44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2939 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2939  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 		 190 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.054707  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3057  glyoxalase family protein  70 
 
 		 171 aa  269  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2781  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.3 
 
 		 176 aa  189  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.936196  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1570  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.3 
 
 		 188 aa  185  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7167  putative glyoxylase family protein  43.01 
 
 		 199 aa  176  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.44 
 
 		 166 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2113  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.21 
 
 		 204 aa  158  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00675157  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.36 
 
 		 334 aa  150  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.27 
 
 		 326 aa  143  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3699  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.13 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2044  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.18 
 
 		 173 aa  92.8  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.560784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5442  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.77 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4770  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.41 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2380  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.85 
 
 		 172 aa  74.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.839746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1304  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.82 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.84 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3105  glyoxalase family protein; glyoxalase/bleomycin resistance  28.66 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2737  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.42 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0870171  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0810  methylmalonyl-CoA epimerase  28.57 
 
 		 146 aa  52.4  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3450  glyoxalase family protein  28.66 
 
 		 160 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3197  glyoxalase family protein  28.66 
 
 		 160 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.166092  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.57 
 
 		 545 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.67 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1428  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 		 129 aa  49.7  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0080  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.9 
 
 		 135 aa  48.9  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0295  methylmalonyl-CoA epimerase  22.44 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0498  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.78 
 
 		 135 aa  47.4  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2516  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.69 
 
 		 333 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.308047  normal  0.012324 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0306  methylmalonyl-CoA epimerase  27.14 
 
 		 141 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3258  methylmalonyl-CoA epimerase  26.43 
 
 		 134 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000316472  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4113  methylmalonyl-CoA epimerase  22.61 
 
 		 162 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776501  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3611  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.53 
 
 		 157 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6000  methylmalonyl-CoA epimerase  24.41 
 
 		 143 aa  45.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0251153 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3644  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.41 
 
 		 144 aa  44.7  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.093377  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1852  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.61 
 
 		 133 aa  44.7  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1613  glyoxalase family protein  26.28 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0290  methylmalonyl-CoA epimerase  25.69 
 
 		 133 aa  44.3  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1488  methylmalonyl-CoA epimerase  25.17 
 
 		 134 aa  43.5  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.383789  normal  0.131397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6105  methylmalonyl-CoA epimerase  24.59 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2285  methylmalonyl-CoA epimerase  25.71 
 
 		 140 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000102737  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3321  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  18.49 
 
 		 128 aa  42  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  24.58 
 
 		 137 aa  41.6  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2533  lactoylglutathione lyase  24.49 
 
 		 129 aa  41.2  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3426  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.93 
 
 		 135 aa  41.2  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.386923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>