48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0275 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0275  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 		 167 aa  349  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2974  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  92.77 
 
 		 181 aa  332  2e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0696  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  93.37 
 
 		 166 aa  332  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0511121  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0678  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  95.09 
 
 		 174 aa  329  9e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05255  lactoylglutathione lyase  95.68 
 
 		 167 aa  326  9e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00775  glyoxalase family protein  93.83 
 
 		 171 aa  323  5e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2365  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  92.12 
 
 		 170 aa  320  4e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2561  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  91.52 
 
 		 167 aa  320  7e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3656  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  88.34 
 
 		 167 aa  309  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.95819  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0996  glyoxalase family protein  87.27 
 
 		 166 aa  309  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3294  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  87.95 
 
 		 167 aa  306  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1022  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  85.98 
 
 		 166 aa  302  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2876  extracellular solute-binding protein  84.76 
 
 		 189 aa  298  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039397 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0532  glyoxalase family protein  84.15 
 
 		 166 aa  296  6e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  83.33 
 
 		 166 aa  292  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.474087  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0212  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  70.48 
 
 		 165 aa  255  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09323  glyoxalase family protein  61.68 
 
 		 170 aa  215  2.9999999999999998e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000891  lactoylglutathione lyase  49.06 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2766  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.57 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2713  putative lactoylglutathione lyase  45.57 
 
 		 161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3492  glyoxalase family protein  46.54 
 
 		 161 aa  144  8.000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.145642  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3477  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.25 
 
 		 163 aa  143  9e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06882  hypothetical protein  47.2 
 
 		 163 aa  137  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.65 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2044  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.48 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.560784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4770  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.7 
 
 		 176 aa  52  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.49 
 
 		 150 aa  52  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.19 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3699  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.92 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2380  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.27 
 
 		 172 aa  48.5  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.839746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0290  methylmalonyl-CoA epimerase  25.68 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26 
 
 		 326 aa  44.7  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.45 
 
 		 161 aa  44.3  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725625 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3104  methylmalonyl-CoA epimerase  51.52 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000698993  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2339  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.14 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630848  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2201  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.9 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  28.91 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0522  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.46 
 
 		 134 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0449  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.58 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.474975  normal  0.391309 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1251  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.16 
 
 		 143 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7167  putative glyoxylase family protein  23.78 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7657  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.1 
 
 		 141 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.644401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4649  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.27 
 
 		 147 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.200798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3851  methylmalonyl-CoA epimerase  24.5 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00602371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3865  methylmalonyl-CoA epimerase  24.5 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3939  methylmalonyl-CoA epimerase  24.5 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.368557  normal  0.0232297 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1488  methylmalonyl-CoA epimerase  27.91 
 
 		 134 aa  41.2  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.383789  normal  0.131397 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4074  methylmalonyl-CoA epimerase  27.34 
 
 		 133 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0584893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>