More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2825 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2825  glyoxylase family protein  100 
 
 
128 aa  265  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.090794  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0610  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  72.66 
 
 
128 aa  200  5e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0012737  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001198  glyoxylase family protein  71.65 
 
 
127 aa  199  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0348  glyoxylase I family protein  72.22 
 
 
127 aa  196  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1233  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  73.81 
 
 
127 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0668602  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2600  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.93 
 
 
134 aa  190  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000115728  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2034  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.84 
 
 
127 aa  187  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2304  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.84 
 
 
127 aa  187  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.866853  normal  0.0730884 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00679  glyoxylase I family protein  69.05 
 
 
127 aa  186  7e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2080  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.05 
 
 
127 aa  186  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.422814  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2291  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.05 
 
 
127 aa  186  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0518  lactoylglutathione lyase (glyoxylase I)  68 
 
 
128 aa  183  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0518  lactoylglutathione lyase (glyoxylase I)  67.2 
 
 
128 aa  183  7e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0574  glyoxylase family protein  68 
 
 
128 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0607  glyoxylase family protein  68 
 
 
128 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2137  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.87 
 
 
127 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2213  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.87 
 
 
127 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.859727 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4160  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.87 
 
 
151 aa  179  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2155  glyoxalase family protein  65.87 
 
 
127 aa  178  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0675  glyoxylase family protein  67.21 
 
 
128 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0734  glyoxylase family protein  67.21 
 
 
136 aa  176  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.784175  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0521  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.21 
 
 
128 aa  176  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4693  glyoxylase family protein  66.39 
 
 
128 aa  176  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.133333  hitchhiker  0.000000000000906955 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1309  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.32 
 
 
128 aa  175  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.35828  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0645  glyoxylase family protein  66.39 
 
 
128 aa  175  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109943  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04140  Glyoxalase/Bleomycin resistance/Dioxygenase superfamily protein  64.57 
 
 
152 aa  172  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0444  glyoxalase I  65.08 
 
 
132 aa  172  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282289  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0453  glyoxalase family protein  65.6 
 
 
130 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3532  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.29 
 
 
127 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00853134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1024  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.49 
 
 
127 aa  169  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808514  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2315  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.71 
 
 
142 aa  168  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00458  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3321  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.9 
 
 
128 aa  167  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2533  lactoylglutathione lyase  60 
 
 
129 aa  165  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42336  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3163  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.79 
 
 
128 aa  164  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2439  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.72 
 
 
129 aa  164  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.509697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4919  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.11 
 
 
129 aa  163  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206926  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2496  glyoxylase I family protein  67.46 
 
 
127 aa  159  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3746  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.6 
 
 
128 aa  157  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0725  hypothetical protein  60.32 
 
 
129 aa  157  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.542377  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0273  hypothetical protein  61.11 
 
 
129 aa  157  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.356475  normal  0.381632 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0257  hypothetical protein  61.11 
 
 
129 aa  156  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0262  hypothetical protein  61.11 
 
 
129 aa  156  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.199971  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0276  hypothetical protein  61.11 
 
 
129 aa  155  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0257  hypothetical protein  61.11 
 
 
129 aa  155  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.74773 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2924  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.2 
 
 
134 aa  155  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3795  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.11 
 
 
128 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.32 
 
 
129 aa  155  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3386  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.8 
 
 
129 aa  154  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27488  normal  0.335444 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3770  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60 
 
 
133 aa  153  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0196484  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0198  hypothetical protein  60.32 
 
 
129 aa  152  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.52 
 
 
129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3416  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.52 
 
 
129 aa  150  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0197  hypothetical protein  59.52 
 
 
129 aa  150  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0191  hypothetical protein  59.52 
 
 
129 aa  150  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0180  hypothetical protein  59.52 
 
 
129 aa  150  5e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3473  hypothetical protein  59.52 
 
 
129 aa  150  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.815895  normal  0.571058 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00185  predicted lyase  59.52 
 
 
129 aa  150  8e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.931309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00184  hypothetical protein  59.52 
 
 
129 aa  150  8e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.883797  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0189  hypothetical protein  58.73 
 
 
129 aa  146  9e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.735348  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1030  glyoxalase family protein  59.2 
 
 
132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1083  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.2 
 
 
132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3418  hypothetical protein  59.2 
 
 
132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0663  glyoxylase family protein  64.36 
 
 
102 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35908e-32 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0667  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.7 
 
 
138 aa  140  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0382094  normal  0.0155955 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0380  lactoylglutathione lyase related lyase  53.23 
 
 
130 aa  138  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0158704  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3343  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.56 
 
 
129 aa  138  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0958  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.56 
 
 
129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2496  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.4 
 
 
129 aa  137  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.130416 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1254  lactoylglutathione lyase or related lyase  50.38 
 
 
131 aa  137  6e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.351089  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0962  glyoxylase family protein  54.41 
 
 
137 aa  136  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.023462  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01792  glyoxylase I family protein  58.49 
 
 
55 aa  71.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41298  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2046  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.92 
 
 
126 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.33743e-17 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2816  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.43 
 
 
318 aa  63.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2686  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 
367 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0498  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.33 
 
 
135 aa  61.2  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1057  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.59 
 
 
326 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4638  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.38 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103381  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2682  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.71 
 
 
165 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0832367  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1155  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.87 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3147  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.82 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122819 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6102  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
136 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.614364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0408  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.46 
 
 
191 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322497  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1384  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.78 
 
 
317 aa  57.4  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00603992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1224  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.59 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  hitchhiker  0.00727014 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10278  hypothetical protein  30.46 
 
 
207 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00492026  normal  0.278062 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2649  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.62 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000551252  normal  0.306748 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1423  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 
160 aa  55.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1275  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.33 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.85 
 
 
131 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0261666  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2027  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.3 
 
 
308 aa  55.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2154  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.1 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2177  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.85 
 
 
126 aa  54.7  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.66024  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2319  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.46 
 
 
324 aa  54.3  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2477  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.41 
 
 
184 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000526375  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3244  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.53 
 
 
127 aa  53.9  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114277  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01756  hypothetical protein  32.84 
 
 
180 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.473381 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2527  hypothetical protein  32.33 
 
 
176 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0933862 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1483  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.94 
 
 
180 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.089517  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1633  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.03 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.138703 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0332  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.14 
 
 
191 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>