More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0228 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0234  purine nucleosidase  100 
 
 
311 aa  639    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0228  purine nucleosidase  100 
 
 
311 aa  639    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4026  ribonucleoside hydrolase 1  49.04 
 
 
310 aa  279  6e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.494882  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3476  ribonucleoside hydrolase 1  50.32 
 
 
318 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1049  ribonucleoside hydrolase 1  48.72 
 
 
312 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0647  ribonucleoside hydrolase 1  50 
 
 
318 aa  271  7e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0201  ribosylpyrimidine nucleosidase  45.98 
 
 
309 aa  271  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3306  ribonucleoside hydrolase 1  50 
 
 
318 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3647  ribonucleoside hydrolase 1  49.52 
 
 
318 aa  269  5e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410931  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0660  ribonucleoside hydrolase 1  49.52 
 
 
318 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0811  ribonucleoside hydrolase 1  49.04 
 
 
318 aa  268  7e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3770  ribonucleoside hydrolase 1  49.52 
 
 
318 aa  268  8e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1120  ribonucleoside hydrolase 1  48.24 
 
 
312 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3579  ribonucleoside hydrolase 1  49.2 
 
 
318 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3178  ribonucleoside hydrolase 1  48.24 
 
 
318 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0940  ribonucleoside hydrolase 1  47.94 
 
 
311 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.019412  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1863  ribonucleoside hydrolase 1  47.4 
 
 
322 aa  263  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.742774  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0564  Ribosylpyrimidine nucleosidase  43.23 
 
 
311 aa  261  1e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0697  ribonucleoside hydrolase 1  48.05 
 
 
335 aa  261  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1178  ribonucleoside hydrolase 1  46.33 
 
 
313 aa  258  8e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0814  ribonucleoside hydrolase 1  46.65 
 
 
311 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0704  ribonucleoside hydrolase 1  46.33 
 
 
311 aa  255  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0778  ribonucleoside hydrolase 1  46.33 
 
 
311 aa  255  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0765  ribonucleoside hydrolase 1  46.01 
 
 
311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0028  Ribosylpyrimidine nucleosidase  43.73 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0672  ribonucleoside hydrolase 1  45.37 
 
 
311 aa  252  6e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0718  ribonucleoside hydrolase 1  45.37 
 
 
311 aa  252  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.647996  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00617  ribonucleoside hydrolase 1  45.37 
 
 
311 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2975  Purine nucleosidase  45.37 
 
 
311 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00606  hypothetical protein  45.37 
 
 
311 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0743  ribonucleoside hydrolase 1  45.37 
 
 
311 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0598  ribonucleoside hydrolase 1  45.37 
 
 
311 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0679  ribonucleoside hydrolase 1  45.37 
 
 
311 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0696  ribonucleoside hydrolase 1  45.05 
 
 
311 aa  250  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2994  ribonucleoside hydrolase 1  45.37 
 
 
311 aa  251  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3734  Ribosylpyrimidine nucleosidase  41.67 
 
 
310 aa  248  7e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3626  Ribosylpyrimidine nucleosidase  41.61 
 
 
308 aa  248  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0003  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  44.09 
 
 
332 aa  246  3e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00458868  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0006  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  44.09 
 
 
332 aa  246  4e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.194545  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4446  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  44.09 
 
 
311 aa  246  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0081  purine nucleosidase  43.59 
 
 
356 aa  245  6e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1210  ribonucleoside hydrolase 1  44.41 
 
 
310 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.178079  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6548  Ribosylpyrimidine nucleosidase  43.61 
 
 
312 aa  240  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527968  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04420  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  44.16 
 
 
313 aa  239  4e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0877  ribonucleoside hydrolase 1  43.31 
 
 
314 aa  239  5.999999999999999e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.197182  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4396  purine nucleosidase  43.89 
 
 
314 aa  238  6.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0185  Purine nucleosidase  43.63 
 
 
355 aa  238  8e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02091  ribonucleoside hydrolase 2  40.51 
 
 
313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2117  Ribosylpyrimidine nucleosidase  40.65 
 
 
310 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02050  hypothetical protein  40.51 
 
 
313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2298  ribonucleoside hydrolase 2  40.51 
 
 
313 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1486  ribonucleoside hydrolase 2  40.51 
 
 
313 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0358178  hitchhiker  0.000862517 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2309  ribonucleoside hydrolase 2  40.51 
 
 
313 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.19142  hitchhiker  0.000812735 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1496  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.51 
 
 
313 aa  231  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0365306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2459  ribonucleoside hydrolase 2  40.51 
 
 
313 aa  231  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3298  ribonucleoside hydrolase 2  40.19 
 
 
313 aa  229  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0466718  normal  0.0924764 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0934  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.65 
 
 
313 aa  229  5e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0837501  normal  0.0202173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2587  ribosylpyrimidine nucleosidase  39.8 
 
 
313 aa  226  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361439  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1558  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.45 
 
 
313 aa  225  9e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274753  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1804  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  42.67 
 
 
311 aa  224  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.327684 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1158  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  41.88 
 
 
318 aa  223  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0319  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  40.65 
 
 
312 aa  222  4.9999999999999996e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182819 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1107  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.78 
 
 
315 aa  222  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2914  nucleoside hydrolase  40.13 
 
 
313 aa  222  6e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0050  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  41.8 
 
 
314 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000041602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1981  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.65 
 
 
313 aa  216  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.842213  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4001  purine nucleosidase  40.06 
 
 
315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.454014  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1962  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.7 
 
 
335 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00495918  normal  0.0351342 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0009  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  42.76 
 
 
321 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.377078  normal  0.0385761 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0753  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.54 
 
 
310 aa  209  6e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00064946  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0448  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  41.29 
 
 
314 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1925  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.77 
 
 
342 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103421  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2460  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.03 
 
 
322 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237882  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0009  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.91 
 
 
314 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140534 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3486  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.33 
 
 
333 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3230  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.91 
 
 
333 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.618451 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2373  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.41 
 
 
341 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.138595  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1652  purine nucleosidase  39.14 
 
 
316 aa  200  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.197736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2157  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.41 
 
 
341 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000654385  normal  0.648077 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0017  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.26 
 
 
317 aa  196  5.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0017  Ribosylpyrimidine nucleosidase  38.26 
 
 
317 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0220  nonspecific ribonucleoside hydrolase  35.16 
 
 
350 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1442  Ribosylpyrimidine nucleosidase  36.19 
 
 
316 aa  189  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01760  nonspecific ribonucleoside hydrolase  34.84 
 
 
329 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000285671  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0055  ribonucleoside hydrolase RihC  40.68 
 
 
306 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.845766  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2307  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.49 
 
 
330 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0056  ribonucleoside hydrolase RihC  40.68 
 
 
306 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.594312  normal  0.222927 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0058  ribonucleoside hydrolase RihC  40.68 
 
 
306 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0832  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.42 
 
 
313 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0056  ribonucleoside hydrolase RihC  40.68 
 
 
306 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.696065 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0057  ribonucleoside hydrolase RihC  39.66 
 
 
306 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.342327  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3224  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.62 
 
 
319 aa  179  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00529527  normal  0.234301 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0018  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.67 
 
 
335 aa  178  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0552  ribonucleoside hydrolase RihC  40.27 
 
 
305 aa  178  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3659  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.74 
 
 
313 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.121445  normal  0.165929 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3569  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.59 
 
 
304 aa  176  6e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0030  ribonucleoside hydrolase RihC  38.93 
 
 
304 aa  175  8e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.719928  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0034  ribonucleoside hydrolase RihC  38.93 
 
 
304 aa  175  8e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3104  twin-arginine translocation pathway signal  33.66 
 
 
350 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5263  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.66 
 
 
350 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>