71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0383 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0383  glyoxalase  100 
 
 		 126 aa  256  5.0000000000000005e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1281  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.9 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3031  glyoxalase  36.29 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116954  normal  0.49404 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0233  glyoxalase  34.15 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.345356  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25870  lactoylglutathione lyase family protein  34.38 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0891  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.26 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.740664  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1921  lactoylglutathione lyase-related protein  32 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.316904  normal  0.438437 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4587  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.91 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1463  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.71 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0880  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0172  hypothetical protein  34.19 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6864  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.54 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2765  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.2 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000201247 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3064  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.58 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0158866  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4951  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.66 
 
 		 280 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.366376 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0188  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.4 
 
 		 264 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0421  putative glyoxalase  28.81 
 
 		 259 aa  48.9  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2058  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.09 
 
 		 256 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.923308  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3646  hypothetical protein  26.67 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3491  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.91 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1554  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.03 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0481  glyoxalase, putative  28.81 
 
 		 259 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681651  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3486  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.64 
 
 		 258 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506054  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1434  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.69 
 
 		 262 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0263  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.4 
 
 		 258 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0348  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.78 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3658  glyoxalase/dioxygenase superfamily protein  30.36 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542995  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6217  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 		 263 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.346808 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21960  lactoylglutathione lyase family protein  24.39 
 
 		 286 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3443  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.21 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000434489  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2807  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.63 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0659632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1508  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.97 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1540  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.79 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.620388  normal  0.0602433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1826  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.59 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.145544  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1602  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.02 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.924243  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2366  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.79 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3477  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.2 
 
 		 258 aa  45.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0818  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.05 
 
 		 259 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685405  normal  0.7095 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10929  hypothetical protein  28.81 
 
 		 257 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.200314  normal  0.0153203 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1692  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.43805  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3433  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.93 
 
 		 123 aa  43.5  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.342021  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4457  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.73 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.728285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1598  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.27 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.548689  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2483  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.29 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.100026  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2413  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.29 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00307776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0931  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.21 
 
 		 259 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.951894  normal  0.87106 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2733  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.98 
 
 		 253 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3533  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.42 
 
 		 259 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1714  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0179217  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22560  lactoylglutathione lyase family protein  23.97 
 
 		 265 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.438518  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2577  glyoxalase family protein  28.21 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000159836  normal  0.260305 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2654  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.41 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0301786 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3512  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.79 
 
 		 260 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2795  glyoxalase family protein  27.59 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2575  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.28 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00187079  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1937  hypothetical protein  26.09 
 
 		 125 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36707  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4857  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.83 
 
 		 263 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.341026  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0511  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 		 115 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.815455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2485  glyoxalase family protein  27.35 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000210629  normal  0.192159 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2415  glyoxalase family protein  27.35 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.016356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3990  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.27 
 
 		 260 aa  41.2  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1506  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.28 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00430807  normal  0.832914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2270  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.83 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33899 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3011  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.56 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1690  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.35 
 
 		 126 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.750812  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1675  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.35 
 
 		 126 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0208762  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0589  hypothetical protein  27.12 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2667  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.64 
 
 		 126 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0361877  normal  0.0155451 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2409  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.17 
 
 		 254 aa  40  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>