279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3071 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3071  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  100 
 
 
389 aa  771    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.474461  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0624  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  63.78 
 
 
331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00617  ribonucleoside hydrolase 1  33.59 
 
 
311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2975  Purine nucleosidase  33.59 
 
 
311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0743  ribonucleoside hydrolase 1  33.59 
 
 
311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2994  ribonucleoside hydrolase 1  33.59 
 
 
311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0598  ribonucleoside hydrolase 1  33.59 
 
 
311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00606  hypothetical protein  33.59 
 
 
311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0679  ribonucleoside hydrolase 1  33.59 
 
 
311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0696  ribonucleoside hydrolase 1  33.2 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0778  ribonucleoside hydrolase 1  34.38 
 
 
311 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0765  ribonucleoside hydrolase 1  34.38 
 
 
311 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0718  ribonucleoside hydrolase 1  34.32 
 
 
311 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.647996  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0704  ribonucleoside hydrolase 1  34.38 
 
 
311 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3476  ribonucleoside hydrolase 1  35.27 
 
 
318 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0814  ribonucleoside hydrolase 1  33.98 
 
 
311 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4026  ribonucleoside hydrolase 1  34.38 
 
 
310 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.494882  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0672  ribonucleoside hydrolase 1  33.2 
 
 
311 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0811  ribonucleoside hydrolase 1  33.98 
 
 
318 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3306  ribonucleoside hydrolase 1  34.88 
 
 
318 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1178  ribonucleoside hydrolase 1  34.87 
 
 
313 aa  106  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1120  ribonucleoside hydrolase 1  33.56 
 
 
312 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0647  ribonucleoside hydrolase 1  34.5 
 
 
318 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3178  ribonucleoside hydrolase 1  33.33 
 
 
318 aa  104  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0697  ribonucleoside hydrolase 1  30.95 
 
 
335 aa  102  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3770  ribonucleoside hydrolase 1  33.07 
 
 
318 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2633  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.69 
 
 
338 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3647  ribonucleoside hydrolase 1  32.68 
 
 
318 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410931  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1049  ribonucleoside hydrolase 1  32.2 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0564  Ribosylpyrimidine nucleosidase  29.51 
 
 
311 aa  98.2  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0660  ribonucleoside hydrolase 1  32.68 
 
 
318 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1210  ribonucleoside hydrolase 1  31.3 
 
 
310 aa  98.6  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.178079  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0095  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.3 
 
 
372 aa  97.4  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3579  ribonucleoside hydrolase 1  32.68 
 
 
318 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1863  ribonucleoside hydrolase 1  30.41 
 
 
322 aa  95.1  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.742774  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3042  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.66 
 
 
341 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0753  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.57 
 
 
310 aa  94.4  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00064946  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2587  ribosylpyrimidine nucleosidase  30.83 
 
 
313 aa  94  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361439  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1558  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.84 
 
 
313 aa  94  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274753  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0934  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.04 
 
 
313 aa  93.6  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0837501  normal  0.0202173 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2914  nucleoside hydrolase  30.52 
 
 
313 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3262  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.34 
 
 
309 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.562048  normal  0.487952 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1107  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.19 
 
 
315 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0228  purine nucleosidase  30.04 
 
 
311 aa  89.4  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0234  purine nucleosidase  30.04 
 
 
311 aa  89.4  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04420  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  28.47 
 
 
313 aa  89.4  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3240  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.04 
 
 
302 aa  89  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206902  normal  0.22308 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1012  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.84 
 
 
332 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.272153  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1902  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.61 
 
 
747 aa  88.2  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.310197  hitchhiker  0.00633735 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0760  inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase-like  30.99 
 
 
362 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1901  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.89 
 
 
316 aa  87.4  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0877  ribonucleoside hydrolase 1  31.4 
 
 
314 aa  85.9  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.197182  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0940  ribonucleoside hydrolase 1  32.68 
 
 
311 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.019412  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1981  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.43 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.842213  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4001  purine nucleosidase  33.18 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.454014  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6548  Ribosylpyrimidine nucleosidase  29.72 
 
 
312 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527968  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0006  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  28.95 
 
 
332 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.194545  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4446  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.29 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0003  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  28.95 
 
 
332 aa  82  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00458868  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5234  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.36 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.604929  hitchhiker  0.000866911 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4926  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.8 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.983704  normal  0.154414 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0201  ribosylpyrimidine nucleosidase  27.8 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2307  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.13 
 
 
330 aa  82  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0797  ribonucleoside hydrolase RihC  29.13 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0129973  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28400  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  30.34 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3659  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.51 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.121445  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1804  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.67 
 
 
311 aa  80.5  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.327684 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0528  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  30.08 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3506  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.33 
 
 
311 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4382  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.49 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1486  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.08 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1650  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.99 
 
 
340 aa  79.7  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.358595  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3734  Ribosylpyrimidine nucleosidase  27.97 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4938  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.67 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.35183  normal  0.16262 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0017  Ribosylpyrimidine nucleosidase  28.43 
 
 
317 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1158  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.69 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1658  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  26.77 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3626  Ribosylpyrimidine nucleosidase  26.58 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0768  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.57 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.933184  normal  0.0267075 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2548  putative inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase transmembrane protein  32.7 
 
 
351 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1840  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.62 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.94695  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2311  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.34 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.933785  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03204  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  32.09 
 
 
313 aa  77  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0296  inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  28.93 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1925  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.64 
 
 
342 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103421  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0319  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  28.4 
 
 
312 aa  75.9  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182819 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1071  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.63 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0028  Ribosylpyrimidine nucleosidase  25.78 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3465  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  26.87 
 
 
307 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1526  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.79 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.458985  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1205  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.16 
 
 
349 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902231  normal  0.0440616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2460  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.11 
 
 
322 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237882  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0577  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  28 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.113372 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3255  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.69 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0542  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.49 
 
 
329 aa  74.3  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.488533  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4897  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.79 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562799  normal  0.0360004 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0061  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.98 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0018  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.73 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0275  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.96 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000142463  decreased coverage  0.000000559143 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1442  Ribosylpyrimidine nucleosidase  29.13 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>