75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1598 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_1598  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
116 aa  240  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.548689  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2036  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  71.55 
 
 
116 aa  180  6e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000445701  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1602  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  68.7 
 
 
120 aa  176  8e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00273074  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1566  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.38 
 
 
116 aa  174  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.570273  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1714  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.38 
 
 
116 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0179217  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1692  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.52 
 
 
116 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.43805  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.52 
 
 
116 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.200314  normal  0.0153203 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2413  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.26 
 
 
115 aa  169  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00307776  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2483  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.37 
 
 
115 aa  167  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.100026  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1506  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.79 
 
 
116 aa  166  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00430807  normal  0.832914 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2793  glyoxalase family protein  65.79 
 
 
115 aa  165  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2575  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.37 
 
 
115 aa  165  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00187079  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1677  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.38 
 
 
116 aa  159  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.108123  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2104  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.66 
 
 
115 aa  158  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4750  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.34 
 
 
146 aa  155  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.116089  hitchhiker  0.0000231054 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1836  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.07 
 
 
116 aa  154  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.824589  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2366  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.93 
 
 
118 aa  154  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0991  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.03 
 
 
133 aa  140  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2654  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.26 
 
 
117 aa  138  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0301786 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0880  hypothetical protein  50.86 
 
 
119 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1898  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.9 
 
 
120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118607  normal  0.864819 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3658  glyoxalase/dioxygenase superfamily protein  55.26 
 
 
119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542995  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3147  glyoxalase family protein  53.04 
 
 
122 aa  137  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06581  hypothetical protein  52.59 
 
 
119 aa  131  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000700  glyoxalase family protein  50 
 
 
118 aa  128  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0789931  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2852  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.28 
 
 
120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0364  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.45 
 
 
114 aa  118  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.783367  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02675  glyoxalase/dioxygenase superfamily protein  45.69 
 
 
119 aa  115  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1521  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
119 aa  115  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.936574 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0771  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
115 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727814  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4319  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.13 
 
 
118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201964  normal  0.363116 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0146  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.02 
 
 
122 aa  110  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265259  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0502  glyoxalase family protein  47.46 
 
 
135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0492338  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0825  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.27 
 
 
133 aa  109  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.947605  hitchhiker  0.000446101 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2097  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  43.59 
 
 
117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0839  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.5 
 
 
124 aa  108  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146537  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_004310  BR0499  glyoxalase family protein  47.46 
 
 
113 aa  108  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1798  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.95 
 
 
118 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448615  normal  0.770527 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.95 
 
 
118 aa  105  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1735  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.04 
 
 
117 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151578  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3900  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.86 
 
 
117 aa  104  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00105604  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0380  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.86 
 
 
118 aa  103  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3642  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.14 
 
 
118 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0295152  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1602  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.7 
 
 
123 aa  101  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.924243  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3615  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.65 
 
 
107 aa  101  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199635  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2352  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.98 
 
 
120 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0361891 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2110  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.59 
 
 
119 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.890858  normal  0.0161954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7578  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.34 
 
 
127 aa  100  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.848256  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3959  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.53 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0511  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.04 
 
 
115 aa  97.8  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.815455 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0570  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.12 
 
 
118 aa  94  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.973299 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1684  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.18 
 
 
121 aa  92.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.178699  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4204  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.66 
 
 
121 aa  87.4  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.377514  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01266  glyoxalase family protein  53.06 
 
 
56 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6117  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.64 
 
 
128 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6100  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.81 
 
 
125 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1764  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.96 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298877  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8594  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.05 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8806  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.67 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0145  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.17 
 
 
121 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22560  lactoylglutathione lyase family protein  28.45 
 
 
265 aa  45.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.438518  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3438  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2736  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.36 
 
 
255 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.77414  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4951  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.03 
 
 
280 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.366376 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3064  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.79 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0158866  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0383  glyoxalase  27.27 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1281  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.28 
 
 
131 aa  42.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3747  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.05 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0680  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.32 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2765  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.05 
 
 
144 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000201247 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1826  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.97 
 
 
123 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.145544  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0543  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.13 
 
 
259 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000696806 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01265  hypothetical protein  47.22 
 
 
51 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10929  hypothetical protein  24.32 
 
 
257 aa  40.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0263  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.03 
 
 
258 aa  40  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>