70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2787 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2787  glyoxalase family protein  100 
 
 		 127 aa  263  8e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3144  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  75.81 
 
 		 128 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2543  glyoxalase family protein  63.41 
 
 		 139 aa  166  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1756  glyoxalase family protein  60.8 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2788  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.6 
 
 		 127 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.910627 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1562  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.6 
 
 		 127 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1556  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.6 
 
 		 127 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1591  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.6 
 
 		 127 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.6 
 
 		 127 aa  163  9e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205031  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2540  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.6 
 
 		 127 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2607  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.6 
 
 		 127 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2706  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.6 
 
 		 127 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1190  glyoxalase family protein  57.14 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.939066  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3399  glyoxalase family protein  53.6 
 
 		 127 aa  146  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.84 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0449  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.84 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.857663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0509  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.84 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4043  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.96 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.776404  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4002  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.96 
 
 		 129 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3901  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.46 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1263  hypothetical protein  28.81 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2552  hypothetical protein  29.66 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3382  hypothetical protein  29.66 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00775023  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0285  hypothetical protein  29.66 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1191  hypothetical protein  31.58 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.889775  hitchhiker  0.00000394377 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3347  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.66 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.725063  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3388  hypothetical protein  32.5 
 
 		 347 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1148  hypothetical protein  32.5 
 
 		 300 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.536905  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2538  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.09 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0695  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.25 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.483535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1411  putative glyoxalase  37.4 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3600  hypothetical protein  34.45 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.947186  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0622  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.31 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0597  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.31 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42870  hypothetical protein  34.45 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.948104 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0222  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.09 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.660505  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0673  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.09 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0706  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.09 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242399  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4004  hypothetical protein  30.25 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3792  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.25 
 
 		 136 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.500886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2011  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.88 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7086  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.33 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.678926 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2678  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.59 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0172  hypothetical protein  32.79 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2270  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.16 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1712  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.51 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0589  hypothetical protein  34.96 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2796  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.62 
 
 		 123 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6709  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.51 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3646  hypothetical protein  29.84 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4164  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.17 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.648232  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1508  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.2 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1554  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.45 
 
 		 123 aa  52.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1937  hypothetical protein  31.45 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36707  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2907  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4029  hypothetical protein  28.68 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118399  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0595  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.43 
 
 		 137 aa  50.4  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.771439  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2501  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.2 
 
 		 131 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.517764 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1387  hypothetical protein  29.13 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.712354  normal  0.0522494 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2671  hypothetical protein  28 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.283114  normal  0.58691 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2807  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.03 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0659632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1826  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.37 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.145544  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1839  hypothetical protein  29.69 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1518  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.69 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.902517 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.67 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10929  hypothetical protein  29.6 
 
 		 257 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3512  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.58 
 
 		 260 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1520  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.23 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000677002 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4951  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.56 
 
 		 280 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.366376 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0673  hypothetical protein  22.31 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>