71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2793 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2793  glyoxalase family protein  100 
 
 		 115 aa  239  7.999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2575  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  88.7 
 
 		 115 aa  218  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00187079  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2413  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  87.83 
 
 		 115 aa  213  5e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00307776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2483  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  87.83 
 
 		 115 aa  213  7e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.100026  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  75.86 
 
 		 116 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.200314  normal  0.0153203 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1692  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  75.86 
 
 		 116 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.43805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1714  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  74.14 
 
 		 116 aa  186  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0179217  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1566  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  73.68 
 
 		 116 aa  178  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.570273  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2036  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.67 
 
 		 116 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000445701  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1677  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  75.86 
 
 		 116 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.108123  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1602  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.79 
 
 		 120 aa  166  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00273074  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1598  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.79 
 
 		 116 aa  165  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.548689  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1506  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.21 
 
 		 116 aa  153  9e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00430807  normal  0.832914 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1898  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.18 
 
 		 120 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118607  normal  0.864819 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3658  glyoxalase/dioxygenase superfamily protein  57.39 
 
 		 119 aa  143  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542995  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2654  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.52 
 
 		 117 aa  142  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0301786 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2104  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.62 
 
 		 115 aa  142  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1836  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.75 
 
 		 116 aa  140  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.824589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4750  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.75 
 
 		 146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.116089  hitchhiker  0.0000231054 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2366  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.1 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0880  hypothetical protein  51.72 
 
 		 119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0991  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.73 
 
 		 133 aa  124  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3147  glyoxalase family protein  55.75 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2852  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.25 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06581  hypothetical protein  50.88 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0771  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.36 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727814  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1798  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.56 
 
 		 118 aa  114  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448615  normal  0.770527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4319  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.44 
 
 		 118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201964  normal  0.363116 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02675  glyoxalase/dioxygenase superfamily protein  47.41 
 
 		 119 aa  114  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.56 
 
 		 118 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3642  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.56 
 
 		 118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0295152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000700  glyoxalase family protein  47.37 
 
 		 118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0789931  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1735  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.9 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2097  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  47.41 
 
 		 117 aa  106  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0502  glyoxalase family protein  50 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0492338  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2352  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.25 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0361891 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1521  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.57 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.936574 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2110  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.25 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.890858  normal  0.0161954 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3900  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.13 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00105604  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_004310  BR0499  glyoxalase family protein  50 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0364  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 		 114 aa  103  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.783367  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1602  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.02 
 
 		 123 aa  103  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.924243  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0839  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.02 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146537  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0146  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.13 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7578  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.5 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.848256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0380  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.86 
 
 		 118 aa  98.2  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0511  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.25 
 
 		 115 aa  98.2  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.815455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3959  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.34 
 
 		 141 aa  97.4  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0570  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.04 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.973299 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3615  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.18 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1684  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.38 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.178699  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0825  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.64 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.947605  hitchhiker  0.000446101 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4204  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.09 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.377514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01266  glyoxalase family protein  53.06 
 
 		 56 aa  54.3  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10929  hypothetical protein  30.09 
 
 		 257 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1826  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.91 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.145544  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6100  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.69 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4951  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.13 
 
 		 280 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.366376 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0880  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8594  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.95 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6117  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.95 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1540  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.91 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.620388  normal  0.0602433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1921  lactoylglutathione lyase-related protein  26.27 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.316904  normal  0.438437 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.83 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.628816  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8806  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.5 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0170  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.7 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0309396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3433  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.19 
 
 		 123 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.342021  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2719  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.35 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.956111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4457  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.28 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.728285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01265  hypothetical protein  45.71 
 
 		 51 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5064  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.78 
 
 		 421 aa  40  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>