287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3465 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3465  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  100 
 
 
307 aa  638    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4938  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  71.01 
 
 
307 aa  477  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.35183  normal  0.16262 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2156  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  43.93 
 
 
312 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2236  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein  43.32 
 
 
312 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2170  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  43.32 
 
 
312 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0382277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2400  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein  43.32 
 
 
312 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2968  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein  43.18 
 
 
313 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.290028  normal  0.15342 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2415  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein  43 
 
 
313 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2364  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein  42.86 
 
 
313 aa  261  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2208  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  42.67 
 
 
316 aa  257  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.703349  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2500  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein  42.35 
 
 
313 aa  255  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3262  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.38 
 
 
309 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.562048  normal  0.487952 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2308  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.13 
 
 
313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.287385  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2350  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  40.13 
 
 
313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.987323  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1865  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein  37.83 
 
 
313 aa  209  5e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1673  inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  40.52 
 
 
312 aa  208  1e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0870  inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  37.62 
 
 
308 aa  206  5e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0940  ribonucleoside hydrolase 1  26.57 
 
 
311 aa  100  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.019412  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1120  ribonucleoside hydrolase 1  27.81 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0697  ribonucleoside hydrolase 1  27.39 
 
 
335 aa  97.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4161  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.41 
 
 
358 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.324907 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1049  ribonucleoside hydrolase 1  25.3 
 
 
312 aa  97.1  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1804  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.9 
 
 
311 aa  96.3  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.327684 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3042  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.4 
 
 
341 aa  94  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2633  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.4 
 
 
338 aa  94  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2632  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  26.33 
 
 
319 aa  93.2  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2680  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.5 
 
 
322 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0624  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.31 
 
 
331 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0679  ribonucleoside hydrolase 1  27.56 
 
 
311 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4001  purine nucleosidase  30.32 
 
 
315 aa  90.5  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.454014  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2994  ribonucleoside hydrolase 1  27.56 
 
 
311 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4026  ribonucleoside hydrolase 1  28.33 
 
 
310 aa  90.5  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.494882  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00617  ribonucleoside hydrolase 1  27.56 
 
 
311 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2975  Purine nucleosidase  27.56 
 
 
311 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0696  ribonucleoside hydrolase 1  27.24 
 
 
311 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00606  hypothetical protein  27.56 
 
 
311 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0743  ribonucleoside hydrolase 1  27.56 
 
 
311 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0598  ribonucleoside hydrolase 1  27.56 
 
 
311 aa  89.4  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03204  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  25.86 
 
 
313 aa  89  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1863  ribonucleoside hydrolase 1  25.08 
 
 
322 aa  89  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.742774  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03052  hypothetical protein  25 
 
 
322 aa  88.6  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3104  twin-arginine translocation pathway signal  30.32 
 
 
350 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0672  ribonucleoside hydrolase 1  27.88 
 
 
311 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3647  ribonucleoside hydrolase 1  25.58 
 
 
318 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410931  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2307  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  22.85 
 
 
330 aa  88.2  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5263  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.32 
 
 
350 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3178  ribonucleoside hydrolase 1  23.85 
 
 
318 aa  88.6  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0631  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  24.18 
 
 
396 aa  87.8  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4624  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  26.11 
 
 
350 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3476  ribonucleoside hydrolase 1  28.86 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5010  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.7 
 
 
350 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3579  ribonucleoside hydrolase 1  25.58 
 
 
318 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0095  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.83 
 
 
372 aa  87.4  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3306  ribonucleoside hydrolase 1  28.86 
 
 
318 aa  87  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0718  ribonucleoside hydrolase 1  26.42 
 
 
311 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.647996  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28400  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  30.29 
 
 
320 aa  87  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0647  ribonucleoside hydrolase 1  28.86 
 
 
318 aa  86.7  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2617  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  23.69 
 
 
322 aa  86.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.82375  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4422  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.51 
 
 
321 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1658  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  24.18 
 
 
320 aa  86.7  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0660  ribonucleoside hydrolase 1  25.25 
 
 
318 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1122  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.69 
 
 
324 aa  86.3  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1210  ribonucleoside hydrolase 1  22.59 
 
 
310 aa  86.3  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.178079  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0577  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  30.88 
 
 
318 aa  85.9  8e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.113372 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0811  ribonucleoside hydrolase 1  25.42 
 
 
318 aa  85.9  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2802  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.6 
 
 
317 aa  85.9  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  0.253524 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0628  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  24.43 
 
 
320 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3658  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.34 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.438551  normal  0.106477 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0386  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.32 
 
 
357 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1555  hypothetical protein  25.74 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1107  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  23.56 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0704  ribonucleoside hydrolase 1  26.11 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0765  ribonucleoside hydrolase 1  26.11 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0778  ribonucleoside hydrolase 1  26.11 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4926  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.38 
 
 
380 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.983704  normal  0.154414 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3770  ribonucleoside hydrolase 1  24.92 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0017  Ribosylpyrimidine nucleosidase  29.11 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1178  ribonucleoside hydrolase 1  29.44 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2367  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.17 
 
 
317 aa  82.8  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0234131 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0814  ribonucleoside hydrolase 1  25.8 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1010  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  24.76 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1443  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  24.85 
 
 
317 aa  82.4  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.52753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01760  nonspecific ribonucleoside hydrolase  26.79 
 
 
329 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000285671  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0220  nonspecific ribonucleoside hydrolase  26.49 
 
 
350 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0018  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  23.96 
 
 
322 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3224  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.57 
 
 
319 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00529527  normal  0.234301 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4253  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.08 
 
 
322 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1071  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  26.21 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0028  Ribosylpyrimidine nucleosidase  26.6 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1652  purine nucleosidase  25.62 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.197736 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0832  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.17 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5150  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  24.93 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3408  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  26.13 
 
 
324 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2125  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  24.83 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.601271  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1840  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.18 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.94695  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2548  putative inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase transmembrane protein  28.95 
 
 
351 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1256  IUNH family nucleoside hydrolase  25.67 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3659  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.16 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.121445  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5234  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.78 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.604929  hitchhiker  0.000866911 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3859  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  24.03 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000304796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>