More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4382 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4382  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  100 
 
 
321 aa  645    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0542  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  69.84 
 
 
329 aa  450  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.488533  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1896  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  46.28 
 
 
311 aa  249  5e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00667656  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0768  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.97 
 
 
305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.933184  normal  0.0267075 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2809  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  42.9 
 
 
319 aa  229  5e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0181966  normal  0.655368 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0061  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.48 
 
 
307 aa  219  3e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1006  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.94 
 
 
312 aa  203  3e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0522631  normal  0.0258769 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1486  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.39 
 
 
311 aa  198  9e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4001  purine nucleosidase  40.87 
 
 
315 aa  192  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.454014  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3900  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.97 
 
 
308 aa  186  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.637254  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1107  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.7 
 
 
315 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0006  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  38.49 
 
 
332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.194545  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4446  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.49 
 
 
311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1158  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.75 
 
 
318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0003  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  38.49 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00458868  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1558  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.97 
 
 
313 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274753  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2914  nucleoside hydrolase  38.39 
 
 
313 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1804  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.13 
 
 
311 aa  179  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.327684 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5150  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.91 
 
 
350 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0934  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.1 
 
 
313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0837501  normal  0.0202173 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0448  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  38.24 
 
 
314 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3042  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.17 
 
 
341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3104  twin-arginine translocation pathway signal  37.94 
 
 
350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5263  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.94 
 
 
350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0050  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.62 
 
 
314 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000041602 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0386  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.94 
 
 
357 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4624  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.94 
 
 
350 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5010  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.62 
 
 
350 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02361  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  37.33 
 
 
312 aa  169  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1962  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.26 
 
 
335 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00495918  normal  0.0351342 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2157  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.62 
 
 
341 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000654385  normal  0.648077 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2633  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.52 
 
 
338 aa  168  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2373  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.3 
 
 
341 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.138595  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3486  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.98 
 
 
333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2460  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.3 
 
 
322 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237882  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1925  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.06 
 
 
342 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103421  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3230  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.98 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.618451 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1178  ribonucleoside hydrolase 1  33.44 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0009  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.42 
 
 
321 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.377078  normal  0.0385761 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0564  Ribosylpyrimidine nucleosidase  35.67 
 
 
311 aa  161  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0028  Ribosylpyrimidine nucleosidase  35.69 
 
 
323 aa  161  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0201  ribosylpyrimidine nucleosidase  35.02 
 
 
309 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0672  ribonucleoside hydrolase 1  33.55 
 
 
311 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0814  ribonucleoside hydrolase 1  33.23 
 
 
311 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0220  nonspecific ribonucleoside hydrolase  34.73 
 
 
350 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2994  ribonucleoside hydrolase 1  33.55 
 
 
311 aa  159  6e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0696  ribonucleoside hydrolase 1  33.55 
 
 
311 aa  159  7e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0679  ribonucleoside hydrolase 1  33.55 
 
 
311 aa  159  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2548  putative inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase transmembrane protein  35.74 
 
 
351 aa  159  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00617  ribonucleoside hydrolase 1  33.55 
 
 
311 aa  159  9e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2975  Purine nucleosidase  33.55 
 
 
311 aa  159  9e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0743  ribonucleoside hydrolase 1  33.55 
 
 
311 aa  158  9e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0598  ribonucleoside hydrolase 1  33.55 
 
 
311 aa  158  9e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00606  hypothetical protein  33.55 
 
 
311 aa  159  9e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0765  ribonucleoside hydrolase 1  33.01 
 
 
311 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0718  ribonucleoside hydrolase 1  33.55 
 
 
311 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.647996  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0704  ribonucleoside hydrolase 1  33.01 
 
 
311 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01760  nonspecific ribonucleoside hydrolase  34.41 
 
 
329 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000285671  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0018  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.24 
 
 
335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0778  ribonucleoside hydrolase 1  32.59 
 
 
311 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0832  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.87 
 
 
313 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0009  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.01 
 
 
314 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140534 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3255  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.52 
 
 
312 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1442  Ribosylpyrimidine nucleosidase  35.96 
 
 
316 aa  153  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2587  ribosylpyrimidine nucleosidase  35.65 
 
 
313 aa  153  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361439  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1120  ribonucleoside hydrolase 1  34.82 
 
 
312 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1652  purine nucleosidase  37.18 
 
 
316 aa  152  8.999999999999999e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.197736 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1210  ribonucleoside hydrolase 1  32.17 
 
 
310 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.178079  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2311  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.46 
 
 
303 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.933785  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0569  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.3 
 
 
322 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0319  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  36.34 
 
 
312 aa  150  3e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3224  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.67 
 
 
319 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00529527  normal  0.234301 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1526  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.79 
 
 
349 aa  150  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.458985  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1443  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.35 
 
 
317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.52753  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04420  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  34.88 
 
 
313 aa  145  6e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1981  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.05 
 
 
313 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.842213  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3232  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.25 
 
 
318 aa  144  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.594476  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3476  ribonucleoside hydrolase 1  33.12 
 
 
318 aa  144  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4897  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.97 
 
 
346 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562799  normal  0.0360004 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0018  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.05 
 
 
322 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5234  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.37 
 
 
309 aa  143  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.604929  hitchhiker  0.000866911 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3178  ribonucleoside hydrolase 1  32.79 
 
 
318 aa  143  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1049  ribonucleoside hydrolase 1  33.87 
 
 
312 aa  143  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0697  ribonucleoside hydrolase 1  33.02 
 
 
335 aa  143  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0647  ribonucleoside hydrolase 1  32.28 
 
 
318 aa  143  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4026  ribonucleoside hydrolase 1  32.18 
 
 
310 aa  142  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.494882  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2617  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.75 
 
 
322 aa  142  8e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.82375  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3306  ribonucleoside hydrolase 1  32.81 
 
 
318 aa  142  8e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0811  ribonucleoside hydrolase 1  32.5 
 
 
318 aa  140  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0940  ribonucleoside hydrolase 1  32.79 
 
 
311 aa  140  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.019412  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0081  purine nucleosidase  33.23 
 
 
356 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0660  ribonucleoside hydrolase 1  32.79 
 
 
318 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0185  Purine nucleosidase  33.23 
 
 
355 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1927  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.38 
 
 
321 aa  139  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.908964 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3647  ribonucleoside hydrolase 1  32.79 
 
 
318 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410931  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1178  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.88 
 
 
349 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.612504  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1195  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.88 
 
 
349 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4396  purine nucleosidase  33.23 
 
 
314 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3579  ribonucleoside hydrolase 1  32.47 
 
 
318 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0651  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  41.35 
 
 
321 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>