		 332 aa  195  8.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00458868  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2914  nucleoside hydrolase  40.33 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1107  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.98 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1558  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.33 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0234  purine nucleosidase  40.82 
 
 		 311 aa  192  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0228  purine nucleosidase  40.82 
 
 		 311 aa  192  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5010  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.76 
 
 		 350 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3104  twin-arginine translocation pathway signal  40.45 
 
 		 350 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5263  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.45 
 
 		 350 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1652  purine nucleosidase  42.07 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.197736 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0319  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  41.72 
 
 		 312 aa  191  2e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182819 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4624  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.76 
 
 		 350 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2117  Ribosylpyrimidine nucleosidase  38.11 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0386  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  41.46 
 
 		 357 aa  188  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5150  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  41.14 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1804  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  41.33 
 
 		 311 aa  186  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.327684 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0564  Ribosylpyrimidine nucleosidase  38.46 
 
 		 311 aa  186  4e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3659  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.67 
 
 		 313 aa  186  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.121445  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2548  putative inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase transmembrane protein  40.86 
 
 		 351 aa  186  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4001  purine nucleosidase  40.85 
 
 		 315 aa  185  9e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.454014  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0934  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  41.23 
 
 		 313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0837501  normal  0.0202173 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28400  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  40 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01760  nonspecific ribonucleoside hydrolase  40.32 
 
 		 329 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000285671  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0220  nonspecific ribonucleoside hydrolase  40 
 
 		 350 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04420  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  40.07 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>