77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1506 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_1506  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
116 aa  239  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00430807  normal  0.832914 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1598  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.79 
 
 
116 aa  166  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.548689  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2036  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.21 
 
 
116 aa  164  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000445701  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1602  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.52 
 
 
120 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00273074  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.07 
 
 
116 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.200314  normal  0.0153203 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1692  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.07 
 
 
116 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.43805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1714  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.07 
 
 
116 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0179217  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1836  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.93 
 
 
116 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.824589  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2793  glyoxalase family protein  61.21 
 
 
115 aa  153  9e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1566  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.34 
 
 
116 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.570273  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1677  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.34 
 
 
116 aa  150  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.108123  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2575  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.71 
 
 
115 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00187079  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2413  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.93 
 
 
115 aa  148  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00307776  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2483  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.93 
 
 
115 aa  147  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.100026  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2104  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.62 
 
 
115 aa  142  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0991  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.91 
 
 
133 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4750  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.76 
 
 
146 aa  142  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.116089  hitchhiker  0.0000231054 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2654  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.77 
 
 
117 aa  141  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0301786 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3147  glyoxalase family protein  55.65 
 
 
122 aa  137  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2366  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.03 
 
 
118 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1898  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.31 
 
 
120 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118607  normal  0.864819 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0880  hypothetical protein  50.86 
 
 
119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3658  glyoxalase/dioxygenase superfamily protein  51.79 
 
 
119 aa  127  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542995  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0364  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.03 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.783367  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06581  hypothetical protein  47.41 
 
 
119 aa  120  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2110  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.63 
 
 
119 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.890858  normal  0.0161954 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02675  glyoxalase/dioxygenase superfamily protein  48.28 
 
 
119 aa  119  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1735  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.56 
 
 
117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151578  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2852  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.28 
 
 
120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2352  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.51 
 
 
120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0361891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2097  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  47.83 
 
 
117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1798  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
118 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448615  normal  0.770527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4319  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.67 
 
 
118 aa  116  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201964  normal  0.363116 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000700  glyoxalase family protein  47.41 
 
 
118 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0789931  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.11 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3642  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
118 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0295152  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0380  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.12 
 
 
118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0839  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.17 
 
 
124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146537  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0771  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.58 
 
 
115 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727814  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0502  glyoxalase family protein  48.21 
 
 
135 aa  108  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0492338  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0825  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.31 
 
 
133 aa  108  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.947605  hitchhiker  0.000446101 
 
 
-
 
NC_004310  BR0499  glyoxalase family protein  46.61 
 
 
113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0146  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.96 
 
 
122 aa  107  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265259  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0570  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.38 
 
 
118 aa  107  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.973299 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1521  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.25 
 
 
119 aa  106  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.936574 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3615  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.18 
 
 
107 aa  103  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199635  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0511  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.43 
 
 
115 aa  102  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.815455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3959  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.67 
 
 
141 aa  100  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3900  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.23 
 
 
117 aa  100  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00105604  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1602  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.33 
 
 
123 aa  99.4  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.924243  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7578  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.5 
 
 
127 aa  97.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.848256  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1684  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.67 
 
 
121 aa  96.3  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.178699  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4204  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.6 
 
 
121 aa  90.1  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.377514  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01266  glyoxalase family protein  51.02 
 
 
56 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6100  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.43 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5355  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.91 
 
 
265 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2736  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.4 
 
 
255 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.77414  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2719  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.45 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.956111  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0880  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.59 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3433  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.55 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.342021  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4951  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.23 
 
 
280 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.366376 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0487  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.68 
 
 
253 aa  42  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.863023  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22560  lactoylglutathione lyase family protein  32.81 
 
 
265 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.438518  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10929  hypothetical protein  26.13 
 
 
257 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3078  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.13 
 
 
141 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2973  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.13 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.196846  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3443  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000434489  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0383  glyoxalase  28.28 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2765  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000201247 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3491  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.89 
 
 
122 aa  40.4  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01265  hypothetical protein  44.44 
 
 
51 aa  40.8  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2397  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.35 
 
 
288 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2796  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.32 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1566  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.79 
 
 
123 aa  40  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1598  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.79 
 
 
123 aa  40  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2807  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  21.74 
 
 
194 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64364  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>