89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1937 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1937  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  261  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36707  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0589  hypothetical protein  61.6 
 
 		 126 aa  176  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1387  hypothetical protein  62.9 
 
 		 126 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.712354  normal  0.0522494 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3646  hypothetical protein  60.33 
 
 		 127 aa  155  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4029  hypothetical protein  55.91 
 
 		 128 aa  148  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118399  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1554  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.45 
 
 		 123 aa  147  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0172  hypothetical protein  54.03 
 
 		 125 aa  142  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1839  hypothetical protein  55.12 
 
 		 138 aa  140  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1518  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.12 
 
 		 138 aa  140  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.902517 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0595  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.59 
 
 		 137 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.771439  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1508  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.84 
 
 		 123 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2807  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.67 
 
 		 130 aa  120  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0659632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1520  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.4 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000677002 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1411  putative glyoxalase  44.63 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2270  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.44 
 
 		 127 aa  94  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33899 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4043  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.53 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.776404  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4002  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.53 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0449  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.84 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.857663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.84 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0509  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.84 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3901  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.98 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1826  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.08 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.145544  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2907  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.59 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2501  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.6 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.517764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6709  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.59 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2671  hypothetical protein  35.77 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.283114  normal  0.58691 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7086  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.72 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.678926 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4004  hypothetical protein  37.6 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1191  hypothetical protein  32 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.889775  hitchhiker  0.00000394377 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2538  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.71 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0695  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.43 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.483535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2543  glyoxalase family protein  34.71 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42870  hypothetical protein  31.4 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.948104 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1463  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.03 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1712  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.92 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0222  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.52 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.660505  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0706  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.52 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242399  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0673  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.52 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3600  hypothetical protein  31.4 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.947186  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2796  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3792  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.71 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.500886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.66 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0597  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.03 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0622  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.03 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0170  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.2 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0309396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2787  glyoxalase family protein  31.45 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3388  hypothetical protein  34.15 
 
 		 347 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3399  glyoxalase family protein  34.38 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3031  glyoxalase  29.41 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116954  normal  0.49404 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2678  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.26 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3382  hypothetical protein  33.6 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00775023  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3347  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.6 
 
 		 136 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.725063  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2552  hypothetical protein  33.6 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0285  hypothetical protein  33.6 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1148  hypothetical protein  34.15 
 
 		 300 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.536905  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.4 
 
 		 129 aa  50.8  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.628816  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2011  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.71 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1263  hypothetical protein  32.52 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04802  lactoylglutathione lyase  58.33 
 
 		 38 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4164  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.93 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.648232  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25870  lactoylglutathione lyase family protein  30.4 
 
 		 126 aa  47.4  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3144  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.4 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3064  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.66 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0158866  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0233  glyoxalase  27.19 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1756  glyoxalase family protein  32.58 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1190  glyoxalase family protein  32 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.939066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2706  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.68 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2540  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.68 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2607  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.68 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3635  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.23 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1591  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.26 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1562  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.26 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2788  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.26 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.910627 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3477  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.45 
 
 		 258 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1556  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.26 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0263  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.91 
 
 		 258 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0680  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.76 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3986  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.83 
 
 		 258 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.8 
 
 		 127 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205031  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0578  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.2 
 
 		 127 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.704686  normal  0.313337 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16580  lactoylglutathione lyase family protein  26.96 
 
 		 255 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4018  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.75 
 
 		 263 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0241632 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0880  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.81 
 
 		 122 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0383  glyoxalase  26.09 
 
 		 126 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8842  glyoxalase family protein  29.09 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.141871 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3486  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.4 
 
 		 258 aa  40.8  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506054  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3859  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.96 
 
 		 258 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3990  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.66 
 
 		 260 aa  40.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10929  hypothetical protein  29.6 
 
 		 257 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>