152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25870 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_25870  lactoylglutathione lyase family protein  100 
 
 
126 aa  258  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3031  glyoxalase  47.29 
 
 
129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116954  normal  0.49404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0378  hypothetical protein  41.27 
 
 
142 aa  94.7  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2191  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 
121 aa  93.6  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.345356  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3011  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.1 
 
 
146 aa  90.9  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0233  glyoxalase  38.4 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1921  lactoylglutathione lyase-related protein  38.21 
 
 
125 aa  84.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.316904  normal  0.438437 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3064  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.6 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0158866  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1281  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.8 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0383  glyoxalase  34.38 
 
 
126 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2765  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.85 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000201247 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4457  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.728285  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0880  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.43 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0891  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.62 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.740664  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1540  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.52 
 
 
121 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.620388  normal  0.0602433 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1463  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.78 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3646  hypothetical protein  30.77 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3443  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.33 
 
 
124 aa  57  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000434489  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1434  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.83 
 
 
262 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10929  hypothetical protein  33.05 
 
 
257 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2807  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.67 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0659632  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16580  lactoylglutathione lyase family protein  33.04 
 
 
255 aa  54.7  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3438  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.78 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1411  putative glyoxalase  30.17 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4951  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.81 
 
 
280 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.366376 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4018  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.65 
 
 
263 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0241632 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21960  lactoylglutathione lyase family protein  28.57 
 
 
286 aa  53.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1488  glyoxalase  33.33 
 
 
247 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.457468  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6117  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.71 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4587  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.66 
 
 
261 aa  51.6  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2058  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.97 
 
 
256 aa  50.8  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.923308  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3491  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.25 
 
 
122 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8594  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.92 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2733  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.06 
 
 
253 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0348  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.04 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1520  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.1 
 
 
127 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000677002 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0182  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.93 
 
 
282 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.281476 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0138  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.03 
 
 
247 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.516384  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0172  hypothetical protein  26.89 
 
 
125 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0263  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.71 
 
 
258 aa  50.4  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0500  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.05 
 
 
245 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0589  hypothetical protein  30.51 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0578  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.08 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.704686  normal  0.313337 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8806  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.92 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4164  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.52 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.648232  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1624  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.17 
 
 
260 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308195  normal  0.0724042 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1233  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.67 
 
 
253 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3502  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.7 
 
 
255 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4857  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.12 
 
 
263 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.341026  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4623  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.21 
 
 
252 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0432436 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19190  lactoylglutathione lyase  30.47 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3486  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.81 
 
 
258 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506054  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0481  glyoxalase, putative  28.1 
 
 
259 aa  47.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681651  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0421  putative glyoxalase  28.1 
 
 
259 aa  47.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0931  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
259 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.951894  normal  0.87106 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0396  lactoylglutathione lyase  30.65 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789224  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2011  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.93 
 
 
127 aa  47.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0818  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.97 
 
 
259 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685405  normal  0.7095 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1554  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.3 
 
 
123 aa  47.4  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1937  hypothetical protein  30.4 
 
 
125 aa  47.4  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36707  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1826  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.7 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.145544  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4507  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.86 
 
 
262 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal  0.535957 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2755  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.32 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.26842  normal  0.0221573 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1764  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.86 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298877  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0411  lactoylglutathione lyase  29.84 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208299  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4043  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.67 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.776404  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2736  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.51 
 
 
255 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.77414  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0278  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.124848 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0520  lactoylglutathione lyase  28.46 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0107856 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3901  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.83 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1387  hypothetical protein  27.97 
 
 
126 aa  45.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.712354  normal  0.0522494 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2907  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.2 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2501  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.2 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.517764 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1908  glyoxalase I  27.34 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22560  lactoylglutathione lyase family protein  27.83 
 
 
265 aa  44.7  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.438518  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1532  glyoxalase I  27.34 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.178368  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1845  lactoylglutathione lyase  29.84 
 
 
128 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1739  glyoxalase I  27.34 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00795001  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1545  glyoxalase I  27.34 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1605  glyoxalase I  27.34 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2364  lactoylglutathione lyase  30.65 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000749149 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1508  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.96 
 
 
123 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0825  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.04 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.947605  hitchhiker  0.000446101 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0531  lactoylglutathione lyase  28.91 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000101735  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1862  glyoxalase I  26.56 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2270  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.83 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.33899 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01621  glyoxalase I, Ni-dependent  26.56 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00282129  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1989  lactoylglutathione lyase  26.56 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01611  hypothetical protein  26.56 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00318347  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0914  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.6 
 
 
277 aa  44.3  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.590177  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0739  glyoxalase I  28.8 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.871991  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0991  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.2 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4002  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.83 
 
 
129 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1728  glyoxalase I  26.56 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2363  glyoxalase I  26.56 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0314391  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1978  glyoxalase I  26.56 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077498  hitchhiker  0.00100198 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1547  glyoxalase I  26.56 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.726295  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42870  hypothetical protein  30.71 
 
 
126 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.948104 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1843  glyoxalase I  26.56 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.816118  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2671  hypothetical protein  32 
 
 
131 aa  43.5  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.283114  normal  0.58691 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>