72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2483 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2483  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
115 aa  241  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.100026  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2413  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  99.13 
 
 
115 aa  239  7e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00307776  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2575  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  94.78 
 
 
115 aa  230  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00187079  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2793  glyoxalase family protein  87.83 
 
 
115 aa  213  7e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1566  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  76.11 
 
 
116 aa  182  9e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.570273  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  73.45 
 
 
116 aa  181  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.200314  normal  0.0153203 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1692  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  73.45 
 
 
116 aa  181  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.43805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1714  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  72.57 
 
 
116 aa  180  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0179217  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2036  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  70.18 
 
 
116 aa  176  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000445701  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1598  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.37 
 
 
116 aa  167  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.548689  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1677  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  74.34 
 
 
116 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.108123  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1602  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  68.14 
 
 
120 aa  167  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00273074  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1836  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.62 
 
 
116 aa  147  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.824589  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1506  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.93 
 
 
116 aa  147  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00430807  normal  0.832914 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2104  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.82 
 
 
115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1898  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.41 
 
 
120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118607  normal  0.864819 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3658  glyoxalase/dioxygenase superfamily protein  55.65 
 
 
119 aa  142  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542995  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2366  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.75 
 
 
118 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2654  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.91 
 
 
117 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0301786 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4750  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.87 
 
 
146 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.116089  hitchhiker  0.0000231054 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3147  glyoxalase family protein  56.88 
 
 
122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0880  hypothetical protein  50.44 
 
 
119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0991  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.35 
 
 
133 aa  123  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4319  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.79 
 
 
118 aa  122  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201964  normal  0.363116 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1798  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.15 
 
 
118 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448615  normal  0.770527 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.15 
 
 
118 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000700  glyoxalase family protein  50 
 
 
118 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0789931  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2852  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.79 
 
 
120 aa  120  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02675  glyoxalase/dioxygenase superfamily protein  49.09 
 
 
119 aa  120  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3642  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.25 
 
 
118 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0295152  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06581  hypothetical protein  50.88 
 
 
119 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1602  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.07 
 
 
123 aa  110  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.924243  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0771  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.33 
 
 
115 aa  110  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727814  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1735  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.9 
 
 
117 aa  110  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151578  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2097  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  49.12 
 
 
117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1521  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.43 
 
 
119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.936574 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0364  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.45 
 
 
114 aa  107  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.783367  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7578  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.37 
 
 
127 aa  106  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.848256  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0502  glyoxalase family protein  47.79 
 
 
135 aa  105  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0492338  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0499  glyoxalase family protein  47.79 
 
 
113 aa  104  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2110  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.54 
 
 
119 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.890858  normal  0.0161954 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0380  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.54 
 
 
118 aa  103  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0146  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.02 
 
 
122 aa  103  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265259  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0839  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.22 
 
 
124 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146537  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3959  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.22 
 
 
141 aa  103  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2352  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.05 
 
 
120 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0361891 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0511  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.75 
 
 
115 aa  100  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.815455 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0825  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.87 
 
 
133 aa  100  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.947605  hitchhiker  0.000446101 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3900  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.59 
 
 
117 aa  99.8  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00105604  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1684  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.88 
 
 
121 aa  98.6  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.178699  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0570  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.12 
 
 
118 aa  95.5  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.973299 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3615  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.85 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199635  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4204  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.96 
 
 
121 aa  80.1  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.377514  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01266  glyoxalase family protein  53.06 
 
 
56 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6100  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.06 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4951  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.83 
 
 
280 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.366376 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10929  hypothetical protein  28.83 
 
 
257 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1826  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.2 
 
 
123 aa  52  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.145544  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8594  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.59 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6117  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.59 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2736  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.27 
 
 
255 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.77414  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1921  lactoylglutathione lyase-related protein  26.67 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.316904  normal  0.438437 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2719  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.55 
 
 
122 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.956111  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0880  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.4 
 
 
122 aa  43.9  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3215  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.24 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00475953  hitchhiker  0.0000000441554 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3433  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.32 
 
 
123 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.342021  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8806  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.77 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4457  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.84 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.728285  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0383  glyoxalase  29.29 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2765  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000201247 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2807  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.3 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0659632  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1540  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.96 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.620388  normal  0.0602433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>