50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00775 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00775  glyoxalase family protein  100 
 
 
171 aa  356  9.999999999999999e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0678  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  88.24 
 
 
174 aa  324  3e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0275  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  93.83 
 
 
167 aa  323  6e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05255  lactoylglutathione lyase  89.22 
 
 
167 aa  321  4e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2974  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  87.88 
 
 
181 aa  319  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0696  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  89.63 
 
 
166 aa  318  1.9999999999999998e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0511121  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2365  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  90.74 
 
 
170 aa  318  3e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3294  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  87.43 
 
 
167 aa  317  3e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0996  glyoxalase family protein  88.41 
 
 
166 aa  317  3.9999999999999996e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2561  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  87.95 
 
 
167 aa  316  7.999999999999999e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3656  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  87.65 
 
 
167 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.95819  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1022  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  85.19 
 
 
166 aa  301  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0532  glyoxalase family protein  85.8 
 
 
166 aa  301  4.0000000000000003e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2876  extracellular solute-binding protein  80.47 
 
 
189 aa  298  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039397 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  82.53 
 
 
166 aa  297  4e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.474087  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0212  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  68.29 
 
 
165 aa  248  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09323  glyoxalase family protein  58.9 
 
 
170 aa  205  3e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000891  lactoylglutathione lyase  48.41 
 
 
161 aa  149  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2766  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.51 
 
 
161 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3492  glyoxalase family protein  46.5 
 
 
161 aa  140  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.145642  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3477  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.57 
 
 
163 aa  141  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2713  putative lactoylglutathione lyase  45.86 
 
 
161 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06882  hypothetical protein  46.54 
 
 
163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24 
 
 
150 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130657  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.75 
 
 
164 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2044  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.5 
 
 
173 aa  52  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.560784 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.07 
 
 
175 aa  51.2  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3699  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.25 
 
 
190 aa  50.8  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.34 
 
 
161 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.725625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2339  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 
168 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630848  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4770  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.75 
 
 
176 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3939  methylmalonyl-CoA epimerase  25.32 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.368557  normal  0.0232297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3865  methylmalonyl-CoA epimerase  25.32 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3851  methylmalonyl-CoA epimerase  25.32 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00602371 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0290  methylmalonyl-CoA epimerase  25.68 
 
 
133 aa  45.8  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.65 
 
 
326 aa  45.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  28.91 
 
 
134 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4649  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.15 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.200798  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0498  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.9 
 
 
135 aa  43.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1488  methylmalonyl-CoA epimerase  28.91 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.383789  normal  0.131397 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1251  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.49 
 
 
143 aa  42.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2380  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.83 
 
 
172 aa  42.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.839746  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.72 
 
 
134 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717499  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3104  methylmalonyl-CoA epimerase  48.57 
 
 
163 aa  42  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000698993  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0848  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  21.62 
 
 
155 aa  41.6  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.719524  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4542  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.64 
 
 
160 aa  41.6  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0384  methylmalonyl-CoA epimerase  25.34 
 
 
133 aa  41.6  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0522  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.92 
 
 
134 aa  41.6  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0639  methylmalonyl-CoA epimerase  28.57 
 
 
140 aa  40.8  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.237468  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  21.38 
 
 
334 aa  40.8  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>