119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2907 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_2907  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
131 aa  274  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2501  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  99.24 
 
 
131 aa  273  7e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.517764 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2671  hypothetical protein  89.31 
 
 
131 aa  251  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.283114  normal  0.58691 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2796  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.47 
 
 
123 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.78 
 
 
139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.5 
 
 
121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0449  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.5 
 
 
121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.857663  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0509  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.5 
 
 
121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2538  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
127 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1826  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.5 
 
 
123 aa  107  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.145544  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3901  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.29 
 
 
132 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4004  hypothetical protein  44.54 
 
 
127 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1191  hypothetical protein  40.98 
 
 
122 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.889775  hitchhiker  0.00000394377 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4043  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.9 
 
 
132 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.776404  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0695  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.86 
 
 
127 aa  100  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.483535  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4002  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.9 
 
 
129 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0170  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.54 
 
 
136 aa  98.6  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0309396  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1411  putative glyoxalase  43.59 
 
 
130 aa  97.4  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1263  hypothetical protein  44.54 
 
 
130 aa  97.4  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.7 
 
 
129 aa  96.7  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.628816  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3347  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.7 
 
 
136 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.725063  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3388  hypothetical protein  43.7 
 
 
347 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0285  hypothetical protein  43.7 
 
 
130 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1148  hypothetical protein  43.7 
 
 
300 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.536905  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3382  hypothetical protein  43.7 
 
 
130 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00775023  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2552  hypothetical protein  43.7 
 
 
130 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0597  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.52 
 
 
136 aa  94  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0622  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.52 
 
 
136 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594994  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2270  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.67 
 
 
127 aa  94  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.33899 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3792  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.52 
 
 
136 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.500886  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0222  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.83 
 
 
134 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.660505  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0706  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.83 
 
 
134 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242399  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2678  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.68 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0673  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.83 
 
 
134 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6709  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.68 
 
 
136 aa  91.3  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1712  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.89 
 
 
240 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7086  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.36 
 
 
129 aa  82.8  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.678926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2011  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.1 
 
 
127 aa  81.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3635  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.28 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1937  hypothetical protein  36.59 
 
 
125 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36707  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3600  hypothetical protein  37.82 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.947186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42870  hypothetical protein  36.97 
 
 
126 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.948104 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0172  hypothetical protein  39.83 
 
 
125 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3399  glyoxalase family protein  37.61 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1508  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.34 
 
 
123 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4029  hypothetical protein  38.84 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118399  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0589  hypothetical protein  37.19 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1554  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.48 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2543  glyoxalase family protein  34.17 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0595  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.94 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.771439  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1190  glyoxalase family protein  32.48 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.939066  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1562  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.2 
 
 
127 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1556  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.2 
 
 
127 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1591  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.2 
 
 
127 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2788  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.2 
 
 
127 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.910627 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.2 
 
 
127 aa  61.2  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205031  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4164  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.06 
 
 
120 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.648232  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3646  hypothetical protein  32.76 
 
 
127 aa  60.5  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1756  glyoxalase family protein  32.77 
 
 
129 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2540  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.48 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2607  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.48 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2706  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.48 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1387  hypothetical protein  34.45 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.712354  normal  0.0522494 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3144  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.5 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1520  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.15 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000677002 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3433  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.4 
 
 
123 aa  57.8  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.342021  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1463  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.67 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1518  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.902517 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1839  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3031  glyoxalase  31.06 
 
 
129 aa  54.3  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116954  normal  0.49404 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3064  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.28 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0158866  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2765  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.2 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000201247 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0233  glyoxalase  30.58 
 
 
122 aa  51.6  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3438  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.4 
 
 
131 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2787  glyoxalase family protein  28 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3533  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.86 
 
 
259 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0481  glyoxalase, putative  28.46 
 
 
259 aa  50.1  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681651  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0680  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.58 
 
 
124 aa  50.1  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0678  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.64 
 
 
273 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0421  putative glyoxalase  28.46 
 
 
259 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6864  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.38 
 
 
231 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3512  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.68 
 
 
260 aa  49.7  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22560  lactoylglutathione lyase family protein  35.14 
 
 
265 aa  48.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.438518  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4204  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.66 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.377514  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0818  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.59 
 
 
259 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685405  normal  0.7095 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1602  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.76 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.924243  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2807  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.84 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0659632  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0991  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
133 aa  47.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0138  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.03 
 
 
247 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.516384  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0880  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.46 
 
 
122 aa  47  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1488  glyoxalase  31.03 
 
 
247 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.457468  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2733  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.75 
 
 
253 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7578  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.03 
 
 
127 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.848256  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8594  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.87 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8806  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.05 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0075  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.67 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25870  lactoylglutathione lyase family protein  31.2 
 
 
126 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6117  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.87 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6217  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.07 
 
 
263 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.346808 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0673  hypothetical protein  26.89 
 
 
126 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>