78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1898 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1898  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 		 120 aa  244  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118607  normal  0.864819 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0880  hypothetical protein  63.79 
 
 		 119 aa  165  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4750  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.34 
 
 		 146 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.116089  hitchhiker  0.0000231054 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06581  hypothetical protein  62.07 
 
 		 119 aa  160  8.000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000700  glyoxalase family protein  59.48 
 
 		 118 aa  154  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0789931  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3658  glyoxalase/dioxygenase superfamily protein  61.06 
 
 		 119 aa  154  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542995  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2654  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.39 
 
 		 117 aa  151  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0301786 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0991  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.95 
 
 		 133 aa  150  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2366  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.03 
 
 		 118 aa  149  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2793  glyoxalase family protein  60.18 
 
 		 115 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2036  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.76 
 
 		 116 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000445701  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2575  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.29 
 
 		 115 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00187079  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2483  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.41 
 
 		 115 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.100026  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2413  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.41 
 
 		 115 aa  144  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00307776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1714  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.76 
 
 		 116 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0179217  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3147  glyoxalase family protein  56.52 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1692  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.9 
 
 		 116 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.43805  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2665  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.9 
 
 		 116 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.200314  normal  0.0153203 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1602  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.64 
 
 		 120 aa  140  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00273074  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02675  glyoxalase/dioxygenase superfamily protein  56.03 
 
 		 119 aa  140  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1566  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.03 
 
 		 116 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.570273  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1836  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.17 
 
 		 116 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.824589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1598  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.9 
 
 		 116 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.548689  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1677  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.76 
 
 		 116 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.108123  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1506  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.31 
 
 		 116 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00430807  normal  0.832914 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0364  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.16 
 
 		 114 aa  130  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.783367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2852  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.24 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0771  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.52 
 
 		 115 aa  123  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727814  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2104  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.72 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0502  glyoxalase family protein  55.75 
 
 		 135 aa  120  6e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0492338  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1521  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.1 
 
 		 119 aa  120  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.936574 
 
 
-
 
NC_004310  BR0499  glyoxalase family protein  54.24 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1735  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.73 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2097  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  48.67 
 
 		 117 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327341  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2352  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.55 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0361891 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3615  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.86 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2110  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.45 
 
 		 119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.890858  normal  0.0161954 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0380  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0570  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.973299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.05 
 
 		 118 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1798  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.05 
 
 		 118 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448615  normal  0.770527 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0146  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.69 
 
 		 122 aa  103  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4319  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.54 
 
 		 118 aa  103  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201964  normal  0.363116 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0511  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.86 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.815455 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3642  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.14 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0295152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3900  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.71 
 
 		 117 aa  99.4  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00105604  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0839  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.59 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146537  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1602  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.22 
 
 		 123 aa  97.1  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.924243  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0825  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.22 
 
 		 133 aa  97.1  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.947605  hitchhiker  0.000446101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7578  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.17 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.848256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1684  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.62 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.178699  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3959  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.32 
 
 		 141 aa  90.5  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4204  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.88 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.377514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01266  glyoxalase family protein  59.18 
 
 		 56 aa  64.7  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1281  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.62 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6100  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.96 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5355  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.64 
 
 		 265 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1826  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.66 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.145544  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3990  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.82 
 
 		 260 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2736  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 		 255 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.77414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3433  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.09 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.342021  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2706  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.43 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1556  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.43 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1562  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.43 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1756  glyoxalase family protein  30.43 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1591  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.43 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2719  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.07 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.956111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2788  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.43 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.910627 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2540  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.43 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2607  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.43 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3901  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.07 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10929  hypothetical protein  27.93 
 
 		 257 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01265  hypothetical protein  51.52 
 
 		 51 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3399  glyoxalase family protein  27.78 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2543  glyoxalase family protein  27.19 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.7 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205031  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4951  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.5 
 
 		 280 aa  40.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.366376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4549  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.91 
 
 		 258 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>