92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1735 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_1735  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
117 aa  239  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151578  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4319  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  71.55 
 
 
118 aa  173  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201964  normal  0.363116 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  68.38 
 
 
118 aa  170  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0380  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  70.43 
 
 
118 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3642  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  68.38 
 
 
118 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0295152  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1798  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.52 
 
 
118 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448615  normal  0.770527 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2110  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.91 
 
 
119 aa  167  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.890858  normal  0.0161954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2352  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.96 
 
 
120 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0361891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2097  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  68.18 
 
 
117 aa  157  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0146  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.73 
 
 
122 aa  142  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265259  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4750  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.85 
 
 
146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.116089  hitchhiker  0.0000231054 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0771  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.86 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727814  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0991  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.82 
 
 
133 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02675  glyoxalase/dioxygenase superfamily protein  51.35 
 
 
119 aa  119  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1506  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.56 
 
 
116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00430807  normal  0.832914 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2036  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.54 
 
 
116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000445701  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2852  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.43 
 
 
120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1898  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.73 
 
 
120 aa  118  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118607  normal  0.864819 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0502  glyoxalase family protein  53.21 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0492338  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0364  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.45 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.783367  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3147  glyoxalase family protein  50.46 
 
 
122 aa  115  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0839  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.35 
 
 
124 aa  115  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146537  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000700  glyoxalase family protein  49.09 
 
 
118 aa  114  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0789931  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0499  glyoxalase family protein  53.21 
 
 
113 aa  114  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2654  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.55 
 
 
117 aa  113  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0301786 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3900  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.35 
 
 
117 aa  113  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00105604  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0880  hypothetical protein  48.18 
 
 
119 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1836  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.85 
 
 
116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.824589  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2575  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.79 
 
 
115 aa  111  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00187079  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.46 
 
 
116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.200314  normal  0.0153203 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1692  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.46 
 
 
116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.43805  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1566  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.49 
 
 
116 aa  110  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.570273  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2104  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.3 
 
 
115 aa  110  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1602  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.22 
 
 
120 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00273074  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1521  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.21 
 
 
119 aa  110  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.936574 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3959  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.65 
 
 
141 aa  110  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2483  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.9 
 
 
115 aa  110  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.100026  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1714  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.54 
 
 
116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0179217  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2413  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.9 
 
 
115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00307776  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2793  glyoxalase family protein  46.9 
 
 
115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0825  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.34 
 
 
133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.947605  hitchhiker  0.000446101 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3658  glyoxalase/dioxygenase superfamily protein  46.02 
 
 
119 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542995  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2366  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.27 
 
 
118 aa  108  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7578  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.85 
 
 
127 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.848256  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1602  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.85 
 
 
123 aa  105  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.924243  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1598  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.04 
 
 
116 aa  105  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.548689  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06581  hypothetical protein  43.36 
 
 
119 aa  104  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1677  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.46 
 
 
116 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.108123  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3615  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.62 
 
 
107 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199635  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0511  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.21 
 
 
115 aa  99  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.815455 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4204  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.38 
 
 
121 aa  98.2  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.377514  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0570  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.48 
 
 
118 aa  96.7  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.973299 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1684  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.86 
 
 
121 aa  90.1  9e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.178699  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01266  glyoxalase family protein  56 
 
 
56 aa  63.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4804  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.06 
 
 
260 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22560  lactoylglutathione lyase family protein  31.62 
 
 
265 aa  51.2  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.438518  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1540  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.58 
 
 
121 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.620388  normal  0.0602433 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5355  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 
265 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0543  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.09 
 
 
259 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000696806 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2719  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.51 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.956111  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2833  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 
275 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.581429 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3565  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.14 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.277784  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6100  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.46 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2736  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.48 
 
 
255 aa  47.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.77414  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1261  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.68 
 
 
127 aa  47.8  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.66307  normal  0.800793 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1848  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.78 
 
 
123 aa  47.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.538591  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05760  lactoylglutathione lyase family protein  30.36 
 
 
263 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0680  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2353  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.9 
 
 
275 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201801  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3433  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.66 
 
 
123 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.342021  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1488  glyoxalase  33.33 
 
 
247 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.457468  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0138  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.35 
 
 
247 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.516384  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7974  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.35 
 
 
265 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1826  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
123 aa  43.5  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.145544  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2866  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.68 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.041772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4140  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.127243  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4951  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.83 
 
 
280 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.366376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4111  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.68 
 
 
122 aa  42  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0482478  normal  0.0854177 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3443  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.09 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000434489  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4507  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.17 
 
 
262 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal  0.535957 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4078  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.82 
 
 
252 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01265  hypothetical protein  48.72 
 
 
51 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2058  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.77 
 
 
256 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.923308  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2697  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.06 
 
 
128 aa  41.2  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.276561  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0463  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.59 
 
 
119 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1712  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.51 
 
 
240 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2905  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.93 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0619  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.83 
 
 
173 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0673  hypothetical protein  26.09 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3616  glyoxalase domain protein  27.35 
 
 
117 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000383151  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4002  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.66 
 
 
129 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0263  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.7 
 
 
258 aa  40.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>