More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1981 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1981  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  100 
 
 
313 aa  641    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.842213  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6548  Ribosylpyrimidine nucleosidase  68.69 
 
 
312 aa  459  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527968  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0697  ribonucleoside hydrolase 1  54.4 
 
 
335 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4026  ribonucleoside hydrolase 1  55.45 
 
 
310 aa  331  8e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.494882  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3476  ribonucleoside hydrolase 1  53.77 
 
 
318 aa  331  8e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0940  ribonucleoside hydrolase 1  53.92 
 
 
311 aa  330  1e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.019412  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0704  ribonucleoside hydrolase 1  53.75 
 
 
311 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3306  ribonucleoside hydrolase 1  53.77 
 
 
318 aa  330  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0647  ribonucleoside hydrolase 1  53.77 
 
 
318 aa  330  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0778  ribonucleoside hydrolase 1  53.75 
 
 
311 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0814  ribonucleoside hydrolase 1  53.75 
 
 
311 aa  329  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1863  ribonucleoside hydrolase 1  53.75 
 
 
322 aa  329  4e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.742774  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1049  ribonucleoside hydrolase 1  54.4 
 
 
312 aa  329  4e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0765  ribonucleoside hydrolase 1  53.42 
 
 
311 aa  328  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0743  ribonucleoside hydrolase 1  53.09 
 
 
311 aa  328  8e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0598  ribonucleoside hydrolase 1  53.09 
 
 
311 aa  328  9e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0672  ribonucleoside hydrolase 1  53.09 
 
 
311 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0679  ribonucleoside hydrolase 1  53.09 
 
 
311 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00617  ribonucleoside hydrolase 1  52.77 
 
 
311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2975  Purine nucleosidase  52.77 
 
 
311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00606  hypothetical protein  52.77 
 
 
311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2994  ribonucleoside hydrolase 1  52.77 
 
 
311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0696  ribonucleoside hydrolase 1  52.44 
 
 
311 aa  326  3e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3178  ribonucleoside hydrolase 1  53.27 
 
 
318 aa  324  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1178  ribonucleoside hydrolase 1  52.32 
 
 
313 aa  322  4e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1120  ribonucleoside hydrolase 1  52.61 
 
 
312 aa  321  8e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3647  ribonucleoside hydrolase 1  53.44 
 
 
318 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410931  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0660  ribonucleoside hydrolase 1  53.44 
 
 
318 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0811  ribonucleoside hydrolase 1  52.77 
 
 
318 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3770  ribonucleoside hydrolase 1  53.11 
 
 
318 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3579  ribonucleoside hydrolase 1  53.11 
 
 
318 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0718  ribonucleoside hydrolase 1  51.47 
 
 
311 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.647996  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1210  ribonucleoside hydrolase 1  50.5 
 
 
310 aa  304  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.178079  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0877  ribonucleoside hydrolase 1  46.75 
 
 
314 aa  278  1e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.197182  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1107  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  46.93 
 
 
315 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0564  Ribosylpyrimidine nucleosidase  45.19 
 
 
311 aa  266  4e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2587  ribosylpyrimidine nucleosidase  46.1 
 
 
313 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361439  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0753  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  43.51 
 
 
310 aa  259  3e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00064946  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1558  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  44.98 
 
 
313 aa  255  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274753  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4001  purine nucleosidase  45.31 
 
 
315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.454014  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2914  nucleoside hydrolase  44.34 
 
 
313 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0028  Ribosylpyrimidine nucleosidase  43.44 
 
 
323 aa  250  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1804  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  45.31 
 
 
311 aa  250  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.327684 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3626  Ribosylpyrimidine nucleosidase  42.67 
 
 
308 aa  250  3e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0672  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  44.19 
 
 
306 aa  249  6e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0201  ribosylpyrimidine nucleosidase  42.81 
 
 
309 aa  245  6e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4446  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  43.37 
 
 
311 aa  242  6e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0006  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  43.37 
 
 
332 aa  240  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.194545  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3734  Ribosylpyrimidine nucleosidase  41.8 
 
 
310 aa  241  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0003  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  43.37 
 
 
332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00458868  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0185  Purine nucleosidase  41.61 
 
 
355 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0319  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  42.44 
 
 
312 aa  235  8e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182819 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3659  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  41.85 
 
 
313 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.121445  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1158  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  42.9 
 
 
318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4396  purine nucleosidase  40.32 
 
 
314 aa  229  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0081  purine nucleosidase  40.66 
 
 
356 aa  229  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1819  ribonucleoside hydrolase RihC  40.32 
 
 
306 aa  229  5e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0934  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  42.9 
 
 
313 aa  225  9e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0837501  normal  0.0202173 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2548  putative inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase transmembrane protein  42.49 
 
 
351 aa  222  7e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0055  ribonucleoside hydrolase RihC  44.82 
 
 
306 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.845766  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0056  ribonucleoside hydrolase RihC  44.82 
 
 
306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.696065 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0056  ribonucleoside hydrolase RihC  44.82 
 
 
306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.594312  normal  0.222927 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04420  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  40.51 
 
 
313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0058  ribonucleoside hydrolase RihC  43.09 
 
 
306 aa  218  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4624  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  42.31 
 
 
350 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0552  ribonucleoside hydrolase RihC  44.85 
 
 
305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3569  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  45.48 
 
 
304 aa  216  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0234  purine nucleosidase  40.65 
 
 
311 aa  216  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0228  purine nucleosidase  40.65 
 
 
311 aa  216  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0032  ribonucleoside hydrolase RihC  45.48 
 
 
304 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0032  ribonucleoside hydrolase RihC  43.73 
 
 
304 aa  215  8e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5150  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  41.99 
 
 
350 aa  215  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0642  ribonucleoside hydrolase RihC  40.38 
 
 
302 aa  215  9e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0188198  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0028  ribonucleoside hydrolase RihC  45.15 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00034  ribonucleoside hydrolase 3  43.41 
 
 
304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00939814  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1496  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.59 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0365306  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0057  ribonucleoside hydrolase RihC  42.77 
 
 
306 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.342327  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2298  ribonucleoside hydrolase 2  38.59 
 
 
313 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1486  ribonucleoside hydrolase 2  38.59 
 
 
313 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0358178  hitchhiker  0.000862517 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2117  Ribosylpyrimidine nucleosidase  39.41 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1652  purine nucleosidase  42.36 
 
 
316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.197736 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2459  ribonucleoside hydrolase 2  38.59 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2309  ribonucleoside hydrolase 2  38.59 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.19142  hitchhiker  0.000812735 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0030  ribonucleoside hydrolase RihC  45.48 
 
 
304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.719928  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00033  hypothetical protein  44.82 
 
 
303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00634591  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0009  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  41.31 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.377078  normal  0.0385761 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0448  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  41.29 
 
 
314 aa  212  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3298  ribonucleoside hydrolase 2  38.26 
 
 
313 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0466718  normal  0.0924764 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3104  twin-arginine translocation pathway signal  41.53 
 
 
350 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5263  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  41.53 
 
 
350 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2307  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.07 
 
 
330 aa  212  7e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0050  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.72 
 
 
314 aa  212  7.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000041602 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0009  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.98 
 
 
314 aa  211  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140534 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02091  ribonucleoside hydrolase 2  38.26 
 
 
313 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02050  hypothetical protein  38.26 
 
 
313 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0034  ribonucleoside hydrolase RihC  45.15 
 
 
304 aa  210  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0017  Ribosylpyrimidine nucleosidase  39.23 
 
 
317 aa  210  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5010  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  41.21 
 
 
350 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0017  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.59 
 
 
317 aa  208  9e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0386  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  41.53 
 
 
357 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>