More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3506 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3506  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  100 
 
 
311 aa  642    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03204  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  77.81 
 
 
313 aa  502  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1535  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  50.32 
 
 
313 aa  310  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.250677 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3716  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  45.14 
 
 
319 aa  250  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1010  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  44.73 
 
 
324 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1840  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  41.16 
 
 
314 aa  231  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.94695  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3408  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  42.81 
 
 
324 aa  231  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3859  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  43.35 
 
 
322 aa  229  6e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000304796 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4253  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  43.67 
 
 
322 aa  228  9e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1122  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  42.95 
 
 
324 aa  228  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03052  hypothetical protein  42.59 
 
 
322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4422  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.62 
 
 
321 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2632  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  40.71 
 
 
319 aa  218  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1256  IUNH family nucleoside hydrolase  41.01 
 
 
323 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2680  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.99 
 
 
322 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2802  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.42 
 
 
317 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  0.253524 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2450  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  40.62 
 
 
441 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1182  IUNH family nucleoside hydrolase  40.62 
 
 
441 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2125  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.13 
 
 
316 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.601271  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2367  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.94 
 
 
317 aa  215  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0234131 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1555  hypothetical protein  40 
 
 
379 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0742  putative inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  39.62 
 
 
321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1071  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.63 
 
 
315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1962  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.7 
 
 
328 aa  210  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2618  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.98 
 
 
369 aa  209  5e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0569  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  44.44 
 
 
322 aa  197  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1475  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  44.62 
 
 
311 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0546979  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0225  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.48 
 
 
307 aa  195  7e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226069  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5234  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  43.65 
 
 
309 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.604929  hitchhiker  0.000866911 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1658  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.25 
 
 
320 aa  182  4.0000000000000006e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0201  ribosylpyrimidine nucleosidase  36.33 
 
 
309 aa  182  6e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2581  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  42.52 
 
 
309 aa  182  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2621  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  43.87 
 
 
320 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1356  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  42.01 
 
 
311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0798  inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  36.16 
 
 
319 aa  178  1e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.190836  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1012  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  41.83 
 
 
332 aa  175  8e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.272153  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0628  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.92 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0028  Ribosylpyrimidine nucleosidase  34.69 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3373  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.94 
 
 
317 aa  172  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1652  purine nucleosidase  38.34 
 
 
316 aa  172  9e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.197736 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2914  nucleoside hydrolase  40 
 
 
313 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1804  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.08 
 
 
311 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.327684 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1558  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40 
 
 
313 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274753  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4001  purine nucleosidase  42.15 
 
 
315 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.454014  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1107  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40 
 
 
315 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2260  IUNH family nucleoside hydrolase  33.33 
 
 
326 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2633  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.93 
 
 
338 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1901  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  42.57 
 
 
316 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04420  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  37.38 
 
 
313 aa  167  2e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3042  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.25 
 
 
341 aa  166  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2117  Ribosylpyrimidine nucleosidase  35.69 
 
 
310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38943  predicted protein  36.94 
 
 
396 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.192473  normal  0.823549 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0296  inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  34.56 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0304  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.46 
 
 
319 aa  164  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0319  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  37.74 
 
 
312 aa  163  3e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182819 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1971  IUNH family nucleoside hydrolase  32.97 
 
 
326 aa  162  7e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.260258  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0006  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  36.75 
 
 
332 aa  161  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.194545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0003  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  36.75 
 
 
332 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00458868  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0934  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.32 
 
 
313 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0837501  normal  0.0202173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1962  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.79 
 
 
335 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00495918  normal  0.0351342 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3734  Ribosylpyrimidine nucleosidase  32.8 
 
 
310 aa  160  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0577  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  34.31 
 
 
318 aa  158  1e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.113372 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4446  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.04 
 
 
311 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0753  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.67 
 
 
310 aa  156  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00064946  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3255  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.55 
 
 
312 aa  155  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2460  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.43 
 
 
322 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237882  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01760  nonspecific ribonucleoside hydrolase  37.73 
 
 
329 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000285671  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4897  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.55 
 
 
346 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562799  normal  0.0360004 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0220  nonspecific ribonucleoside hydrolase  37.45 
 
 
350 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3486  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.07 
 
 
333 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02361  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  45.55 
 
 
312 aa  153  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3224  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.82 
 
 
319 aa  152  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00529527  normal  0.234301 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0050  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.41 
 
 
314 aa  152  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000041602 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2226  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.16 
 
 
310 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0216833  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3230  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.07 
 
 
333 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.618451 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0528  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  33.45 
 
 
327 aa  151  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0386  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.65 
 
 
357 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3104  twin-arginine translocation pathway signal  33.01 
 
 
350 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1158  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.96 
 
 
318 aa  150  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5263  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.01 
 
 
350 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1526  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.52 
 
 
349 aa  149  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.458985  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0448  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  37.18 
 
 
314 aa  149  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4624  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.33 
 
 
350 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23440  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  36.82 
 
 
324 aa  149  8e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0476594  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5010  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.01 
 
 
350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3900  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  42.19 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.637254  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4396  purine nucleosidase  35.16 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0228  purine nucleosidase  34.95 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0234  purine nucleosidase  34.95 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0832  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.82 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1925  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.46 
 
 
342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103421  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2307  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.29 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3298  ribonucleoside hydrolase 2  34.8 
 
 
313 aa  146  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0466718  normal  0.0924764 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1496  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.4 
 
 
313 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0365306  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0081  purine nucleosidase  34.17 
 
 
356 aa  144  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2459  ribonucleoside hydrolase 2  34.4 
 
 
313 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1658  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein  34.93 
 
 
310 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000168462 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1210  ribonucleoside hydrolase 1  38.13 
 
 
310 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.178079  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2309  ribonucleoside hydrolase 2  34 
 
 
313 aa  143  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.19142  hitchhiker  0.000812735 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28400  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  33.97 
 
 
320 aa  144  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>