80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3399 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3399  glyoxalase family protein  100 
 
 
127 aa  265  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3144  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.87 
 
 
128 aa  152  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1756  glyoxalase family protein  58.4 
 
 
129 aa  152  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2787  glyoxalase family protein  53.6 
 
 
127 aa  146  8e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1591  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.6 
 
 
127 aa  146  9e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1556  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.6 
 
 
127 aa  146  9e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2788  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.6 
 
 
127 aa  146  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.910627 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1562  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.6 
 
 
127 aa  146  9e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.6 
 
 
127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205031  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2706  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.8 
 
 
127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2607  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.8 
 
 
127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2540  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.8 
 
 
127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2543  glyoxalase family protein  56.35 
 
 
139 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1190  glyoxalase family protein  49.61 
 
 
127 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.939066  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.72 
 
 
121 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0449  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.72 
 
 
121 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.857663  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0509  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.84 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2907  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.61 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2796  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.65 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2501  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.75 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.517764 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2538  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.4 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7086  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.06 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.678926 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4043  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.58 
 
 
132 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.776404  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2011  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.48 
 
 
127 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2671  hypothetical protein  35.04 
 
 
131 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.283114  normal  0.58691 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4002  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.58 
 
 
129 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3901  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.58 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0695  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.33 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.483535  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1411  putative glyoxalase  31.71 
 
 
130 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1712  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.9 
 
 
240 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4004  hypothetical protein  29.51 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6709  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.71 
 
 
136 aa  58.9  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.29 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0172  hypothetical protein  30.95 
 
 
125 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1191  hypothetical protein  32.48 
 
 
122 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.889775  hitchhiker  0.00000394377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1826  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.93 
 
 
123 aa  55.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.145544  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1508  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.59 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0622  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.81 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594994  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0597  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.81 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1263  hypothetical protein  26.45 
 
 
130 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2552  hypothetical protein  26.83 
 
 
130 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3382  hypothetical protein  26.83 
 
 
130 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00775023  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3347  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.83 
 
 
136 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.725063  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0595  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.71 
 
 
137 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.771439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0285  hypothetical protein  26.83 
 
 
130 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3388  hypothetical protein  28.57 
 
 
347 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3646  hypothetical protein  30.65 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3600  hypothetical protein  34.75 
 
 
126 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.947186  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2678  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.97 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1937  hypothetical protein  34.38 
 
 
125 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36707  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0589  hypothetical protein  34.13 
 
 
126 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1148  hypothetical protein  28.57 
 
 
300 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.536905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42870  hypothetical protein  34.75 
 
 
126 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.948104 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2270  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.23 
 
 
127 aa  50.8  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.33899 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4164  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.91 
 
 
120 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.648232  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4029  hypothetical protein  29.32 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118399  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0222  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.12 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.660505  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0706  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.12 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242399  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0673  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.12 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3792  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.27 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.500886  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4018  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.41 
 
 
263 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0241632 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3512  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.69 
 
 
260 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10929  hypothetical protein  28.45 
 
 
257 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3433  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.37 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.342021  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1387  hypothetical protein  29.69 
 
 
126 aa  45.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.712354  normal  0.0522494 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4951  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.91 
 
 
280 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.366376 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0170  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.68 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0309396  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1554  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.71 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1602  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.81 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.924243  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22560  lactoylglutathione lyase family protein  26.4 
 
 
265 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.438518  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25870  lactoylglutathione lyase family protein  28.7 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0680  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3635  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.83 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0348  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.13 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1898  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.78 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118607  normal  0.864819 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.81 
 
 
129 aa  40.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.628816  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1839  hypothetical protein  27.13 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1518  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.13 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.902517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7578  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.19 
 
 
127 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.848256  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1520  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.91 
 
 
127 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000677002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>