More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0672 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0672  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  100 
 
 		 306 aa  621  1e-177  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1819  ribonucleoside hydrolase RihC  59.15 
 
 		 306 aa  347  1e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1192  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  52.94 
 
 		 328 aa  316  2e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.414955  normal  0.114378 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0552  ribonucleoside hydrolase RihC  53.87 
 
 		 305 aa  300  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0055  ribonucleoside hydrolase RihC  50 
 
 		 306 aa  299  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.845766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0058  ribonucleoside hydrolase RihC  50.67 
 
 		 306 aa  299  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0032  ribonucleoside hydrolase RihC  51.53 
 
 		 304 aa  298  8e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00034  ribonucleoside hydrolase 3  50.85 
 
 		 304 aa  297  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00939814  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3569  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  50.85 
 
 		 304 aa  296  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00033  hypothetical protein  50.85 
 
 		 303 aa  297  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00634591  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0057  ribonucleoside hydrolase RihC  50.67 
 
 		 306 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.342327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0056  ribonucleoside hydrolase RihC  50.68 
 
 		 306 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.594312  normal  0.222927 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0056  ribonucleoside hydrolase RihC  50.68 
 
 		 306 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.696065 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0030  ribonucleoside hydrolase RihC  51.19 
 
 		 304 aa  295  5e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.719928  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0034  ribonucleoside hydrolase RihC  51.19 
 
 		 304 aa  295  6e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0032  ribonucleoside hydrolase RihC  50.51 
 
 		 304 aa  295  9e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0028  ribonucleoside hydrolase RihC  50.17 
 
 		 304 aa  293  4e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0642  ribonucleoside hydrolase RihC  48.34 
 
 		 302 aa  290  3e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0188198  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1461  inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  43.05 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0102  ribonucleoside hydrolase RihC  45.03 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000159714  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0558  inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  42.72 
 
 		 317 aa  249  3e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000277639  hitchhiker  0.000000766068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1981  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  44.19 
 
 		 313 aa  249  5e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.842213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6548  Ribosylpyrimidine nucleosidase  42.77 
 
 		 312 aa  244  9e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1210  ribonucleoside hydrolase 1  44.33 
 
 		 310 aa  241  9e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.178079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1120  ribonucleoside hydrolase 1  46.15 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1049  ribonucleoside hydrolase 1  45.67 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0672  ribonucleoside hydrolase 1  44.82 
 
 		 311 aa  239  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0743  ribonucleoside hydrolase 1  44.82 
 
 		 311 aa  239  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0598  ribonucleoside hydrolase 1  44.82 
 
 		 311 aa  239  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0679  ribonucleoside hydrolase 1  44.82 
 
 		 311 aa  239  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0696  ribonucleoside hydrolase 1  44.82 
 
 		 311 aa  239  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0697  ribonucleoside hydrolase 1  43.23 
 
 		 335 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00617  ribonucleoside hydrolase 1  44.48 
 
 		 311 aa  238  9e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2975  Purine nucleosidase  44.48 
 
 		 311 aa  238  9e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00606  hypothetical protein  44.48 
 
 		 311 aa  238  9e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2994  ribonucleoside hydrolase 1  44.48 
 
 		 311 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0940  ribonucleoside hydrolase 1  44.66 
 
 		 311 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.019412  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0704  ribonucleoside hydrolase 1  45.03 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0765  ribonucleoside hydrolase 1  44.7 
 
 		 311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0814  ribonucleoside hydrolase 1  44.7 
 
 		 311 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0718  ribonucleoside hydrolase 1  44.48 
 
 		 311 aa  232  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.647996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0778  ribonucleoside hydrolase 1  44.7 
 
 		 311 aa  231  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0344  ribonucleoside hydrolase RihC  42.47 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1178  ribonucleoside hydrolase 1  43.71 
 
 		 313 aa  230  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0797  ribonucleoside hydrolase RihC  42.67 
 
 		 310 aa  229  4e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0129973  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0154  ribonucleoside hydrolase RihC  42.32 
 
 		 296 aa  228  8e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4026  ribonucleoside hydrolase 1  42.86 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.494882  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0647  ribonucleoside hydrolase 1  43.52 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3476  ribonucleoside hydrolase 1  43.52 
 
 		 318 aa  223  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3178  ribonucleoside hydrolase 1  43 
 
 		 318 aa  222  7e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0753  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  42.95 
 
 		 310 aa  222  7e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00064946  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3306  ribonucleoside hydrolase 1  43.19 
 
 		 318 aa  222  8e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1863  ribonucleoside hydrolase 1  40.97 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.742774  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0811  ribonucleoside hydrolase 1  43.14 
 
 		 318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3647  ribonucleoside hydrolase 1  43.58 
 
 		 318 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410931  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3579  ribonucleoside hydrolase 1  43.58 
 
 		 318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0660  ribonucleoside hydrolase 1  43.58 
 
 		 318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3770  ribonucleoside hydrolase 1  43.24 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0201  ribosylpyrimidine nucleosidase  39.14 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2914  nucleoside hydrolase  43.52 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1107  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  41.59 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4001  purine nucleosidase  41.61 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.454014  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1558  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  43.52 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0877  ribonucleoside hydrolase 1  39.4 
 
 		 314 aa  202  5e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.197182  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3734  Ribosylpyrimidine nucleosidase  40.13 
 
 		 310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2587  ribosylpyrimidine nucleosidase  37.1 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4396  purine nucleosidase  37.84 
 
 		 314 aa  196  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0319  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  40.47 
 
 		 312 aa  196  5.000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182819 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0386  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.73 
 
 		 357 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0028  Ribosylpyrimidine nucleosidase  36.04 
 
 		 323 aa  195  9e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4624  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5150  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40 
 
 		 350 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3104  twin-arginine translocation pathway signal  37.82 
 
 		 350 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5263  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.82 
 
 		 350 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3298  ribonucleoside hydrolase 2  37.1 
 
 		 313 aa  191  9e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0466718  normal  0.0924764 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0185  Purine nucleosidase  38.82 
 
 		 355 aa  190  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1496  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.77 
 
 		 313 aa  189  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0365306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2459  ribonucleoside hydrolase 2  36.77 
 
 		 313 aa  189  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2307  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.81 
 
 		 330 aa  189  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1486  ribonucleoside hydrolase 2  36.77 
 
 		 313 aa  189  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0358178  hitchhiker  0.000862517 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2298  ribonucleoside hydrolase 2  36.77 
 
 		 313 aa  189  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5010  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.82 
 
 		 350 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2309  ribonucleoside hydrolase 2  36.45 
 
 		 313 aa  188  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.19142  hitchhiker  0.000812735 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02091  ribonucleoside hydrolase 2  36.45 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3626  Ribosylpyrimidine nucleosidase  38.85 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02050  hypothetical protein  36.45 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0017  Ribosylpyrimidine nucleosidase  36.01 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0017  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.01 
 
 		 317 aa  186  6e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0006  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  41.14 
 
 		 332 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.194545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0003  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  41.14 
 
 		 332 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00458868  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0081  purine nucleosidase  37.79 
 
 		 356 aa  182  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1442  Ribosylpyrimidine nucleosidase  35.33 
 
 		 316 aa  182  7e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2548  putative inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase transmembrane protein  38.06 
 
 		 351 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4446  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.8 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1804  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.48 
 
 		 311 aa  179  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.327684 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1158  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40 
 
 		 318 aa  179  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04420  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  36.36 
 
 		 313 aa  179  4.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0564  Ribosylpyrimidine nucleosidase  35.16 
 
 		 311 aa  179  7e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3659  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.47 
 
 		 313 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.121445  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28400  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  34.71 
 
 		 320 aa  175  8e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>