299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1486 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1486  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  100 
 
 
311 aa  635    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1006  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  56.23 
 
 
312 aa  360  2e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0522631  normal  0.0258769 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0061  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  43.09 
 
 
307 aa  257  2e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0768  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  46.01 
 
 
305 aa  251  1e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.933184  normal  0.0267075 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1896  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.74 
 
 
311 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00667656  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3900  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.66 
 
 
308 aa  200  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.637254  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4382  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.39 
 
 
321 aa  198  7.999999999999999e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2809  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.44 
 
 
319 aa  186  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0181966  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0542  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.91 
 
 
329 aa  182  7e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.488533  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02361  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  35.83 
 
 
312 aa  172  5e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1475  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.91 
 
 
311 aa  167  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0546979  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3255  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.1 
 
 
312 aa  166  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3734  Ribosylpyrimidine nucleosidase  34.16 
 
 
310 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0201  ribosylpyrimidine nucleosidase  30.94 
 
 
309 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1804  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.66 
 
 
311 aa  159  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.327684 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0028  Ribosylpyrimidine nucleosidase  32.61 
 
 
323 aa  160  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6548  Ribosylpyrimidine nucleosidase  34.74 
 
 
312 aa  159  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527968  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1158  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.94 
 
 
318 aa  154  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1925  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.43 
 
 
342 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103421  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0220  nonspecific ribonucleoside hydrolase  34.87 
 
 
350 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4001  purine nucleosidase  32.38 
 
 
315 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.454014  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1558  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.12 
 
 
313 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274753  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01760  nonspecific ribonucleoside hydrolase  34.87 
 
 
329 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000285671  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2914  nucleoside hydrolase  33.12 
 
 
313 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0569  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.73 
 
 
322 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3486  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.89 
 
 
333 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1107  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.85 
 
 
315 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0564  Ribosylpyrimidine nucleosidase  29.77 
 
 
311 aa  150  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2621  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.38 
 
 
320 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5234  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.75 
 
 
309 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.604929  hitchhiker  0.000866911 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0934  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.11 
 
 
313 aa  149  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0837501  normal  0.0202173 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2460  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.55 
 
 
322 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237882  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3230  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.22 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.618451 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0386  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.19 
 
 
357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4624  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.06 
 
 
350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0319  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  34.71 
 
 
312 aa  147  3e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182819 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1044  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  30.03 
 
 
321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4026  ribonucleoside hydrolase 1  32.05 
 
 
310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.494882  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4446  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.19 
 
 
311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0647  ribonucleoside hydrolase 1  31.51 
 
 
318 aa  146  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0006  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  30.87 
 
 
332 aa  145  9e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.194545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0003  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  30.87 
 
 
332 aa  145  9e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00458868  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3647  ribonucleoside hydrolase 1  30.99 
 
 
318 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410931  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0448  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  32.91 
 
 
314 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3104  twin-arginine translocation pathway signal  29.75 
 
 
350 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5263  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.75 
 
 
350 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1962  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.68 
 
 
335 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00495918  normal  0.0351342 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0660  ribonucleoside hydrolase 1  30.67 
 
 
318 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2157  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.89 
 
 
341 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000654385  normal  0.648077 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3306  ribonucleoside hydrolase 1  31.19 
 
 
318 aa  143  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5010  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.54 
 
 
350 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3579  ribonucleoside hydrolase 1  30.67 
 
 
318 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2581  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  30.67 
 
 
309 aa  142  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3476  ribonucleoside hydrolase 1  31.19 
 
 
318 aa  142  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00617  ribonucleoside hydrolase 1  30.32 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2975  Purine nucleosidase  30.32 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2994  ribonucleoside hydrolase 1  30.32 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0696  ribonucleoside hydrolase 1  30.32 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2373  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.67 
 
 
341 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.138595  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1178  ribonucleoside hydrolase 1  31.31 
 
 
313 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00606  hypothetical protein  30.32 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2309  ribonucleoside hydrolase 2  28.52 
 
 
313 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.19142  hitchhiker  0.000812735 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3770  ribonucleoside hydrolase 1  30.35 
 
 
318 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5150  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.75 
 
 
350 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0697  ribonucleoside hydrolase 1  30.32 
 
 
335 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0743  ribonucleoside hydrolase 1  30.32 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1496  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.37 
 
 
313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0365306  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1486  ribonucleoside hydrolase 2  28.52 
 
 
313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0358178  hitchhiker  0.000862517 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2459  ribonucleoside hydrolase 2  28.37 
 
 
313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2298  ribonucleoside hydrolase 2  28.52 
 
 
313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0940  ribonucleoside hydrolase 1  31.53 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.019412  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0679  ribonucleoside hydrolase 1  30.32 
 
 
311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0598  ribonucleoside hydrolase 1  30.32 
 
 
311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0672  ribonucleoside hydrolase 1  30 
 
 
311 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1120  ribonucleoside hydrolase 1  31.21 
 
 
312 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3298  ribonucleoside hydrolase 2  28.52 
 
 
313 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0466718  normal  0.0924764 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3232  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.07 
 
 
318 aa  139  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.594476  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02091  ribonucleoside hydrolase 2  34.92 
 
 
313 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02050  hypothetical protein  34.92 
 
 
313 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3506  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.06 
 
 
311 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0765  ribonucleoside hydrolase 1  30 
 
 
311 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1901  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.86 
 
 
316 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0704  ribonucleoside hydrolase 1  30 
 
 
311 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0811  ribonucleoside hydrolase 1  31.35 
 
 
318 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0832  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.59 
 
 
313 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1012  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.17 
 
 
332 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.272153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2307  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.9 
 
 
330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0778  ribonucleoside hydrolase 1  30 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2548  putative inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase transmembrane protein  29.9 
 
 
351 aa  136  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3178  ribonucleoside hydrolase 1  30.19 
 
 
318 aa  136  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3716  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.87 
 
 
319 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0814  ribonucleoside hydrolase 1  29.68 
 
 
311 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0877  ribonucleoside hydrolase 1  31.11 
 
 
314 aa  136  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.197182  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1840  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.58 
 
 
314 aa  135  8e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.94695  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04420  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  31.94 
 
 
313 aa  135  9e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1981  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.22 
 
 
313 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.842213  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0050  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.82 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000041602 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1210  ribonucleoside hydrolase 1  30.62 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.178079  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0628  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.42 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03204  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  34.76 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>