275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0870 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0870  inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  100 
 
 
308 aa  630  1e-180  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1673  inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  51.95 
 
 
312 aa  315  6e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2208  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  44.37 
 
 
316 aa  281  9e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.703349  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1865  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein  44.55 
 
 
313 aa  273  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2968  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein  44.52 
 
 
313 aa  273  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.290028  normal  0.15342 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2500  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein  43.41 
 
 
313 aa  271  7e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2364  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein  44.52 
 
 
313 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2415  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein  43.41 
 
 
313 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2156  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  44.05 
 
 
312 aa  269  5e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2170  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  43.41 
 
 
312 aa  268  7e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0382277  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2236  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein  43.09 
 
 
312 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2400  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein  43.09 
 
 
312 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2308  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  42.12 
 
 
313 aa  258  7e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.287385  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2350  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  42.12 
 
 
313 aa  258  7e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.987323  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3465  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.62 
 
 
307 aa  212  4.9999999999999996e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4938  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.21 
 
 
307 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.35183  normal  0.16262 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3262  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.91 
 
 
309 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.562048  normal  0.487952 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2802  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.95 
 
 
317 aa  93.6  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  0.253524 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1555  hypothetical protein  25.59 
 
 
379 aa  93.6  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3408  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.1 
 
 
324 aa  93.6  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2125  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  26.69 
 
 
316 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.601271  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2632  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  26.26 
 
 
319 aa  92.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2367  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.52 
 
 
317 aa  89  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0234131 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03052  hypothetical protein  26.99 
 
 
322 aa  89  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1256  IUNH family nucleoside hydrolase  24.83 
 
 
323 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2450  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  25.25 
 
 
441 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1182  IUNH family nucleoside hydrolase  25.25 
 
 
441 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4422  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  26.76 
 
 
321 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2680  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  26.62 
 
 
322 aa  86.7  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0742  putative inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  25.99 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0095  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  23.38 
 
 
372 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0344  ribonucleoside hydrolase RihC  28.17 
 
 
315 aa  82  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2307  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  26.54 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1010  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.5 
 
 
324 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3659  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  26.99 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.121445  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1122  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0154  ribonucleoside hydrolase RihC  29.74 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3476  ribonucleoside hydrolase 1  29.17 
 
 
318 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1962  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  24.41 
 
 
328 aa  75.9  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0577  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  27.15 
 
 
318 aa  75.5  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.113372 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0647  ribonucleoside hydrolase 1  28.7 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0564  Ribosylpyrimidine nucleosidase  23.27 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3306  ribonucleoside hydrolase 1  28.7 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2618  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.33 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1840  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.76 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.94695  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0797  ribonucleoside hydrolase RihC  27.57 
 
 
310 aa  72.4  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0129973  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0660  ribonucleoside hydrolase 1  28.24 
 
 
318 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3716  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.95 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3042  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  24.03 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3900  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  26.35 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.637254  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3579  ribonucleoside hydrolase 1  28.24 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1071  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  22.57 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3626  Ribosylpyrimidine nucleosidase  28.89 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3647  ribonucleoside hydrolase 1  27.78 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410931  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3770  ribonucleoside hydrolase 1  27.91 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3859  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.52 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000304796 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0017  Ribosylpyrimidine nucleosidase  28.83 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4253  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.45 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0006  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  25.88 
 
 
332 aa  69.3  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.194545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0003  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  25.88 
 
 
332 aa  69.3  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00458868  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1804  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.11 
 
 
311 aa  68.9  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.327684 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02091  ribonucleoside hydrolase 2  25.42 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1496  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.42 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0365306  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02050  hypothetical protein  25.42 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4446  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  26.32 
 
 
311 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2309  ribonucleoside hydrolase 2  25.42 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.19142  hitchhiker  0.000812735 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2459  ribonucleoside hydrolase 2  25.42 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1901  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.24 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0234  purine nucleosidase  24.84 
 
 
311 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0228  purine nucleosidase  24.84 
 
 
311 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2298  ribonucleoside hydrolase 2  25.42 
 
 
313 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0811  ribonucleoside hydrolase 1  28.97 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1486  ribonucleoside hydrolase 2  25.42 
 
 
313 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0358178  hitchhiker  0.000862517 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1658  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.35 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2260  IUNH family nucleoside hydrolase  25.82 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3178  ribonucleoside hydrolase 1  29.25 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0624  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  23.21 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3298  ribonucleoside hydrolase 2  25.08 
 
 
313 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0466718  normal  0.0924764 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1006  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  26.43 
 
 
312 aa  67  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0522631  normal  0.0258769 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4026  ribonucleoside hydrolase 1  29.17 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.494882  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3071  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.58 
 
 
389 aa  66.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.474461  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5234  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.77 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.604929  hitchhiker  0.000866911 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0697  ribonucleoside hydrolase 1  28.04 
 
 
335 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1486  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  28.64 
 
 
311 aa  65.9  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0642  ribonucleoside hydrolase RihC  25.43 
 
 
302 aa  65.9  0.0000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0188198  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0028  Ribosylpyrimidine nucleosidase  24.18 
 
 
323 aa  65.9  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1210  ribonucleoside hydrolase 1  23.65 
 
 
310 aa  65.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.178079  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2633  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  24.59 
 
 
338 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0319  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  28.51 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182819 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1971  IUNH family nucleoside hydrolase  24.88 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.260258  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1178  ribonucleoside hydrolase 1  28.85 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0628  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  25.11 
 
 
320 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0768  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  29.13 
 
 
305 aa  64.7  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.933184  normal  0.0267075 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28400  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  22.95 
 
 
320 aa  64.3  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2117  Ribosylpyrimidine nucleosidase  27.14 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1120  ribonucleoside hydrolase 1  38.38 
 
 
312 aa  64.3  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4161  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.85 
 
 
358 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.324907 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0934  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  26.57 
 
 
313 aa  63.5  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0837501  normal  0.0202173 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4926  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  22.22 
 
 
380 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.983704  normal  0.154414 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0017  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  27.06 
 
 
317 aa  63.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>