58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000891 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000891  lactoylglutathione lyase  100 
 
 
161 aa  332  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2713  putative lactoylglutathione lyase  92.55 
 
 
161 aa  310  4.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2766  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  90.68 
 
 
161 aa  306  5.9999999999999995e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3492  glyoxalase family protein  88.82 
 
 
161 aa  303  7e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.145642  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06882  hypothetical protein  84.05 
 
 
163 aa  286  6e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3477  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  81.6 
 
 
163 aa  280  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09323  glyoxalase family protein  50 
 
 
170 aa  161  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3656  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.15 
 
 
167 aa  153  9e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.95819  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2974  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.47 
 
 
181 aa  152  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0696  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.84 
 
 
166 aa  153  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0511121  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0212  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.36 
 
 
165 aa  153  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0275  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.06 
 
 
167 aa  152  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05255  lactoylglutathione lyase  49.04 
 
 
167 aa  151  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0678  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.32 
 
 
174 aa  150  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00775  glyoxalase family protein  48.41 
 
 
171 aa  149  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2561  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.2 
 
 
167 aa  149  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1022  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.22 
 
 
166 aa  147  5e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0996  glyoxalase family protein  45.51 
 
 
166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2365  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.94 
 
 
170 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.87 
 
 
166 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.474087  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0532  glyoxalase family protein  47.13 
 
 
166 aa  142  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3294  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.87 
 
 
167 aa  142  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2876  extracellular solute-binding protein  43.87 
 
 
189 aa  141  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039397 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2044  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.21 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.560784 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1304  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.38 
 
 
175 aa  61.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4770  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.61 
 
 
176 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2773  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.38 
 
 
167 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51788  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2380  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.21 
 
 
172 aa  52  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.839746  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.31 
 
 
545 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2600  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.17 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000115728  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3450  glyoxalase family protein  24.36 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3197  glyoxalase family protein  24.36 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.166092  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0449  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 
139 aa  48.5  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.474975  normal  0.391309 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.97 
 
 
175 aa  47.8  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3105  glyoxalase family protein; glyoxalase/bleomycin resistance  23.72 
 
 
160 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0449  methylmalonyl-CoA epimerase  31.33 
 
 
145 aa  44.7  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6033  glyoxalase I  26.72 
 
 
129 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.705909  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1251  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.4 
 
 
143 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1648  lactoylglutathione lyase  24.67 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137836  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.62 
 
 
334 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2033  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.19 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.543398  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1395  lactoylglutathione lyase  24.83 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.55095 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0307  hypothetical protein  27.21 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0120  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.33 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333418  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3539  glyoxalase I  25.17 
 
 
127 aa  42.4  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  normal  0.0683463 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6081  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.67 
 
 
145 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2201  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
139 aa  41.6  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001198  glyoxylase family protein  25.17 
 
 
127 aa  41.6  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.61 
 
 
131 aa  41.6  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0254493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.15 
 
 
326 aa  41.2  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.17 
 
 
131 aa  41.2  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0261666  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4885  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.36 
 
 
126 aa  41.2  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000885753  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.44 
 
 
134 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717499  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0195  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.81 
 
 
160 aa  40.8  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33780  methylmalonyl-CoA epimerase  32.73 
 
 
145 aa  40.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.749864  normal  0.805501 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3641  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.03 
 
 
352 aa  40.4  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.258218 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2623  lactoylglutathione lyase  25.86 
 
 
129 aa  40.4  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39889  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2605  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.68 
 
 
144 aa  40.4  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123177  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>