More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2618 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2618  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  100 
 
 
369 aa  737    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2802  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  52.38 
 
 
317 aa  299  7e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  0.253524 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2632  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  51.42 
 
 
319 aa  296  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4422  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  52.1 
 
 
321 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03052  hypothetical protein  47.28 
 
 
322 aa  294  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4253  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  49.21 
 
 
322 aa  292  7e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2450  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  48.95 
 
 
441 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1182  IUNH family nucleoside hydrolase  48.95 
 
 
441 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1256  IUNH family nucleoside hydrolase  50.48 
 
 
323 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2680  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  47.47 
 
 
322 aa  287  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2367  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  51.13 
 
 
317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0234131 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2125  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  50.48 
 
 
316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.601271  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1555  hypothetical protein  49.84 
 
 
379 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1010  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  46.3 
 
 
324 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0742  putative inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  51.76 
 
 
321 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1071  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  50.32 
 
 
315 aa  281  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3408  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  46.5 
 
 
324 aa  280  4e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3859  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  48.06 
 
 
322 aa  279  6e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000304796 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3716  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  48.92 
 
 
319 aa  277  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1962  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  53.55 
 
 
328 aa  273  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1122  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  45.54 
 
 
324 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0304  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  51.07 
 
 
319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1840  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  45.11 
 
 
314 aa  229  5e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.94695  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1535  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  41.29 
 
 
313 aa  225  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.250677 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03204  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  39.62 
 
 
313 aa  209  7e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3506  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.98 
 
 
311 aa  209  7e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0028  Ribosylpyrimidine nucleosidase  42.11 
 
 
323 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1962  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  41.64 
 
 
335 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00495918  normal  0.0351342 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5234  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  41.99 
 
 
309 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.604929  hitchhiker  0.000866911 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0201  ribosylpyrimidine nucleosidase  39.1 
 
 
309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2157  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.65 
 
 
341 aa  166  9e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000654385  normal  0.648077 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1925  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.7 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103421  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0220  nonspecific ribonucleoside hydrolase  40.35 
 
 
350 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0225  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.71 
 
 
307 aa  164  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226069  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2373  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.93 
 
 
341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.138595  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2298  ribonucleoside hydrolase 2  38.77 
 
 
313 aa  162  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1486  ribonucleoside hydrolase 2  38.77 
 
 
313 aa  162  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0358178  hitchhiker  0.000862517 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2309  ribonucleoside hydrolase 2  38.77 
 
 
313 aa  162  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.19142  hitchhiker  0.000812735 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1496  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.77 
 
 
313 aa  162  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0365306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2459  ribonucleoside hydrolase 2  38.77 
 
 
313 aa  162  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3230  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.57 
 
 
333 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.618451 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02091  ribonucleoside hydrolase 2  39.38 
 
 
313 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3298  ribonucleoside hydrolase 2  38.77 
 
 
313 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0466718  normal  0.0924764 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1804  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.21 
 
 
311 aa  162  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.327684 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02050  hypothetical protein  39.38 
 
 
313 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01760  nonspecific ribonucleoside hydrolase  40.14 
 
 
329 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000285671  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4396  purine nucleosidase  38.95 
 
 
314 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3486  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.57 
 
 
333 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2460  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.57 
 
 
322 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237882  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0185  Purine nucleosidase  35.03 
 
 
355 aa  159  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4001  purine nucleosidase  38.43 
 
 
315 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.454014  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0081  purine nucleosidase  37.02 
 
 
356 aa  156  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1107  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.08 
 
 
315 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0577  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  39.5 
 
 
318 aa  155  1e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.113372 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2914  nucleoside hydrolase  39.49 
 
 
313 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1158  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.08 
 
 
318 aa  152  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2117  Ribosylpyrimidine nucleosidase  36.05 
 
 
310 aa  152  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1558  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.49 
 
 
313 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274753  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0569  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.78 
 
 
322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0753  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.25 
 
 
310 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00064946  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0628  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.14 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3734  Ribosylpyrimidine nucleosidase  34.38 
 
 
310 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0564  Ribosylpyrimidine nucleosidase  35.96 
 
 
311 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0003  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  36.86 
 
 
332 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00458868  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0006  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  36.33 
 
 
332 aa  146  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.194545  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0009  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.07 
 
 
314 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140534 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0009  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.78 
 
 
321 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.377078  normal  0.0385761 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5010  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.93 
 
 
350 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0386  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.56 
 
 
357 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04420  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  35.48 
 
 
313 aa  142  7e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1652  purine nucleosidase  36.71 
 
 
316 aa  142  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.197736 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1658  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.69 
 
 
320 aa  142  8e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3224  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.77 
 
 
319 aa  142  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00529527  normal  0.234301 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2581  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  39.86 
 
 
309 aa  142  9e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2307  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.13 
 
 
330 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0832  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.99 
 
 
313 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0528  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  35.48 
 
 
327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1356  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  41.18 
 
 
311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3104  twin-arginine translocation pathway signal  38.75 
 
 
350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4624  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.11 
 
 
350 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5263  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  38.75 
 
 
350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0552  ribonucleoside hydrolase RihC  39.93 
 
 
305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5150  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.48 
 
 
350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2693  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein  32.19 
 
 
321 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00192039  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2888  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein  32.19 
 
 
321 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.383036  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2260  IUNH family nucleoside hydrolase  34.66 
 
 
326 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0028  ribonucleoside hydrolase RihC  38.15 
 
 
304 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28400  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  37.23 
 
 
320 aa  140  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0030  ribonucleoside hydrolase RihC  38.75 
 
 
304 aa  139  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.719928  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2891  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein  31.87 
 
 
321 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000414712 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2642  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  31.87 
 
 
321 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.472013  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2619  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  31.56 
 
 
321 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.195265  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0759  inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  33.76 
 
 
328 aa  138  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.486217  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3373  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.86 
 
 
317 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00034  ribonucleoside hydrolase 3  38.38 
 
 
304 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00939814  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0642  ribonucleoside hydrolase RihC  34.04 
 
 
302 aa  137  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0188198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2939  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein  31.56 
 
 
321 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000490285  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0034  ribonucleoside hydrolase RihC  38.75 
 
 
304 aa  138  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00033  hypothetical protein  38.38 
 
 
303 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00634591  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0032  ribonucleoside hydrolase RihC  38.38 
 
 
304 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>