273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0760 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0760  inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase-like  100 
 
 
362 aa  731    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0201  ribosylpyrimidine nucleosidase  32.44 
 
 
309 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0877  ribonucleoside hydrolase 1  29.53 
 
 
314 aa  119  6e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.197182  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0275  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.5 
 
 
316 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000142463  decreased coverage  0.000000559143 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1962  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.33 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1210  ribonucleoside hydrolase 1  32.31 
 
 
310 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.178079  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0028  Ribosylpyrimidine nucleosidase  32.01 
 
 
323 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1343  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein  27.12 
 
 
335 aa  113  5e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03052  hypothetical protein  31.62 
 
 
322 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4001  purine nucleosidase  29.69 
 
 
315 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.454014  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1658  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.96 
 
 
320 aa  107  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2680  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.75 
 
 
322 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0778  ribonucleoside hydrolase 1  28.95 
 
 
311 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0814  ribonucleoside hydrolase 1  28.62 
 
 
311 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0704  ribonucleoside hydrolase 1  28.62 
 
 
311 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2618  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.97 
 
 
369 aa  107  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1925  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.41 
 
 
342 aa  106  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103421  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0765  ribonucleoside hydrolase 1  28.29 
 
 
311 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3224  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.59 
 
 
319 aa  106  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00529527  normal  0.234301 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2914  nucleoside hydrolase  28.24 
 
 
313 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3042  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.77 
 
 
341 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1107  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.47 
 
 
315 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1558  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.24 
 
 
313 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274753  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1178  ribonucleoside hydrolase 1  29.59 
 
 
313 aa  103  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3486  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.54 
 
 
333 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1962  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.03 
 
 
335 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00495918  normal  0.0351342 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1158  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.39 
 
 
318 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3659  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.41 
 
 
313 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.121445  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2633  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.42 
 
 
338 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4467  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.93 
 
 
327 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5234  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.2 
 
 
309 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.604929  hitchhiker  0.000866911 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2617  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.69 
 
 
322 aa  101  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.82375  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1105  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  30.16 
 
 
344 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0696  ribonucleoside hydrolase 1  27.3 
 
 
311 aa  100  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0234  purine nucleosidase  29.03 
 
 
311 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2157  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.09 
 
 
341 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000654385  normal  0.648077 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0577  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  28.7 
 
 
318 aa  100  4e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.113372 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0228  purine nucleosidase  29.03 
 
 
311 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00617  ribonucleoside hydrolase 1  28.09 
 
 
311 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2975  Purine nucleosidase  28.09 
 
 
311 aa  100  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0743  ribonucleoside hydrolase 1  27.3 
 
 
311 aa  100  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2994  ribonucleoside hydrolase 1  28.09 
 
 
311 aa  100  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00606  hypothetical protein  28.09 
 
 
311 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0598  ribonucleoside hydrolase 1  27.3 
 
 
311 aa  100  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0679  ribonucleoside hydrolase 1  27.3 
 
 
311 aa  100  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1652  purine nucleosidase  30 
 
 
316 aa  99.8  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.197736 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1804  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.95 
 
 
311 aa  99.4  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.327684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01760  nonspecific ribonucleoside hydrolase  29.97 
 
 
329 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000285671  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2460  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.31 
 
 
322 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237882  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2373  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.07 
 
 
341 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.138595  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03204  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  28.11 
 
 
313 aa  99  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0220  nonspecific ribonucleoside hydrolase  29.74 
 
 
350 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3230  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.31 
 
 
333 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.618451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1122  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.93 
 
 
324 aa  98.2  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3658  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.38 
 
 
334 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.438551  normal  0.106477 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4422  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.17 
 
 
321 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4026  ribonucleoside hydrolase 1  28.84 
 
 
310 aa  96.7  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.494882  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3579  ribonucleoside hydrolase 1  29.06 
 
 
318 aa  96.3  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0009  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.14 
 
 
321 aa  96.3  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.377078  normal  0.0385761 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3306  ribonucleoside hydrolase 1  29.14 
 
 
318 aa  96.3  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0660  ribonucleoside hydrolase 1  29.06 
 
 
318 aa  96.3  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0647  ribonucleoside hydrolase 1  29.14 
 
 
318 aa  96.3  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0628  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.92 
 
 
320 aa  96.3  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3476  ribonucleoside hydrolase 1  29.14 
 
 
318 aa  96.3  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3647  ribonucleoside hydrolase 1  29.06 
 
 
318 aa  95.9  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410931  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1475  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.38 
 
 
311 aa  95.9  9e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0546979  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3770  ribonucleoside hydrolase 1  29.06 
 
 
318 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0742  putative inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  33.33 
 
 
321 aa  93.6  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0934  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.21 
 
 
313 aa  93.6  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0837501  normal  0.0202173 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0296  inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  25.76 
 
 
318 aa  93.2  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1010  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.08 
 
 
324 aa  93.2  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0832  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.72 
 
 
313 aa  92.8  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1555  hypothetical protein  31.96 
 
 
379 aa  92.8  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0364  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein  25.71 
 
 
335 aa  92.8  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2486  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.94 
 
 
308 aa  92.8  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0811  ribonucleoside hydrolase 1  28.78 
 
 
318 aa  92.8  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1049  ribonucleoside hydrolase 1  28.68 
 
 
312 aa  92.8  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2311  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.14 
 
 
303 aa  92.8  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.933785  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0050  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.89 
 
 
314 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000041602 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0718  ribonucleoside hydrolase 1  26.64 
 
 
311 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.647996  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1256  IUNH family nucleoside hydrolase  31.94 
 
 
323 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3716  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.18 
 
 
319 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3178  ribonucleoside hydrolase 1  28.68 
 
 
318 aa  92  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0672  ribonucleoside hydrolase 1  26.64 
 
 
311 aa  92  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0385  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein  25.71 
 
 
335 aa  91.7  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.693854  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2450  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  32.32 
 
 
441 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4253  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.28 
 
 
322 aa  91.3  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3408  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  26.92 
 
 
324 aa  91.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1120  ribonucleoside hydrolase 1  29.21 
 
 
312 aa  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0624  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.47 
 
 
331 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1182  IUNH family nucleoside hydrolase  32.32 
 
 
441 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1863  ribonucleoside hydrolase 1  27.55 
 
 
322 aa  90.5  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.742774  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0006  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  26.5 
 
 
332 aa  90.1  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.194545  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0940  ribonucleoside hydrolase 1  28.09 
 
 
311 aa  90.1  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.019412  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1443  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.67 
 
 
317 aa  90.1  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.52753  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0003  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  27.1 
 
 
332 aa  90.5  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00458868  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4396  purine nucleosidase  28.04 
 
 
314 aa  90.1  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0448  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  26.49 
 
 
314 aa  89.4  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0697  ribonucleoside hydrolase 1  27.61 
 
 
335 aa  89.4  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3809  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.08 
 
 
328 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>