64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0233 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0233  glyoxalase  100 
 
 
122 aa  249  1e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.76 
 
 
121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.345356  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3031  glyoxalase  43.85 
 
 
129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116954  normal  0.49404 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0891  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.67 
 
 
123 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.740664  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25870  lactoylglutathione lyase family protein  38.4 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0383  glyoxalase  34.15 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0880  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.07 
 
 
122 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1463  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.83 
 
 
127 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1921  lactoylglutathione lyase-related protein  37.69 
 
 
125 aa  78.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.316904  normal  0.438437 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1281  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2765  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.68 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000201247 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3011  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0578  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.15 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.704686  normal  0.313337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4457  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.3 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.728285  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3064  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.2 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0158866  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.71 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000650261 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2449  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3438  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.95 
 
 
131 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3646  hypothetical protein  31.86 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0378  hypothetical protein  29.13 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8594  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8806  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
128 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3491  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.09 
 
 
122 aa  52.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1826  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.91 
 
 
123 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.145544  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2501  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.58 
 
 
131 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.517764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6117  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.54 
 
 
128 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2907  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.58 
 
 
131 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0589  hypothetical protein  31.36 
 
 
126 aa  50.8  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1554  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.03 
 
 
123 aa  50.4  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2671  hypothetical protein  28.95 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.283114  normal  0.58691 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1411  putative glyoxalase  30.77 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1508  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.43 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0172  hypothetical protein  29.66 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1540  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.09 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.620388  normal  0.0602433 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3990  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.46 
 
 
260 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1937  hypothetical protein  27.19 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36707  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1764  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.59 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298877  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0170  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.83 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0309396  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1387  hypothetical protein  27.05 
 
 
126 aa  43.9  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.712354  normal  0.0522494 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0182  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.27 
 
 
282 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.281476 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3433  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.89 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.342021  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2538  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.14 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3786  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.36 
 
 
258 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1690  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.85 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.750812  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3443  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.96 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000434489  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1675  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.85 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0208762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2667  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.85 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0361877  normal  0.0155451 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0595  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.13 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.771439  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4750  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.03 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.116089  hitchhiker  0.0000231054 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1712  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0355243  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3986  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.25 
 
 
258 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3477  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.72 
 
 
258 aa  41.6  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 
129 aa  41.6  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.628816  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3859  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.51 
 
 
258 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2795  glyoxalase family protein  30 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3600  hypothetical protein  24.56 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.947186  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4029  hypothetical protein  28.23 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118399  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2807  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.87 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0659632  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.21 
 
 
139 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2733  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.22 
 
 
253 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2839  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.79 
 
 
115 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951673  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4164  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.45 
 
 
120 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.648232  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42870  hypothetical protein  24.56 
 
 
126 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.948104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2011  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.42 
 
 
127 aa  40  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>