299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1006 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1006  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  100 
 
 
312 aa  648    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0522631  normal  0.0258769 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1486  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  56.23 
 
 
311 aa  360  2e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1896  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  45.19 
 
 
311 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00667656  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0061  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  42.31 
 
 
307 aa  252  6e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0768  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  43.59 
 
 
305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.933184  normal  0.0267075 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3900  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.47 
 
 
308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.637254  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4382  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.94 
 
 
321 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2809  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.71 
 
 
319 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0181966  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0542  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.25 
 
 
329 aa  175  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.488533  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0201  ribosylpyrimidine nucleosidase  34.2 
 
 
309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1804  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.33 
 
 
311 aa  160  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.327684 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0028  Ribosylpyrimidine nucleosidase  32.11 
 
 
323 aa  160  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1158  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.66 
 
 
318 aa  158  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4001  purine nucleosidase  33.55 
 
 
315 aa  155  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.454014  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0564  Ribosylpyrimidine nucleosidase  33.55 
 
 
311 aa  155  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1475  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.87 
 
 
311 aa  154  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0546979  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3224  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.66 
 
 
319 aa  152  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00529527  normal  0.234301 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0448  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  33.01 
 
 
314 aa  149  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3232  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.69 
 
 
318 aa  149  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.594476  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3626  Ribosylpyrimidine nucleosidase  32.46 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2117  Ribosylpyrimidine nucleosidase  30.62 
 
 
310 aa  147  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0050  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.37 
 
 
314 aa  146  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000041602 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2581  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  32.8 
 
 
309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0934  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.09 
 
 
313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0837501  normal  0.0202173 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1107  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.43 
 
 
315 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3255  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.74 
 
 
312 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4446  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.19 
 
 
311 aa  143  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1652  purine nucleosidase  32.25 
 
 
316 aa  142  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.197736 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1558  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.14 
 
 
313 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274753  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0006  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  30.67 
 
 
332 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.194545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0003  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  30.67 
 
 
332 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00458868  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2914  nucleoside hydrolase  32.14 
 
 
313 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5234  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.37 
 
 
309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.604929  hitchhiker  0.000866911 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6548  Ribosylpyrimidine nucleosidase  31.82 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527968  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0704  ribonucleoside hydrolase 1  31.61 
 
 
311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0814  ribonucleoside hydrolase 1  31.61 
 
 
311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0765  ribonucleoside hydrolase 1  31.61 
 
 
311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1210  ribonucleoside hydrolase 1  31.82 
 
 
310 aa  139  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.178079  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0753  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.23 
 
 
310 aa  139  6e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00064946  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1981  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.14 
 
 
313 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.842213  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0672  ribonucleoside hydrolase 1  31.29 
 
 
311 aa  138  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00617  ribonucleoside hydrolase 1  31.29 
 
 
311 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2975  Purine nucleosidase  31.29 
 
 
311 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1442  Ribosylpyrimidine nucleosidase  32.21 
 
 
316 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0009  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.48 
 
 
314 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140534 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0778  ribonucleoside hydrolase 1  31.29 
 
 
311 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0743  ribonucleoside hydrolase 1  31.29 
 
 
311 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00606  hypothetical protein  31.29 
 
 
311 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0598  ribonucleoside hydrolase 1  31.29 
 
 
311 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0220  nonspecific ribonucleoside hydrolase  31.51 
 
 
350 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2994  ribonucleoside hydrolase 1  31.29 
 
 
311 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0696  ribonucleoside hydrolase 1  31.29 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0679  ribonucleoside hydrolase 1  31.29 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1178  ribonucleoside hydrolase 1  31.09 
 
 
313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4624  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.74 
 
 
350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02361  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  31.48 
 
 
312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2633  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.79 
 
 
338 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2298  ribonucleoside hydrolase 2  28.48 
 
 
313 aa  136  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3042  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.56 
 
 
341 aa  136  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1486  ribonucleoside hydrolase 2  28.48 
 
 
313 aa  136  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0358178  hitchhiker  0.000862517 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2309  ribonucleoside hydrolase 2  28.48 
 
 
313 aa  136  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.19142  hitchhiker  0.000812735 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1496  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.48 
 
 
313 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0365306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2459  ribonucleoside hydrolase 2  28.48 
 
 
313 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3647  ribonucleoside hydrolase 1  31.73 
 
 
318 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410931  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3298  ribonucleoside hydrolase 2  28.48 
 
 
313 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0466718  normal  0.0924764 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5150  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.74 
 
 
350 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0647  ribonucleoside hydrolase 1  31.31 
 
 
318 aa  135  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1962  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.6 
 
 
335 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00495918  normal  0.0351342 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0660  ribonucleoside hydrolase 1  31.73 
 
 
318 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0718  ribonucleoside hydrolase 1  31.19 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.647996  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0386  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.42 
 
 
357 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0344  ribonucleoside hydrolase RihC  33.66 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0832  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.83 
 
 
313 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3734  Ribosylpyrimidine nucleosidase  31.68 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02091  ribonucleoside hydrolase 2  28.16 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3579  ribonucleoside hydrolase 1  31.73 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02050  hypothetical protein  28.16 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01760  nonspecific ribonucleoside hydrolase  30.87 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000285671  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3476  ribonucleoside hydrolase 1  31.53 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2548  putative inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase transmembrane protein  31.37 
 
 
351 aa  133  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3770  ribonucleoside hydrolase 1  31.41 
 
 
318 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3306  ribonucleoside hydrolase 1  31.53 
 
 
318 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1535  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.01 
 
 
313 aa  132  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.250677 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3104  twin-arginine translocation pathway signal  29.45 
 
 
350 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0319  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  32.48 
 
 
312 aa  132  6e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182819 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5263  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.45 
 
 
350 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0877  ribonucleoside hydrolase 1  30.35 
 
 
314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.197182  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1971  IUNH family nucleoside hydrolase  30 
 
 
326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.260258  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04420  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  30.79 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3178  ribonucleoside hydrolase 1  30.65 
 
 
318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5010  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.77 
 
 
350 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0009  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.83 
 
 
321 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.377078  normal  0.0385761 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4026  ribonucleoside hydrolase 1  30.57 
 
 
310 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.494882  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0185  Purine nucleosidase  31.43 
 
 
355 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0577  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  30.31 
 
 
318 aa  129  9.000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.113372 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4396  purine nucleosidase  30.23 
 
 
314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0569  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.96 
 
 
322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1120  ribonucleoside hydrolase 1  30.42 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2260  IUNH family nucleoside hydrolase  28.71 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0081  purine nucleosidase  30.23 
 
 
356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>