114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4029 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4029  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  265  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118399  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0589  hypothetical protein  61.72 
 
 
126 aa  164  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1387  hypothetical protein  54.69 
 
 
126 aa  152  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.712354  normal  0.0522494 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0172  hypothetical protein  57.81 
 
 
125 aa  150  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1554  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.59 
 
 
123 aa  149  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1937  hypothetical protein  55.91 
 
 
125 aa  148  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36707  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1518  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.23 
 
 
138 aa  147  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.902517 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1839  hypothetical protein  59.23 
 
 
138 aa  147  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3646  hypothetical protein  53.17 
 
 
127 aa  142  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1508  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.03 
 
 
123 aa  139  9e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0595  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.74 
 
 
137 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.771439  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2807  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.04 
 
 
130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0659632  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1520  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.66 
 
 
127 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000677002 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1411  putative glyoxalase  48.03 
 
 
130 aa  110  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2270  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.97 
 
 
127 aa  96.7  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.33899 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4043  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.34 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.776404  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.71 
 
 
121 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0449  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.71 
 
 
121 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.857663  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3901  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.16 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0509  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.71 
 
 
121 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4002  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.52 
 
 
129 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7086  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.43 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.678926 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6709  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.66 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1826  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.58 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.145544  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2538  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.6 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2907  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.84 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2501  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.84 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.517764 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4004  hypothetical protein  34.96 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42870  hypothetical protein  33.33 
 
 
126 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.948104 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0695  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
127 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.483535  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3600  hypothetical protein  32.52 
 
 
126 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.947186  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2671  hypothetical protein  35.54 
 
 
131 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.283114  normal  0.58691 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2543  glyoxalase family protein  32.28 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0222  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.26 
 
 
134 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.660505  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0706  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.26 
 
 
134 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242399  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0673  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.26 
 
 
134 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3792  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.89 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.500886  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4164  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.71 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.648232  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1191  hypothetical protein  32.8 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.889775  hitchhiker  0.00000394377 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0170  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.48 
 
 
136 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0309396  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2678  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.06 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0597  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.26 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1463  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.26 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4457  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.62 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.728285  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3388  hypothetical protein  31.5 
 
 
347 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1263  hypothetical protein  30.71 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0285  hypothetical protein  29.13 
 
 
130 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3347  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.13 
 
 
136 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.725063  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3382  hypothetical protein  29.13 
 
 
130 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00775023  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2552  hypothetical protein  29.13 
 
 
130 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2011  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.68 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0622  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.26 
 
 
136 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594994  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2796  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.89 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0680  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.2 
 
 
124 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3064  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.75 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0158866  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1148  hypothetical protein  30.71 
 
 
300 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.536905  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3433  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35 
 
 
123 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.342021  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0578  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.65 
 
 
127 aa  52.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.704686  normal  0.313337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1712  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
240 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6864  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.45 
 
 
231 aa  52  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.87 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.628816  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2787  glyoxalase family protein  28.68 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3399  glyoxalase family protein  29.32 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3031  glyoxalase  30.16 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116954  normal  0.49404 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0348  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3635  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.03 
 
 
123 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3144  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.31 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1190  glyoxalase family protein  32.28 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.939066  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04802  lactoylglutathione lyase  61.11 
 
 
38 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0880  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.27 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3512  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.15 
 
 
260 aa  45.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3533  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.35 
 
 
259 aa  45.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22560  lactoylglutathione lyase family protein  25.2 
 
 
265 aa  46.2  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.438518  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2765  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.4 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000201247 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0263  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.81 
 
 
258 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0188  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.98 
 
 
264 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6217  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.09 
 
 
263 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.346808 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4175  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.06 
 
 
257 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.06 
 
 
257 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.397521 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.13 
 
 
139 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3986  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.06 
 
 
258 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0159  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.06 
 
 
257 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3990  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.36 
 
 
260 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4600  antigen, putative  29.06 
 
 
260 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3994  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.2 
 
 
120 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.964106 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1756  glyoxalase family protein  31.5 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4018  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.51 
 
 
263 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0241632 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1554  glyoxalase family protein  27.35 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0891  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.56 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.740664  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2540  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.2 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2607  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.2 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2706  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.2 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3443  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.52 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000434489  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5355  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.46 
 
 
265 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0075  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.08 
 
 
116 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0012  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
267 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.688447  normal  0.0527448 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25870  lactoylglutathione lyase family protein  29.37 
 
 
126 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16580  lactoylglutathione lyase family protein  26.05 
 
 
255 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0182  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.06 
 
 
282 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.281476 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1540  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.87 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.620388  normal  0.0602433 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>