More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2450 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2450  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  100 
 
 
441 aa  874    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1555  hypothetical protein  85.45 
 
 
379 aa  637    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1256  IUNH family nucleoside hydrolase  99.69 
 
 
323 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1182  IUNH family nucleoside hydrolase  100 
 
 
441 aa  874    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4422  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  76.16 
 
 
321 aa  484  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0742  putative inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  77.09 
 
 
321 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2632  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  54.35 
 
 
319 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1010  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  51.25 
 
 
324 aa  327  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2680  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  50.78 
 
 
322 aa  324  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1122  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  50.31 
 
 
324 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03052  hypothetical protein  49.84 
 
 
322 aa  320  3.9999999999999996e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3408  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  49.22 
 
 
324 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4253  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  50.78 
 
 
322 aa  319  5e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2802  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  52.96 
 
 
317 aa  316  6e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  0.253524 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3859  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  51.25 
 
 
322 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000304796 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2125  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  50.93 
 
 
316 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.601271  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2367  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  50.46 
 
 
317 aa  300  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0234131 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3716  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  50.31 
 
 
319 aa  298  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1962  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  52.55 
 
 
328 aa  298  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2618  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  48.95 
 
 
369 aa  289  7e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1535  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  43.79 
 
 
313 aa  260  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.250677 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1071  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  47.81 
 
 
315 aa  258  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0304  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  50.18 
 
 
319 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1840  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  42.41 
 
 
314 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.94695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3506  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.62 
 
 
311 aa  217  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03204  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  38.49 
 
 
313 aa  200  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5234  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  41.01 
 
 
309 aa  172  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.604929  hitchhiker  0.000866911 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0225  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.31 
 
 
307 aa  172  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226069  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4396  purine nucleosidase  40.07 
 
 
314 aa  170  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2298  ribonucleoside hydrolase 2  36.97 
 
 
313 aa  170  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3298  ribonucleoside hydrolase 2  36.97 
 
 
313 aa  170  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0466718  normal  0.0924764 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1486  ribonucleoside hydrolase 2  36.97 
 
 
313 aa  170  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0358178  hitchhiker  0.000862517 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2309  ribonucleoside hydrolase 2  36.97 
 
 
313 aa  169  7e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.19142  hitchhiker  0.000812735 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1496  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.97 
 
 
313 aa  169  8e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0365306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2459  ribonucleoside hydrolase 2  36.97 
 
 
313 aa  169  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02091  ribonucleoside hydrolase 2  36.62 
 
 
313 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02050  hypothetical protein  36.62 
 
 
313 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2117  Ribosylpyrimidine nucleosidase  34.85 
 
 
310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0201  ribosylpyrimidine nucleosidase  34.91 
 
 
309 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0028  Ribosylpyrimidine nucleosidase  37.86 
 
 
323 aa  164  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1804  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.54 
 
 
311 aa  163  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.327684 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0577  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  34.05 
 
 
318 aa  163  6e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.113372 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0081  purine nucleosidase  39.8 
 
 
356 aa  161  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0185  Purine nucleosidase  38.78 
 
 
355 aa  158  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2633  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.68 
 
 
338 aa  157  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0569  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.94 
 
 
322 aa  155  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3042  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.46 
 
 
341 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0564  Ribosylpyrimidine nucleosidase  34.8 
 
 
311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04420  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  36.52 
 
 
313 aa  154  4e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0006  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  32.93 
 
 
332 aa  153  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.194545  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0220  nonspecific ribonucleoside hydrolase  36.68 
 
 
350 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0003  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  32.93 
 
 
332 aa  153  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00458868  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3626  Ribosylpyrimidine nucleosidase  31.25 
 
 
308 aa  153  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28400  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  38.34 
 
 
320 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0628  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.4 
 
 
320 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2914  nucleoside hydrolase  37.86 
 
 
313 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3734  Ribosylpyrimidine nucleosidase  33.08 
 
 
310 aa  152  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1558  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.86 
 
 
313 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274753  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01760  nonspecific ribonucleoside hydrolase  36.75 
 
 
329 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000285671  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4001  purine nucleosidase  35.09 
 
 
315 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.454014  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0028  ribonucleoside hydrolase RihC  35.76 
 
 
304 aa  150  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38943  predicted protein  33.79 
 
 
396 aa  149  7e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.192473  normal  0.823549 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1107  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.43 
 
 
315 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1652  purine nucleosidase  41.26 
 
 
316 aa  148  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.197736 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2260  IUNH family nucleoside hydrolase  31.94 
 
 
326 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1658  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.56 
 
 
320 aa  147  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2373  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.35 
 
 
341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.138595  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4446  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.52 
 
 
311 aa  146  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0344  ribonucleoside hydrolase RihC  33.57 
 
 
315 aa  146  8.000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0055  ribonucleoside hydrolase RihC  35.87 
 
 
306 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.845766  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0102  ribonucleoside hydrolase RihC  34.63 
 
 
302 aa  145  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000159714  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0056  ribonucleoside hydrolase RihC  35.87 
 
 
306 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.594312  normal  0.222927 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0030  ribonucleoside hydrolase RihC  35.26 
 
 
304 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.719928  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0034  ribonucleoside hydrolase RihC  35.26 
 
 
304 aa  144  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0056  ribonucleoside hydrolase RihC  35.87 
 
 
306 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.696065 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0032  ribonucleoside hydrolase RihC  35.26 
 
 
304 aa  144  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0058  ribonucleoside hydrolase RihC  36.19 
 
 
306 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1925  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.4 
 
 
342 aa  144  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103421  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0319  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  35.21 
 
 
312 aa  144  4e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182819 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00034  ribonucleoside hydrolase 3  35.58 
 
 
304 aa  143  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00939814  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0057  ribonucleoside hydrolase RihC  37.14 
 
 
306 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.342327  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2157  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.18 
 
 
341 aa  143  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000654385  normal  0.648077 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00033  hypothetical protein  35.58 
 
 
303 aa  143  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00634591  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0032  ribonucleoside hydrolase RihC  34.94 
 
 
304 aa  143  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3569  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.94 
 
 
304 aa  142  8e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2307  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.59 
 
 
330 aa  143  8e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0832  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.47 
 
 
313 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3659  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.81 
 
 
313 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.121445  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0552  ribonucleoside hydrolase RihC  37.27 
 
 
305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0642  ribonucleoside hydrolase RihC  30.17 
 
 
302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0188198  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1158  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.24 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1443  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.98 
 
 
317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.52753  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2581  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  37.59 
 
 
309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0753  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.23 
 
 
310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00064946  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0154  ribonucleoside hydrolase RihC  31.7 
 
 
296 aa  140  3.9999999999999997e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0797  ribonucleoside hydrolase RihC  33.87 
 
 
310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0129973  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1475  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.97 
 
 
311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0546979  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1971  IUNH family nucleoside hydrolase  30.9 
 
 
326 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.260258  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0759  inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  31.45 
 
 
328 aa  139  8.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.486217  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5010  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.97 
 
 
350 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>